基因通常是由響應于細胞信號的蛋白因子打開或關閉的,。最近關于  riboswitches（一些信使RNA  內的調控元素）的發(fā)現證明,，RNA分子還能感知重要代謝物和控制基因的存在。兩項結構研究為了解riboswitch系統提供了新線索,。Serganov等人利用X-射線衍射確定來自大腸桿菌的一個riboswitch的三維結構,，該riboswitch結合在其目標、即一種維生素B1衍生物上,。這些發(fā)現顯示了RNA是如何折疊形成一個適合其目標的形狀,、尺寸非常精確的袋子的,，也顯示了抗硫胺素（pyrithiamine）是如何通過欺騙該riboswitch來發(fā)揮作用的,。這個結果為我們提供了一個設計以riboswitches為作用目標的抗細菌和抗真菌的化合物的新的藥物設計策略。Montange  和  Batey解決了結合在S-adenosyl  methionine上的一個細菌riboswitch  RNA的結構。這一RNA復雜的折疊結構顯示了該配體的結合何以導致下游區(qū)域的二級結構的改變,，而這種改變又會阻止進一步的轉錄,。