生物谷報(bào)道：各種質(zhì)譜儀能夠用于以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組研究,。每種類(lèi)型的儀器都具有獨(dú)特的設(shè)計(jì),、數(shù)據(jù)系統(tǒng)和運(yùn)行規(guī)范,，因此使其在不同類(lèi)型的實(shí)驗(yàn)中各有優(yōu)勢(shì),。但不幸的是,，每種質(zhì)譜產(chǎn)生的二進(jìn)制數(shù)據(jù)格式也不同,，而且通常都是排它的。

    數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的這種不一致和不透明的特性使得將新儀器整合到先前已經(jīng)有的基礎(chǔ)部件上變得很復(fù)雜，并影響了來(lái)自不同實(shí)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)室的結(jié)果的分析,、交流,、對(duì)比和公布。而且,，這種特性還使生物信息學(xué)研究人員無(wú)法獲得軟件發(fā)展要求的數(shù)據(jù),。

    在最近一期的Nature Biotechnology上，研究人員討論了質(zhì)譜數(shù)據(jù)的表示法以及這些數(shù)據(jù)在蛋白質(zhì)組研究中的利用,。

    在文章中,，研究人員介紹了“mzXML”格式，它是MS數(shù)據(jù)的一種開(kāi)放的,、通用的XML（注：extensible markup language）表示法,。研究人員還開(kāi)發(fā)出了一套與之相配合的支持程序。研究人員希望這種格式將會(huì)便利蛋白質(zhì)組研究中數(shù)據(jù)的處理,、解釋和發(fā)表（http://www.bioon.com/）,。