來自于最近SCIENCE的文章,,本期SCIENCE的主題就是biological imaging,本文則是探討如何將生物信息學技術(shù)應(yīng)用于這項工作中去的開拓性文章,,相信對大家會有啟發(fā),。
生物顯像(Biological imaging)技術(shù)現(xiàn)在是探測細胞結(jié)構(gòu)和動態(tài)的重要的數(shù)量分析工具,并且被越來越多的用于基于細胞的掃描(cell-based)工作,。然而,,對應(yīng)的進行數(shù)據(jù)圖象分析工作的生物信息學工具還不成熟。
本文的作者發(fā)展了一種名為Open Microscopy Environment (OME)的系統(tǒng),,作為顯微圖象存儲和分析的信息學工具,。OME的目標是自動化圖象分析、建模,,在大量圖象中進行數(shù)據(jù)整理,、發(fā)掘工作。OME系統(tǒng)采用彈性的數(shù)據(jù)模型,,關(guān)系數(shù)據(jù)庫和以XML編寫的文檔,,這使得OME可以很容易與其他軟件工具進行整合。作者認為,,通過這樣的設(shè)計,,OME使得顯像信息學的發(fā)展邁出了重要的第一步。