加拿大多倫多大學(xué)教授布雷登·費(fèi)雷率領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),，在DNA中一個(gè)隱藏的“剪接密碼”可用來(lái)解釋為什么有限數(shù)目的人體基因能夠產(chǎn)生出如此巨大數(shù)量的遺傳信息。相關(guān)文章將發(fā)表在5月6日出版的《自然》雜志上。
該發(fā)現(xiàn)揭開(kāi)了遺傳學(xué)研究中最主要的奧秘之一,?？茖W(xué)家可據(jù)此來(lái)解釋活細(xì)胞如何使用有限數(shù)量的基因生成如大腦一樣非常復(fù)雜的器官?？茖W(xué)家認(rèn)為,，該發(fā)現(xiàn)彌合了多年來(lái)人類(lèi)對(duì)基因組的認(rèn)識(shí)和對(duì)細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜生產(chǎn)過(guò)程的認(rèn)識(shí)之間存在的鴻溝，有助于預(yù)測(cè)和防止癌癥及神經(jīng)退行性疾病的產(chǎn)生,。
2004年,，當(dāng)人類(lèi)基因組圖譜繪制完成后，科學(xué)家在人體中發(fā)現(xiàn)了將近2萬(wàn)個(gè)基因,?？茖W(xué)家還發(fā)現(xiàn)，活細(xì)胞使用這些基因來(lái)產(chǎn)生更加充裕和更具活力的指示源,，這些指示源由成千上萬(wàn)個(gè)指導(dǎo)細(xì)胞活動(dòng)的遺傳信息所組成,。
為了解釋活細(xì)胞如何在它們的遺傳信息中產(chǎn)生如此巨大的多樣性，費(fèi)雷教授聯(lián)合其他研究人員開(kāi)發(fā)出一種新的計(jì)算機(jī)輔助生物分析方法,，找出隱藏在基因組里的“密碼單詞”,，正是這些“密碼單詞”組成了所謂的“剪接密碼”。
在這些密碼中,，包含了各種生物學(xué)法則,。這些法則對(duì)以下過(guò)程進(jìn)行支配管理：復(fù)制于單個(gè)基因的一個(gè)遺傳信息的各個(gè)分離部分，可以不同方式剪接在一起,，產(chǎn)生出不同的遺傳信息,。科學(xué)家舉例說(shuō),，3個(gè)神經(jīng)黏結(jié)分子基因能夠產(chǎn)生3000個(gè)幫助控制大腦網(wǎng)絡(luò)的遺傳信息,。
費(fèi)雷教授將其發(fā)現(xiàn)比喻為：你在鎖著的門(mén)外聆聽(tīng)室內(nèi)的交響樂(lè)團(tuán)演奏，而當(dāng)大門(mén)打開(kāi)時(shí),，你才發(fā)現(xiàn),，只要三四個(gè)樂(lè)師，就完成了剛才你在室外欣賞到的交響樂(lè),。
費(fèi)雷教授表示,，以前，科學(xué)家無(wú)法預(yù)見(jiàn)在一個(gè)活細(xì)胞內(nèi)遺傳信息是如何重新安排或剪接的,。目前,，他們已經(jīng)應(yīng)用所發(fā)現(xiàn)的“剪接密碼”，成功預(yù)知了在許多不同生物組織中,，成千上萬(wàn)的遺傳信息如何以不同的方式得以重新安排,。
有人走進(jìn)一座黑洞洞的大樓,，摸索著推開(kāi)幾個(gè)房間的窗戶，慢慢看清了房間的模樣,。但他既不知大樓里還有多少個(gè)房間,，也不知每個(gè)房間之間的關(guān)聯(lián)。這情景正好比人類(lèi)今天探究年輕的生命科學(xué),。自上世紀(jì)50年代DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)以來(lái),，遺傳的一些分子機(jī)理相繼被揭示。我們已經(jīng)曉得,，生命過(guò)程中的基因調(diào)控和表達(dá)受制于無(wú)數(shù)密碼,，其中可能包括費(fèi)雷教授的“剪接密碼”。正因?yàn)榇髽抢锖诎?，所以每一縷透進(jìn)的陽(yáng)光都顯得彌足珍貴,。（生物谷Bioon.com）
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Nature Medicine：垃圾DNA可促進(jìn)癌細(xì)胞生長(zhǎng)
Science：非編碼DNA有可調(diào)控基因剪切
Spine：胸椎背胸側(cè)剪切加載對(duì)旋轉(zhuǎn)穩(wěn)定性的影響
生物谷推薦原文出處：
Nature doi:10.1038/nature09000
Deciphering the splicing code
Yoseph Barash,John A. Calarco,Weijun Gao,Qun Pan,Xinchen Wang,Ofer Shai,Benjamin J. Blencowe& Brendan J. Frey
Alternative splicing has a crucial role in the generation of biological complexity, and its misregulation is often involved in human disease. Here we describe the assembly of a ‘splicing code’, which uses combinations of hundreds of RNA features to predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. The code determines new classes of splicing patterns, identifies distinct regulatory programs in different tissues, and identifies mutation-verified regulatory sequences. Widespread regulatory strategies are revealed, including the use of unexpectedly large combinations of features, the establishment of low exon inclusion levels that are overcome by features in specific tissues, the appearance of features deeper into introns than previously appreciated, and the modulation of splice variant levels by transcript structure characteristics. The code detected a class of exons whose inclusion silences expression in adult tissues by activating nonsense-mediated messenger RNA decay, but whose exclusion promotes expression during embryogenesis. The code facilitates the discovery and detailed characterization of regulated alternative splicing events on a genome-wide scale.
