用藍(lán)色基因抵御禽流感,？ http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=29113
IBM將聚全球電腦用戶之力推動(dòng)艾滋藥物研發(fā) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=28772
IBM與在港首個(gè)伙伴香港大學(xué)合力破解科學(xué)難題 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=27014
借助“藍(lán)色基因”IBM致力挺進(jìn)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=26680
“藍(lán)色天空”研究計(jì)劃搶占科技高地 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=26087
IBM超級(jí)計(jì)算機(jī)支持尖端納米技術(shù)和環(huán)境研究 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=24251
IBM藍(lán)色基因超級(jí)計(jì)算機(jī)可模擬人腦工作 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=24098
IBM推出醫(yī)療與生命科學(xué)行業(yè)轉(zhuǎn)型六項(xiàng)重大舉措 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=23259
IBM攜手長(zhǎng)春藤名校 向癌癥“開(kāi)刀” http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=19585
“IBM網(wǎng)格”：全球福利,？世紀(jì)病毒,？ http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=19537
超級(jí)計(jì)算機(jī)頂萬(wàn)人,，研制新藥15年減至14個(gè)月 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=19554
IBM呼吁全球網(wǎng)民利用閑置電腦破解絕癥基因 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=18874
IBM向日本銷(xiāo)售Blue Gene/L 用于蛋白質(zhì)研究 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=17221
紐約大學(xué)采用IBM刀片式服務(wù)器研究蛋白質(zhì) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=13381
近日,，紐約州立大學(xué)設(shè)在布法羅的生物信息卓越研究中心（Center of Excellence in Bioinformatics）宣布,，采用IBM提供的超級(jí)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)提高科研計(jì)算能力,。該系統(tǒng)由266片BladeCenter HS20刀片服務(wù)器集群和7臺(tái)x 345服務(wù)器組成,，并運(yùn)行Red Hat Linux 9.0操作系統(tǒng),。這一系統(tǒng)提供了每秒鐘1.32萬(wàn)億次浮點(diǎn)運(yùn)算的最高性能，幫助科學(xué)家們提高了研究效率。通過(guò)易于使用的系統(tǒng)管理工具,，新的超級(jí)計(jì)算系統(tǒng)減少了研究中心的系統(tǒng)宕機(jī)時(shí)間,，降低了IT管理成本并改善了資源的分配。
紐約州立大學(xué)的生物信息卓越研究中心主要通過(guò)在分子水平上進(jìn)行生物數(shù)據(jù)建模的高性能計(jì)算技術(shù),，來(lái)進(jìn)行基因組,、蛋白質(zhì)、生物成像和藥物科學(xué)方面的研究,。研究中心管理層希望提高中心的計(jì)算速度,，增加存儲(chǔ)容量并提高系統(tǒng)的可靠性。他們希望能夠找到一家可以提供高性?xún)r(jià)比的超級(jí)計(jì)算解決方案的供應(yīng)商,，并要求它在提供優(yōu)異支持和可靠系統(tǒng)集成方面擁有良好聲譽(yù),。
中心主任Jeffrey Skolnick教授和他的評(píng)估團(tuán)隊(duì)向8家供應(yīng)商征求方案，其中包括IBM,、Sun,、Dell和HP。雖然中心的預(yù)算有限,，但關(guān)注的并不僅僅是成本問(wèn)題,，可靠性和供應(yīng)商的響應(yīng)速度同樣也是中心考慮的重要事項(xiàng)。Skolnick教授解釋說(shuō)：“我們需要一家能夠負(fù)責(zé)修復(fù)任何集群故障的供應(yīng)商,。IBM為我們提供了單點(diǎn)聯(lián)絡(luò)并實(shí)現(xiàn)了他們的承諾,。”
在經(jīng)過(guò)對(duì)多家供應(yīng)商進(jìn)行評(píng)估，以及廣泛的基準(zhǔn)測(cè)試和檢測(cè)之后,，中心管理層選擇了IBM提供的方案,，由266個(gè)BladeCenter HS20存儲(chǔ)服務(wù)器組成的集群，在它之上運(yùn)行Red Hat Linux操作系統(tǒng),。這一解決方案在測(cè)試期間的完美運(yùn)行是IBM從競(jìng)爭(zhēng)中脫穎而出的主要原因,。IBM在3周內(nèi)安裝了一個(gè)測(cè)試系統(tǒng)并投入運(yùn)行。測(cè)試系統(tǒng)包括7臺(tái)x系列345服務(wù)器,，連接到5TB的存儲(chǔ)系統(tǒng),，由一個(gè)通用并行文件系統(tǒng)和Extreme集群管理工具箱（xCAT）系統(tǒng)管理軟件支持。
新的IBM超級(jí)計(jì)算機(jī)集群的最高性能超過(guò)了每秒鐘1.32萬(wàn)億次浮點(diǎn)運(yùn)算,，能夠可靠地處理中心內(nèi)部開(kāi)發(fā)的各種應(yīng)用和密集計(jì)算,。新系統(tǒng)的速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)原來(lái)的系統(tǒng)。Skolnick 教授表示：“IBM的超級(jí)計(jì)算機(jī)提供了我們大幅改進(jìn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)研究所需要的性能,?？晒芾硇缘娘@著提高和基礎(chǔ)設(shè)施的簡(jiǎn)化允許我們將工作重點(diǎn)放在尋找致命疾病的病因和開(kāi)發(fā)治療這些疾病的新藥物上。”
自這臺(tái)IBM超級(jí)計(jì)算機(jī)完成部署以來(lái),，中心系統(tǒng)的故障次數(shù)減少了,，使得科學(xué)家們能夠進(jìn)行更多的計(jì)算和可視化建模,。另外，這一IBM超級(jí)計(jì)算機(jī)還簡(jiǎn)化了IT系統(tǒng)的支持工作,。以前,，當(dāng)一個(gè)硬盤(pán)驅(qū)動(dòng)器發(fā)生故障時(shí)，為對(duì)這一故障進(jìn)行診斷,，中心需要檢查大量機(jī)架上的紅燈指示,，或?qū)⒁粋€(gè)監(jiān)視器插入到2000個(gè)節(jié)點(diǎn),，并且一次只能插入一個(gè)節(jié)點(diǎn)中,，顯然，這是一項(xiàng)令人沮喪和費(fèi)時(shí)的任務(wù),。利用內(nèi)置的BladeCenter管理工具,，IT人員可以使用系統(tǒng)軟件來(lái)診斷故障并對(duì)集群進(jìn)行遠(yuǎn)程管理，從而減少宕機(jī)時(shí)間和提高IT效率,。Skolnick教授表示：“由于集群更多的時(shí)間可以正常運(yùn)行,，科學(xué)家們?cè)谕瑯拥臅r(shí)間內(nèi)可以完成更多的科研任務(wù)。”
IBM BladeCenter集群所消耗的能源和散熱大大少于以前的系統(tǒng),，幫助中心降低了運(yùn)營(yíng)成本,。在占地空間受到限制的情況下，刀片配置允許在同樣大小的區(qū)域內(nèi)部署更多的服務(wù)器,，同時(shí)還可以簡(jiǎn)化系統(tǒng)配置并預(yù)留增長(zhǎng)的空間,。Skolnick教授總結(jié)到道：“目前看來(lái)，我希望我們不久將會(huì)再次進(jìn)行擴(kuò)展,，我斷定我們將會(huì)繼續(xù)采用BladeCenter系統(tǒng)來(lái)進(jìn)行擴(kuò)展,。”
