來自美國耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥理學(xué)系和中國吉林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的研究人員共同公布了一種扁菱形蛋白酶家族(rhomboid protease family)膜內(nèi)蛋白酶的結(jié)晶結(jié)構(gòu),這一結(jié)構(gòu)顯示了Rhomboid如何利用膜外水分子來解理嵌在膜中的蛋白基質(zhì),,這一研究成果公布在最新一期(11月9日)《Nature》雜志上,。
參予研究的包括畢業(yè)于南京大學(xué),現(xiàn)任耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院助理教授的哈亞(Ya Ha,,音譯),吉林大學(xué)生科院張應(yīng)玖教授(Yingjiu Zhang)和王勇成(Yongcheng Wang,,音譯)博士,。
大腸桿菌GlpG是一種屬于普遍扁菱形蛋白酶家族(rhomboid protease family)的完整膜蛋白——扁菱形蛋白酶家族,比如site-2 protease (S2P) 和-secretase都是獨(dú)一無二的切除其它膜蛋白穿膜結(jié)構(gòu)域的蛋白酶,。由于許多信號蛋白都要經(jīng)過膜內(nèi)蛋白水解才能激活,,或者轉(zhuǎn)化成溶解性差,淀粉樣多肽片段,,因此這一蛋白家族意義重大,。在這篇文章中,研究人員獲得了GlpG核心結(jié)構(gòu)的2.1Aring; resolution結(jié)晶結(jié)構(gòu),,并從這一結(jié)構(gòu)中得到了GlpG相關(guān)的詳細(xì)信息,,為進(jìn)一步研究分析理解這種蛋白催化作用提供了重要資料。
研究人員發(fā)現(xiàn)GlpG的結(jié)構(gòu)包含了一個(gè)六穿膜結(jié)構(gòu)片段,,而且蛋白催化中心包含了一個(gè)Ser–His二聚體的蛋白質(zhì)殘基,,另外在蛋白內(nèi)部膜表面以下有幾個(gè)水分子結(jié)構(gòu)。這個(gè)假定的活性位點(diǎn)通過一個(gè)側(cè)面向脂質(zhì)層的大V形('V-shaped')開口通向外部,,但出口處有一半淹沒狀(half-submerged)環(huán)行結(jié)構(gòu)封閉住,。
這些研究結(jié)果表明,對于膜內(nèi)蛋白水解來說,,在膜雙分子層的疏水環(huán)境中會發(fā)生多肽的斷裂,,而且這些晶體結(jié)構(gòu)也說明GlpG利用了一種gating機(jī)制來調(diào)控底物與疏水活性位點(diǎn)的接觸。
張應(yīng)玖簡介
性 別 : 女
出生年月 : 1962.2
民 族 : 漢
籍 貫 : 吉林 . 長春
畢業(yè)學(xué)校 : 吉林大學(xué)
專 業(yè) : 生物化學(xué)與分子生物學(xué)
最終學(xué)歷 : 博士
最終學(xué)位 :博士
職 稱 :教授
電子郵件 : [email protected]
通訊地址 : 解放大路 2519 號,,吉林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 , 130023
參加學(xué)術(shù)活動(dòng)情況 :
1. “艾滋病病毒巨分子顆?;鞍椎谋磉_(dá)調(diào)控研究”
2. 國家杰出青年基金“ HIV 結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)研究”
學(xué)術(shù)成就 :2000-2005 年間 國內(nèi)外發(fā)表研究論文 30 余篇, 其中在 JVM ,、BBA,、Biochem等發(fā)表SCI收錄研究論文數(shù)篇