“非典”剛過去，華中科技大學生命科學與技術(shù)學院院長駱清銘教授就迫不及待地催促學院相關(guān)部門進行一項招標－－構(gòu)建大型生物信息數(shù)據(jù)中心,。
很快招標大會在華中科技大學舉行,。年輕的競標者胡雷鈞坐在華中科技大學的競標現(xiàn)場，經(jīng)過激烈投標,，他代表的浪潮北京公司中標了,。這讓他感到興奮。他擊敗了來自國內(nèi)外的10多家競爭對手,。
遭遇爆炸性數(shù)據(jù)增長
駱清銘并不了解浪潮,，他只知道，學院需要盡快找到一個能夠?qū)⒑Ａ康臄?shù)據(jù)管理利用起來的有效的平臺,。從國外回來后,，他就一頭扎入華中科技大學生命科學與技術(shù)學院的科研建設(shè)。目前,，學院承擔的在研項目就有58個,，其中國家自然科學基金20項、“863”項目5項,、“973”項目2項,、國家轉(zhuǎn)基因?qū)ｍ?00萬元以上的項目就有6項。這么多的研究項目,，數(shù)據(jù)的存儲,、處理已經(jīng)成了科研中的一個瓶頸。
據(jù)駱清銘介紹,，全球在基因組研究方面,，相關(guān)信息出現(xiàn)了爆炸性增長，研究人員面對的是海量生物學數(shù)據(jù),。目前與基因相關(guān)的生物學數(shù)據(jù)增長幅度越來越大,，數(shù)據(jù)翻番時間在不斷加快。大量的核酸,、蛋白質(zhì)序列,、基因多態(tài)、基因表達譜和蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)的積累已遠遠超出了實驗室的分析能力,，而傳統(tǒng)的計算方法也遇到了挑戰(zhàn),。
高性能計算使大規(guī)模的、快速的基因組信息數(shù)據(jù)處理成為可能,。建立超大規(guī)模計算系統(tǒng),，發(fā)展全新的生物信息學的理論,、方法來分析這些數(shù)據(jù)，從中獲得有用的信息成為基因組研究取得成果的決定性步驟,。
眼光圍著用戶轉(zhuǎn)
與計算技術(shù)結(jié)合的瓶頸使我國的生物信息研究目前處于分水嶺,。駱清銘說，國外進行生物信息的海量數(shù)據(jù)處理都使用超級計算機,，與國外相比,，國內(nèi)生物信息研究在使用高性能計算方面還比較薄弱，這將嚴重影響我國生物信息學未來的發(fā)展水平,。要解決這樣的問題就必須發(fā)展新的分析理論,、方法、技術(shù),、工具,，就必須依賴高性能計算機來完成信息處理工作。
但是,，如果采用國外的設(shè)備,，不僅硬件設(shè)施價格昂貴，而且服務(wù)費用支出不菲,。遍尋國內(nèi)外高性能服務(wù)器生產(chǎn)廠家,，反復比較后，才出現(xiàn)了文中開頭的一幕,。
生物信息數(shù)據(jù)中心引進了亞太區(qū)第一套基于Infiniband高速互聯(lián)技術(shù)的浪潮天梭TS10000高性能系統(tǒng),，用于生物信息學中的科學計算、模擬和可視化研究,，構(gòu)建大型生物信息數(shù)據(jù)中心,。該系統(tǒng)通過運用天梭TS10000高性能計算機硬件平臺，為華中科大從事生物信息科研工作者們提供高速,、海量的應(yīng)用服務(wù),，為生物信息學研究提供了一個基于硬件、軟件和數(shù)據(jù)庫集成環(huán)境下的統(tǒng)一運行平臺,。
以往從事生物研究的科技工作者需要分別采購硬件和軟件組成研究平臺,。這些分別采購來的軟硬件可能不兼容，這就需要對軟件進行繁雜的移植工作,，以適應(yīng)硬件環(huán)境的運行要求,。這樣往往會耽誤相關(guān)科研進程。為了更好地幫助華中科大科研工作者們從事生物信息研究,，浪潮和該實驗室還將進一步在這個領(lǐng)域合作,，進行生物信息處理相關(guān)的數(shù)學模型、算法和應(yīng)用軟件的研究和開發(fā),，軟硬一體的解決方案,，大大縮短了研究周期,。
合作升級
在平臺建設(shè)的過程中，駱清銘發(fā)現(xiàn),，浪潮天梭10000完全能夠勝任工作，而且服務(wù)周到,、細致,。更讓他驚喜的是，浪潮公司有博士后工作站,，而生物信息學的人才培養(yǎng)恰恰需要加強這方面的工作,，這給雙方合作提供了更多想象空間。
駱清銘將這個想法與浪潮北京公司做了溝通,。雙方一拍即合,。很快合作升級。10月19日,，在武漢,，由浪潮（北京）電子信息產(chǎn)業(yè)公司捐助建設(shè)的“華中科技大學－浪潮高性能生物信息中心”正式啟用。
同時,，浪潮向華中科大捐贈了圖形工作站,、Intel編譯器、性能調(diào)優(yōu)工具,、高性能并行數(shù)學庫等并行開發(fā)軟件,，以及浪潮集群管理軟件、浪潮并行文件系統(tǒng),、浪潮高性能負載均衡系統(tǒng)軟件等軟件系統(tǒng),，并提供相應(yīng)的研發(fā)經(jīng)費，用于啟動實驗室的面向生命信息領(lǐng)域的高性能計算應(yīng)用,；建立博士后工作站,，共同研究生命信息領(lǐng)域的高性能計算應(yīng)用；浪潮還提供研發(fā)人員,，與華中科技大學生物醫(yī)學光子學教育部重點實驗室研發(fā)人員組成研發(fā)團隊,，共同移植生命科學相關(guān)的軟件。
