微生物學(xué)報(bào)Acta Microbiologica Sinica
48(9):1208~1213;4 September 2008
深海多環(huán)芳烴降解菌新鞘氨醇桿菌H25的降解特性及降解基因
袁軍1,2,,賴(lài)其良2,鄭天凌1,邵宗澤2*
(1廈門(mén)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,,廈門(mén) 361005)
(2國(guó)家海洋局第三海洋研究所,,海洋生物遺傳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,,廈門(mén) 361005)
摘要:【目的】為了從深海環(huán)境中篩選新的多環(huán)芳烴降解菌,,了解其降解基因及降解特性。【方法】以原油作為碳源從印度洋深海海水樣品中富集篩選出降解能力較強(qiáng)的多環(huán)芳烴降解菌,,并根據(jù)已報(bào)道的相關(guān)菌屬的多環(huán)芳烴起始雙加氧酶大亞基序列及側(cè)翼序列設(shè)計(jì)兼并引物進(jìn)行擴(kuò)增,。【結(jié)果】獲得了1株能夠高效降解原油,、柴油及多種多環(huán)芳烴的菌株H25,。經(jīng)16S rDNA序列系統(tǒng)發(fā)育分析表明它屬于新鞘氨醇桿菌屬(Novosphingobium)(96%)。并從該菌株中擴(kuò)增獲得2條相似度為91.0%雙加氧酶基因片段,。2條序列在NCBI上Blastn分析表明均與菌株N. aromaticivorans DSM12444T的降解質(zhì)粒pNL1上的雙加氧酶大亞基具有最高相似度,,分別為99.6%和91.0%。根據(jù)pNL1上的雙加氧酶序列設(shè)計(jì)引物獲得了包含H25雙加氧酶大亞基及上下游序列的2個(gè)基因片段H25Ⅰ(2.9kb)和 H25Ⅱ(4.5kb),。另外,,單碳降解實(shí)驗(yàn)表明H25對(duì)聯(lián)苯、2-甲基萘,、2,,6-二甲基萘、菲,、二苯并噻吩,、二苯并呋喃等均有較好的降解能力?!窘Y(jié)論】H25菌株是Novosphingobium屬可能的新種,。深海細(xì)菌在大洋環(huán)境多環(huán)芳烴污染的自然凈化中起到一定作用,并在環(huán)境生物修復(fù)中有較大的應(yīng)用前景,。
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