全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)作為定位復雜遺傳性疾病易感基因的一種行之有效的方法而備受關(guān)注,,中國學者利用GWAS已成功獲得了海量的遺傳學數(shù)據(jù),,為揭開人類疾病的發(fā)病機制奠定了堅實的基礎(chǔ)。
中國遺傳學研究 獲國際同行認可
在中國人群中開展的GWAS迅速增長,,中國儼然已經(jīng)成為世界醫(yī)學遺傳學研究領(lǐng)域的重要成員,。首先,作為最大的醫(yī)學資源市場,,中國擁有世界上最龐大的患者群體,,有條件進行大規(guī)模的基因分型研究。第二,,中國目前已積極參與了各項人類基因組工程,,如人類基因組計劃、國際單體圖形計劃和千人基因組計劃,,國際合作促進了世界頂級研究機構(gòu)的人才和技術(shù)交流,,極大地推動了GWAS研究。第三,,中國人群疾病譜正在悄然改變,,如精神類疾病,、腫瘤和高血壓等慢性病急劇增多,更迫切需要利用GWAS等先進的技術(shù)手段,,為常見病防治指明方向,。
GWAS研究論文 占世界總量8.1%
目前,中國科學家廣泛運用GWAS對共28種疾病進行了疾病遺傳易感性的研究,,占國際總研究病種的17.8%,,可分為精神類疾病(如精神分裂癥,、躁郁癥,、癲癇)、腫瘤(如肝癌,、胃癌,、肺癌等)、代謝類疾?。ㄈ?型糖尿病,、多囊卵巢綜合征、骨質(zhì)疏松癥),、心血管疾?。ㄈ绻谛牟 ⒏哐獕翰,。?、自身免疫性疾病(如Graves病,、IgA腎病和強直性脊柱炎),、眼科疾病(如高度近視),、皮膚復雜性疾?。ㄈ玢y屑病、麻風病,、白癜風,、特應(yīng)性皮炎)等,共發(fā)表超過40篇GWAS研究的文章,,占國際發(fā)表論文總數(shù)的8.1%,,其中影響因子在30以上的有27篇。目前共報道了超過120個疾病的易感位點/基因,。這些成果離不開國家“863”計劃在研究經(jīng)費方面給予的大力支持。
Graves病是一種以甲狀腺功能亢進和出現(xiàn)促甲狀腺激素受體抗體為特征的自身免疫性疾病,。中國人群GWAS研究在Graves病患者中共發(fā)現(xiàn)了6個易感基因位點,,使人們對其遺傳學發(fā)病機制有了更進一步的認識,,發(fā)現(xiàn)的易感位點還可以作為未來開展疾病基因診療的靶標。中國鼻咽癌GWAS發(fā)現(xiàn)疾病4個易感基因位點,,提示了轉(zhuǎn)化生物因子β和c-Jun N-端激酶信號通路在鼻咽癌發(fā)病過程中的重要作用,。
中國GWAS研究大大拓寬了人們對常見疾病在遺傳學發(fā)病機理方面的理解:篩選得到的不同種群間(包含中國種群)共有易感位點可能在疾病發(fā)病中發(fā)揮更為重要的作用;而不同種群的GWAS研究則揭示了各自的特異性易感位點,,強調(diào)了不同種群間的遺傳異質(zhì)性,,對于提示地域及環(huán)境因素影響疾病的發(fā)生和發(fā)展有重要的研究意義。對中國人群開展更多,、更大規(guī)模的GWAS研究以及在不同種群間開展平行GWAS研究的比較是至關(guān)重要的,。
未來努力方向 易感基因功能學研究
在GWAS取得巨大成功的同時,也不能忽略準確鑒定疾病真正致病變異的問題,,這就要求投入更多的精力對疾病易感基因位點進行精細定位和功能學研究,。當前復雜疾病GWAS研究結(jié)果僅能解釋小部分的遺傳發(fā)病風險,在已有的GWAS數(shù)據(jù)中仍然存在很多有價值的信息,,尚需采用新的分析方法,,結(jié)合基因組學、表觀遺傳學,、轉(zhuǎn)錄組學,、蛋白質(zhì)組學和代謝組學等深入挖掘,幫助人們深入理解疾病的發(fā)病機理,。雖然中國在GWAS研究領(lǐng)域起步較晚,,但近幾年突飛猛進的發(fā)展已緊跟世界發(fā)展步伐,并將在后GWAS時代中扮演關(guān)鍵角色,。(本報記者馮立中整理)