微生物學報Acta Microbiologica Sinica
48(9):1208~1213;4 September 2008
深海多環(huán)芳烴降解菌新鞘氨醇桿菌H25的降解特性及降解基因
袁軍1,2,賴其良2,,鄭天凌1,,邵宗澤2*
(1廈門大學生命科學學院,廈門 361005)
(2國家海洋局第三海洋研究所,,海洋生物遺傳重點實驗室,,廈門 361005)
摘要:【目的】為了從深海環(huán)境中篩選新的多環(huán)芳烴降解菌,了解其降解基因及降解特性,?!痉椒ā恳栽妥鳛樘荚磸挠《妊笊詈:K畼悠分懈患Y選出降解能力較強的多環(huán)芳烴降解菌,并根據已報道的相關菌屬的多環(huán)芳烴起始雙加氧酶大亞基序列及側翼序列設計兼并引物進行擴增,?!窘Y果】獲得了1株能夠高效降解原油、柴油及多種多環(huán)芳烴的菌株H25,。經16S rDNA序列系統(tǒng)發(fā)育分析表明它屬于新鞘氨醇桿菌屬(Novosphingobium)(96%),。并從該菌株中擴增獲得2條相似度為91.0%雙加氧酶基因片段。2條序列在NCBI上Blastn分析表明均與菌株N. aromaticivorans DSM12444T的降解質粒pNL1上的雙加氧酶大亞基具有最高相似度,,分別為99.6%和91.0%,。根據pNL1上的雙加氧酶序列設計引物獲得了包含H25雙加氧酶大亞基及上下游序列的2個基因片段H25Ⅰ(2.9kb)和 H25Ⅱ(4.5kb)。另外,,單碳降解實驗表明H25對聯苯,、2-甲基萘、2,,6-二甲基萘,、菲、二苯并噻吩,、二苯并呋喃等均有較好的降解能力,。【結論】H25菌株是Novosphingobium屬可能的新種,。深海細菌在大洋環(huán)境多環(huán)芳烴污染的自然凈化中起到一定作用,,并在環(huán)境生物修復中有較大的應用前景。
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