生物谷報道：各種質譜儀能夠用于以質譜為基礎的蛋白質組研究,。每種類型的儀器都具有獨特的設計,、數(shù)據系統(tǒng)和運行規(guī)范,，因此使其在不同類型的實驗中各有優(yōu)勢。但不幸的是,，每種質譜產生的二進制數(shù)據格式也不同,，而且通常都是排它的。

    數(shù)據結構的這種不一致和不透明的特性使得將新儀器整合到先前已經有的基礎部件上變得很復雜,，并影響了來自不同實驗和實驗室的結果的分析,、交流、對比和公布,。而且,，這種特性還使生物信息學研究人員無法獲得軟件發(fā)展要求的數(shù)據。

    在最近一期的Nature Biotechnology上,，研究人員討論了質譜數(shù)據的表示法以及這些數(shù)據在蛋白質組研究中的利用,。

    在文章中，研究人員介紹了“mzXML”格式,，它是MS數(shù)據的一種開放的,、通用的XML（注：extensible markup language）表示法。研究人員還開發(fā)出了一套與之相配合的支持程序,。研究人員希望這種格式將會便利蛋白質組研究中數(shù)據的處理,、解釋和發(fā)表（http://www.bioon.com/）。