本報(bào)訊 (記者胡德榮)上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院和國家人類基因組南方研究中心腫瘤基因組課題組韓澤廣教授,、鄧慶博士與黃健研究員領(lǐng)銜的科研團(tuán)隊(duì),最近首次利用新型大規(guī)模基因組分析技術(shù),,找到肝癌轉(zhuǎn)移關(guān)鍵突變基因,。相關(guān)研究論文于8月26日在線發(fā)表在國際頂尖學(xué)術(shù)刊物《自然·遺傳學(xué)》雜志上。專家認(rèn)為,,該研究結(jié)果將為肝癌診斷,、預(yù)后、治療以及開發(fā)新型治療藥物奠定基礎(chǔ),。
韓澤廣等科研人員與上海生物芯片國家工程研究中心,、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院、無錫市人民醫(yī)院等單位合作,,利用DNA測序技術(shù),,對(duì)乙肝病毒感染相關(guān)的肝癌原發(fā)灶和侵犯肝臟門靜脈轉(zhuǎn)移灶的全部基因組外顯子進(jìn)行比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞存在347個(gè)突變基因,,平均每個(gè)腫瘤樣本有30個(gè)~40個(gè)基因突變,,其中大多數(shù)基因突變是第一次在肝癌樣本中發(fā)現(xiàn),并且在原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶中同時(shí)出現(xiàn),,說明肝癌發(fā)病,、轉(zhuǎn)移與基因突變密切相關(guān),而轉(zhuǎn)移相關(guān)基因在原發(fā)腫瘤中即發(fā)生突變,,而不是在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中發(fā)生,。另外,從堿基突變規(guī)律發(fā)現(xiàn),,突變除受黃曲霉素和內(nèi)源代謝產(chǎn)物影響外,,也可能與植物特定成分(如馬兜鈴酸)和塑料工業(yè)污染物有關(guān)。
為了確定哪個(gè)突變基因在肝癌轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用,,科研人員進(jìn)一步在大量肝癌樣本中,,對(duì)這些突變基因進(jìn)行評(píng)估以及大規(guī)模的功能實(shí)驗(yàn)分析研究。結(jié)果表明,,大多數(shù)基因突變不是關(guān)鍵的,,僅少數(shù)基因突變決定了腫瘤發(fā)病和轉(zhuǎn)移,其中ARID1A,、VCAM1和CDK14等基因突變發(fā)揮關(guān)鍵作用,。ARID1A和VCAM1基因在功能正常時(shí),起抑制腫瘤細(xì)胞作用,,當(dāng)突變發(fā)生導(dǎo)致基因功能喪失或者表達(dá)降低時(shí),,腫瘤細(xì)胞會(huì)出現(xiàn)增殖加快、運(yùn)動(dòng)和侵襲能力增強(qiáng),。目前,,科研人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn),13%的肝癌患者發(fā)生ARID1A基因突變;VCAM1除了突變外,,還在多數(shù)肝癌樣本中表達(dá)下降,。而與細(xì)胞增殖相關(guān)的CDK14基因突變則會(huì)增強(qiáng)該基因功能,導(dǎo)致細(xì)胞生長加快,,促進(jìn)轉(zhuǎn)移,,可能是肝癌治療新靶標(biāo)。
韓澤廣等科研人員與上海生物芯片國家工程研究中心,、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院、無錫市人民醫(yī)院等單位合作,,利用DNA測序技術(shù),,對(duì)乙肝病毒感染相關(guān)的肝癌原發(fā)灶和侵犯肝臟門靜脈轉(zhuǎn)移灶的全部基因組外顯子進(jìn)行比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞存在347個(gè)突變基因,,平均每個(gè)腫瘤樣本有30個(gè)~40個(gè)基因突變,,其中大多數(shù)基因突變是第一次在肝癌樣本中發(fā)現(xiàn),并且在原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶中同時(shí)出現(xiàn),,說明肝癌發(fā)病,、轉(zhuǎn)移與基因突變密切相關(guān),而轉(zhuǎn)移相關(guān)基因在原發(fā)腫瘤中即發(fā)生突變,,而不是在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中發(fā)生,。另外,從堿基突變規(guī)律發(fā)現(xiàn),,突變除受黃曲霉素和內(nèi)源代謝產(chǎn)物影響外,,也可能與植物特定成分(如馬兜鈴酸)和塑料工業(yè)污染物有關(guān)。
為了確定哪個(gè)突變基因在肝癌轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用,,科研人員進(jìn)一步在大量肝癌樣本中,,對(duì)這些突變基因進(jìn)行評(píng)估以及大規(guī)模的功能實(shí)驗(yàn)分析研究。結(jié)果表明,,大多數(shù)基因突變不是關(guān)鍵的,,僅少數(shù)基因突變決定了腫瘤發(fā)病和轉(zhuǎn)移,其中ARID1A,、VCAM1和CDK14等基因突變發(fā)揮關(guān)鍵作用,。ARID1A和VCAM1基因在功能正常時(shí),起抑制腫瘤細(xì)胞作用,,當(dāng)突變發(fā)生導(dǎo)致基因功能喪失或者表達(dá)降低時(shí),,腫瘤細(xì)胞會(huì)出現(xiàn)增殖加快、運(yùn)動(dòng)和侵襲能力增強(qiáng),。目前,,科研人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn),13%的肝癌患者發(fā)生ARID1A基因突變;VCAM1除了突變外,,還在多數(shù)肝癌樣本中表達(dá)下降,。而與細(xì)胞增殖相關(guān)的CDK14基因突變則會(huì)增強(qiáng)該基因功能,導(dǎo)致細(xì)胞生長加快,,促進(jìn)轉(zhuǎn)移,,可能是肝癌治療新靶標(biāo)。