1.醫(yī)院檔案管理格局較為混亂
目前,，我國(guó)大多數(shù)醫(yī)療部門的檔案管理基本都是多部門管理檔案的格局。醫(yī)院的綜合檔案室一般只管理一些文書(shū)檔案、科技檔案和財(cái)務(wù)檔案等,，隸屬行政辦公室管理。而醫(yī)療文書(shū)檔案以及各種檢查影像等又分別隸屬于其他醫(yī)務(wù)部門進(jìn)行日常管理,。而由于這些管理部門所采用的管理方式不同,，其在管理職責(zé)上也不明確，沒(méi)有納入醫(yī)院的綜合目標(biāo)管理的考核中,，這種多頭管理,，各有政策的現(xiàn)象，在很大程度上造成了管理標(biāo)準(zhǔn)化的難以進(jìn)行,。

2.醫(yī)院檔案信息化建設(shè)重視程度不夠
隨著互聯(lián)網(wǎng)的廣泛應(yīng)用和發(fā)展,，計(jì)算機(jī)的應(yīng)用已經(jīng)成為醫(yī)院日常經(jīng)營(yíng)和發(fā)展不可缺少的重要部分，從最簡(jiǎn)單的管理信息系統(tǒng)和財(cái)務(wù)系統(tǒng)到完善的醫(yī)院信息系統(tǒng),、放射科信息系統(tǒng),、影像存檔和通訊系統(tǒng)、實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)以及局域網(wǎng)管理和辦公自動(dòng)化等,，都已經(jīng)開(kāi)始在醫(yī)院中使用并運(yùn)行,。但仍存在一些領(lǐng)導(dǎo)對(duì)檔案信息化建設(shè)的作用和迫切性的認(rèn)識(shí)不夠，導(dǎo)致醫(yī)院的信息化建設(shè)進(jìn)程中未沒(méi)有將檔案信息化管理納入工作的重點(diǎn),，對(duì)檔案信息化建設(shè)的重視程度不夠,。
       
3.檔案管理軟件系統(tǒng)開(kāi)發(fā)相對(duì)落后
目前，我國(guó)關(guān)于檔案管理軟件方面的開(kāi)發(fā)速度和水平還明顯落后于計(jì)算機(jī)硬件技術(shù)的發(fā)展,，尤其是在醫(yī)院檔案管理軟件方面顯得更為欠缺,。隨著醫(yī)療檔案數(shù)量和種類的快速增長(zhǎng)，以及對(duì)檔案信息化的利用需求的不斷增加,，單版機(jī)計(jì)算機(jī)檔案管理已經(jīng)無(wú)法適應(yīng)當(dāng)前形勢(shì)的發(fā)展,，缺乏可兼容性和可擴(kuò)張性,，急需升級(jí)和更新。

4.檔案專業(yè)人員專業(yè)素質(zhì)有待提高
目前醫(yī)院現(xiàn)有的檔案管理人員的知識(shí)結(jié)構(gòu)比較單一,，尤其是在計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的應(yīng)用能力方面的技術(shù)水平較低,，專業(yè)知識(shí)匱乏。缺乏專業(yè)的檔案信息管理人員,，員工工作的主動(dòng)性和創(chuàng)新性不夠,，不符合現(xiàn)代化醫(yī)療行業(yè)對(duì)檔案管理的高要求。