近日來自南京醫(yī)科大學(xué)、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院,、上海交通大學(xué),、華中科技大學(xué)、復(fù)旦大學(xué),、中國醫(yī)科大學(xué),、廣州醫(yī)學(xué)院等研究機(jī)構(gòu)的科研人員通過全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)，在中國漢族人群中鑒定出了與肺癌相關(guān)的兩個新位點(diǎn),。這一研究成果在線刊登在6月3日的《自然—遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上,。
領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是南京醫(yī)科大學(xué)特聘教授、公共衛(wèi)生學(xué)院院長沈洪兵,，其早年畢業(yè)于南京醫(yī)學(xué)院衛(wèi)生系,，后曾作為高級訪問學(xué)者赴美國德克薩斯大學(xué)安德森癌癥中心流行病學(xué)進(jìn)行腫瘤分子流行病學(xué)研究。近年來主要的研究領(lǐng)域?yàn)槟[瘤,、糖尿病,、高血壓等慢性病的流行病學(xué)和分子流行病學(xué)研究，并在腫瘤的早期診斷,、遺傳易感性和復(fù)發(fā),、預(yù)后的分子標(biāo)志等方面取得了較突出的成績，已發(fā)表SCI論文150余篇,，包括腫瘤學(xué)一線期刊J Clin Oncol,、J Clin Invest,、Cancer Res等。
肺癌是世界范圍內(nèi)最常見的癌癥,，屬于多基因疾病,，即多個基因的變異共同參與發(fā)病。研究表明攜帶基因變異的個體比非攜帶者具有更高的患病風(fēng)險性,，故將這些基因稱為“易感基因”,。吸煙是肺癌的主要危險因素，但吸煙人群中有80%以上的個體不會罹患肺癌,，而非吸煙者中仍有10-15%的肺癌患者,，說明個體對肺癌的遺傳易感性存在差異。目前國際人類基因組計(jì)劃 (human genome project, HGP)的測序完成和單核苷酸多態(tài)（single nucleotide polymorphism, SNP）的單體型圖譜構(gòu)建完成,，為肺癌遺傳易感性的研究提供了大量的數(shù)據(jù)支持,，同時經(jīng)濟(jì)高效的高通量基因分型技術(shù)在一個反應(yīng)內(nèi)可以同時檢測上千個SNPs，使得在全基因組范圍內(nèi)篩選與肺癌相關(guān)的SNPs成為可能,。
在這篇文章中,，研究人員首先對5408名受試者(其中包括2331名肺癌患者，以及3077名未患該病的對照個體)進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析,。在隨后的研究中進(jìn)一步對另一組12722名受試者（其中包括6313名肺癌患者,，以及6409名對照個體）進(jìn)行了檢測，他們鑒定出了4個與肺癌相關(guān)聯(lián)的風(fēng)險位點(diǎn),，其中13q12.12 和22q12.2為在漢族人群中發(fā)現(xiàn)的新的風(fēng)險位點(diǎn),。
這一研究發(fā)現(xiàn)為我國今年肺癌研究領(lǐng)域取得的重要成果之一，它將幫助科學(xué)家們更深入地了解漢族人群肺癌發(fā)生的分子機(jī)制,，探索肺癌風(fēng)險預(yù)測,，并為未來肺癌的診斷、治療,、新藥研發(fā)提供了新的靶點(diǎn),。（生物谷Bioon.com）
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Nature Genetics DOI： doi:10.1038/ng.875
A genome-wide association study identifies two new lung cancer susceptibility loci at 13q12.12 and 22q12.2 in Han Chinese
Zhibin Hu; Chen Wu; Yongyong Shi; Huan Guo; Xueying Zhao; Zhihua Yin; Lei Yang; Juncheng Dai; Lingmin Hu; Wen Tan; Zhiqiang Li; Qifei Deng; Jiucun Wang; Wei Wu; Guangfu Jin; Yue Jiang; Dianke Yu; Guoquan Zhou; Hongyan Chen; Peng Guan; Yijiang Chen; Yongqian Shu; Lin Xu; Xiangyang Liu; Li Liu; Ping Xu; Baohui Han; Chunxue Bai; Yuxia Zhao; Haibo Zhang; Ying Yan; Hongxia Ma; Jiaping Chen; Mingjie Chu; Feng Lu; Zhengdong Zhang; Feng Chen; Xinru Wang; Li Jin; Jiachun Lu; Baosen Zhou; Daru Lu; Tangchu
Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. To identify genetic factors that modify the risk of lung cancer in individuals of Chinese ancestry, we performed a genome-wide association scan in 5,408 subjects (2,331 individuals with lung cancer (cases) and 3,077 controls) followed by a two-stage validation among 12,722 subjects (6,313 cases and 6,409 controls). The combined analyses identified six well-replicated SNPs with independent effects and significant lung cancer associations (P < 5.0 × 10?8) located in TP63 (rs4488809 at 3q28, P = 7.2 × 10?26), TERT-CLPTM1L (rs465498 and rs2736100 at 5p15.33, P = 1.2 × 10?20 and P = 1.0 × 10?27, respectively), MIPEP-TNFRSF19 (rs753955 at 13q12.12, P = 1.5 × 10?12) and MTMR3-HORMAD2-LIF (rs17728461 and rs36600 at 22q12.2, P = 1.1 × 10?11 and P = 6.2 × 10?13, respectively). Two of these loci (13q12.12 and 22q12.2) were newly identified in the Chinese population. These results suggest that genetic variants in 3q28, 5p15.33, 13q12.12 and 22q12.2 may contribute to the susceptibility of lung cancer in Han Chinese.
