本報訊 (通訊員王 燕 記者孫 夢)由中國科學院微生物研究所、中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院,、首都醫(yī)科大學附屬北京地壇醫(yī)院等單位科研人員合作開展的埃博拉病毒宿主內進化研究取得重大突破,。該研究首次系統地揭示了埃博拉病毒在宿主內的進化模式,重新闡明了病毒基因中重要變異位點在“病毒—宿主”相互影響中的作用,,為抗病毒藥物研發(fā)設計藥物靶標提供了新依據,。該研究論文近日在線發(fā)表在《自然·微生物學》雜志上。
該論文并列第一作者,、首都醫(yī)科大學附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所陳晨博士介紹,,研究團隊采用擴增子深度測序,并為此開發(fā)了一套全新的生物信息學分析流程,,通過對135個樣本的測定,,第一次發(fā)現了埃博拉病毒在宿主內進化過程中曾經產生的710個單核苷酸變異位點。
“如果說人體內有10000個埃博拉病毒,,運用傳統的分析研究方法,,只有當體內6000個甚至8000個病毒發(fā)生變化時才能監(jiān)測到病毒變化,而通過此次設計的生物信息學分析流程,,只要人體內2個~5個病毒發(fā)生變化就能監(jiān)測到,。”陳晨介紹,借助方法學的突破,,可以在臨床上更早,、更精準地發(fā)現病毒變異,為后期用藥提供指導,。同時,,研究團隊還發(fā)現,病毒VP40基因受到了強烈的負選擇,,這為抗病毒藥物設計提供了新靶點,。
中國科學院微生物研究所劉文軍研究員認為,本研究“從個體內種群變異這一嶄新角度,解讀了病毒的進化規(guī)律,,是宿主內進化這一病毒學前沿領域的重大突破”,。
據介紹,在公共衛(wèi)生領域,,該研究可為埃博拉疫情暴發(fā)提供評估依據,;在臨床研究方面,高通量檢測技術的快速普及,,可推動臨床新發(fā)傳染病控制和傳染病精準用藥,。
該論文并列第一作者,、首都醫(yī)科大學附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所陳晨博士介紹,,研究團隊采用擴增子深度測序,并為此開發(fā)了一套全新的生物信息學分析流程,,通過對135個樣本的測定,,第一次發(fā)現了埃博拉病毒在宿主內進化過程中曾經產生的710個單核苷酸變異位點。
“如果說人體內有10000個埃博拉病毒,,運用傳統的分析研究方法,,只有當體內6000個甚至8000個病毒發(fā)生變化時才能監(jiān)測到病毒變化,而通過此次設計的生物信息學分析流程,,只要人體內2個~5個病毒發(fā)生變化就能監(jiān)測到,。”陳晨介紹,借助方法學的突破,,可以在臨床上更早,、更精準地發(fā)現病毒變異,為后期用藥提供指導,。同時,,研究團隊還發(fā)現,病毒VP40基因受到了強烈的負選擇,,這為抗病毒藥物設計提供了新靶點,。
中國科學院微生物研究所劉文軍研究員認為,本研究“從個體內種群變異這一嶄新角度,解讀了病毒的進化規(guī)律,,是宿主內進化這一病毒學前沿領域的重大突破”,。
據介紹,在公共衛(wèi)生領域,,該研究可為埃博拉疫情暴發(fā)提供評估依據,;在臨床研究方面,高通量檢測技術的快速普及,,可推動臨床新發(fā)傳染病控制和傳染病精準用藥,。