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IBM將聚全球電腦用戶之力推動艾滋藥物研發(fā) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=28772
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借助“藍(lán)色基因”IBM致力挺進(jìn)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=26680
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IBM藍(lán)色基因超級計(jì)算機(jī)可模擬人腦工作 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=24098
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IBM呼吁全球網(wǎng)民利用閑置電腦破解絕癥基因 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=18874
IBM向日本銷售Blue Gene/L 用于蛋白質(zhì)研究 http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=17221
紐約大學(xué)采用IBM刀片式服務(wù)器研究蛋白質(zhì) http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=13381
近日,，紐約州立大學(xué)設(shè)在布法羅的生物信息卓越研究中心（Center of Excellence in Bioinformatics）宣布,，采用IBM提供的超級計(jì)算機(jī)系統(tǒng)提高科研計(jì)算能力。該系統(tǒng)由266片BladeCenter HS20刀片服務(wù)器集群和7臺x 345服務(wù)器組成,，并運(yùn)行Red Hat Linux 9.0操作系統(tǒng),。這一系統(tǒng)提供了每秒鐘1.32萬億次浮點(diǎn)運(yùn)算的最高性能，幫助科學(xué)家們提高了研究效率,。通過易于使用的系統(tǒng)管理工具,，新的超級計(jì)算系統(tǒng)減少了研究中心的系統(tǒng)宕機(jī)時(shí)間，降低了IT管理成本并改善了資源的分配,。
紐約州立大學(xué)的生物信息卓越研究中心主要通過在分子水平上進(jìn)行生物數(shù)據(jù)建模的高性能計(jì)算技術(shù),，來進(jìn)行基因組、蛋白質(zhì),、生物成像和藥物科學(xué)方面的研究,。研究中心管理層希望提高中心的計(jì)算速度，增加存儲容量并提高系統(tǒng)的可靠性,。他們希望能夠找到一家可以提供高性價(jià)比的超級計(jì)算解決方案的供應(yīng)商,，并要求它在提供優(yōu)異支持和可靠系統(tǒng)集成方面擁有良好聲譽(yù),。
中心主任Jeffrey Skolnick教授和他的評估團(tuán)隊(duì)向8家供應(yīng)商征求方案,，其中包括IBM、Sun,、Dell和HP,。雖然中心的預(yù)算有限，但關(guān)注的并不僅僅是成本問題，可靠性和供應(yīng)商的響應(yīng)速度同樣也是中心考慮的重要事項(xiàng),。Skolnick教授解釋說：“我們需要一家能夠負(fù)責(zé)修復(fù)任何集群故障的供應(yīng)商,。IBM為我們提供了單點(diǎn)聯(lián)絡(luò)并實(shí)現(xiàn)了他們的承諾。”
在經(jīng)過對多家供應(yīng)商進(jìn)行評估,，以及廣泛的基準(zhǔn)測試和檢測之后,，中心管理層選擇了IBM提供的方案，由266個(gè)BladeCenter HS20存儲服務(wù)器組成的集群,，在它之上運(yùn)行Red Hat Linux操作系統(tǒng),。這一解決方案在測試期間的完美運(yùn)行是IBM從競爭中脫穎而出的主要原因。IBM在3周內(nèi)安裝了一個(gè)測試系統(tǒng)并投入運(yùn)行,。測試系統(tǒng)包括7臺x系列345服務(wù)器,，連接到5TB的存儲系統(tǒng)，由一個(gè)通用并行文件系統(tǒng)和Extreme集群管理工具箱（xCAT）系統(tǒng)管理軟件支持,。
新的IBM超級計(jì)算機(jī)集群的最高性能超過了每秒鐘1.32萬億次浮點(diǎn)運(yùn)算,，能夠可靠地處理中心內(nèi)部開發(fā)的各種應(yīng)用和密集計(jì)算。新系統(tǒng)的速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過原來的系統(tǒng),。Skolnick 教授表示：“IBM的超級計(jì)算機(jī)提供了我們大幅改進(jìn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測研究所需要的性能,。可管理性的顯著提高和基礎(chǔ)設(shè)施的簡化允許我們將工作重點(diǎn)放在尋找致命疾病的病因和開發(fā)治療這些疾病的新藥物上,。”
自這臺IBM超級計(jì)算機(jī)完成部署以來,，中心系統(tǒng)的故障次數(shù)減少了，使得科學(xué)家們能夠進(jìn)行更多的計(jì)算和可視化建模,。另外,，這一IBM超級計(jì)算機(jī)還簡化了IT系統(tǒng)的支持工作。以前,，當(dāng)一個(gè)硬盤驅(qū)動器發(fā)生故障時(shí),，為對這一故障進(jìn)行診斷，中心需要檢查大量機(jī)架上的紅燈指示,，或?qū)⒁粋€(gè)監(jiān)視器插入到2000個(gè)節(jié)點(diǎn),，并且一次只能插入一個(gè)節(jié)點(diǎn)中，顯然,，這是一項(xiàng)令人沮喪和費(fèi)時(shí)的任務(wù),。利用內(nèi)置的BladeCenter管理工具，IT人員可以使用系統(tǒng)軟件來診斷故障并對集群進(jìn)行遠(yuǎn)程管理,，從而減少宕機(jī)時(shí)間和提高IT效率,。Skolnick教授表示：“由于集群更多的時(shí)間可以正常運(yùn)行，科學(xué)家們在同樣的時(shí)間內(nèi)可以完成更多的科研任務(wù),。”
IBM BladeCenter集群所消耗的能源和散熱大大少于以前的系統(tǒng),，幫助中心降低了運(yùn)營成本,。在占地空間受到限制的情況下，刀片配置允許在同樣大小的區(qū)域內(nèi)部署更多的服務(wù)器,，同時(shí)還可以簡化系統(tǒng)配置并預(yù)留增長的空間,。Skolnick教授總結(jié)到道：“目前看來，我希望我們不久將會再次進(jìn)行擴(kuò)展,，我斷定我們將會繼續(xù)采用BladeCenter系統(tǒng)來進(jìn)行擴(kuò)展,。”
