據(jù)中國醫(yī)藥報報道:有人說,,20世紀(jì),,人類完成了三項(xiàng)宏大的科技工程:曼哈頓計劃、阿波羅計劃,、人類基因組計劃??茖W(xué)界預(yù)言,,21世紀(jì)的第一項(xiàng)重大科技工程將是蛋白質(zhì)組學(xué)研究。
"小鼠與人在基因組上的差別只有1%,,而小鼠與人之間的蛋白質(zhì)組卻千差萬別。蛋白質(zhì)組造就了生命的紛繁多姿,。"國際人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃執(zhí)行主席,、中國人類蛋白質(zhì)組組織主席、中科院院士賀福初在接受記者采訪時如是說,。北京師范大學(xué)生命科學(xué)院教授、高等院校蛋白質(zhì)組學(xué)研究院副院長何大澄則表示,,蛋白質(zhì)組學(xué)研究最大的追求目標(biāo),,是找到人類認(rèn)識自身,、征服疾病的"鑰匙"。隨著基因組計劃的完成,,蛋白質(zhì)組研究已成為21世紀(jì)生命科學(xué)發(fā)展的先導(dǎo),,因而深受各界關(guān)注,。
新藥研發(fā)獲得"蛋白質(zhì)空間"
賀福初表示,蛋白質(zhì)是基因功能的執(zhí)行者,。不研究蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組,,不可能揭示與闡述基因的功能。人類只有研究蛋白質(zhì)組,,才能更多地去發(fā)現(xiàn)疾病的診斷標(biāo)志,、預(yù)防標(biāo)志以及藥物篩選的靶標(biāo)和疾病治療的靶標(biāo),。統(tǒng)計顯示,,20世紀(jì)90年代末期,全世界用于尋找新藥的藥物靶標(biāo)共有483個,,它們主要都是蛋白質(zhì)(酶占28%,,受體占45%);而在當(dāng)時全世界正在使用的2000多種藥物中,,85%都是針對上述藥物靶標(biāo)的。從功能基因組的角度,,人們普遍認(rèn)為每種疾病平均與10個左右的基因相關(guān),,而每種基因又與3~10種蛋白質(zhì)相關(guān)。如果以人類主要的100~150種疾病進(jìn)行計算,,則應(yīng)該有3000~15000種的蛋白質(zhì)具有成為藥物靶標(biāo)的可能。這些潛在的發(fā)展源頭,,將有可能給制藥界帶來難以想象的財富和發(fā)展空間,。這也是為什么蛋白質(zhì)組學(xué)作為發(fā)現(xiàn)藥靶的主要技術(shù)平臺,越來越受到國際制藥界垂青的重要原因所在,。
何大澄認(rèn)為,蛋白質(zhì)組學(xué)研究還會大大加快人類對疾病的認(rèn)識,,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)研究的一個目標(biāo)就是在分子水平解釋生命活動的機(jī)制,。基因告訴我們會發(fā)生什么,,蛋白質(zhì)則告訴我們是怎么發(fā)生的,。細(xì)胞的生命活動包括增殖,、分化、衰老和死亡,,生物體從胚胎發(fā)育到個體成熟,,包括兒童期、青春期和老年期等,,每個階段、每個時期的生命活動是受到嚴(yán)格調(diào)控的,,其中任何一個環(huán)節(jié)失控,,都會導(dǎo)致癌癥,、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和消化系統(tǒng)疾病等疾病的發(fā)生。現(xiàn)在已經(jīng)知道,,在疾病中只有一小部分是起因于基因突變。而各種疾病都有蛋白質(zhì)譜的動態(tài)變化,,每種疾病在不同的發(fā)病階段,、在任何癥狀出現(xiàn)之前,,在蛋白質(zhì)水平方面已經(jīng)發(fā)生了變化。這些被確認(rèn)在早期發(fā)生的蛋白質(zhì)變化都有潛力發(fā)展成為臨床早期診斷指標(biāo),。所以蛋白質(zhì)組學(xué)研究將提供給我們大量的,、完整的、動態(tài)的蛋白質(zhì)譜,。
新藥研發(fā)除了靶標(biāo)的確認(rèn)外,還包括藥物作用機(jī)制研究,、先導(dǎo)化合物選擇,、小分子化合物篩選和優(yōu)化,、候選新藥的臨床前和臨床研究等過程,。賀福初說,在藥物作用機(jī)制研究方面,,蛋白質(zhì)組技術(shù)可以應(yīng)用于藥物的作用機(jī)制、藥物活性的生化基礎(chǔ)和藥物參與生化途徑等多個方面的研究,,所獲得的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)可為闡明藥物作用機(jī)制和新調(diào)節(jié)因子的作用模式提供有力的證據(jù),,也可為新藥研發(fā)提供新的思路,。在藥物毒性篩選和毒理學(xué)研究方面,與傳統(tǒng)研究方法相結(jié)合,,蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定藥物毒理機(jī)制上能更準(zhǔn)確地預(yù)測藥物在人體中有可能出現(xiàn)的毒性,,并更適用于藥物毒性篩選與預(yù)測。一旦確立了毒性作用和蛋白質(zhì)標(biāo)志物之間的關(guān)系,,就意味著可利用這些標(biāo)志物進(jìn)行新化合物的毒性篩選。應(yīng)用靈敏的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可以在劑量更低,、時間更短的情況下鑒定出藥物的毒性作用,,這樣就可以在研究的早期預(yù)測到藥物的潛在毒性作用,,并可以對先導(dǎo)化合物進(jìn)行毒性排序,,從而有效地節(jié)省大量的時間與經(jīng)費(fèi)。
目前,,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)已經(jīng)作為一種獨(dú)立的技術(shù)被廣泛應(yīng)用于新藥研發(fā),,國內(nèi)外制藥公司已經(jīng)廣泛地將蛋白質(zhì)組研究納入其藥物研發(fā)方案中。隨著技術(shù)的進(jìn)步,,人們將有能力更好地揭示蛋白質(zhì)的功能。不斷發(fā)展的蛋白質(zhì)組學(xué),、高通量的蛋白質(zhì)組平臺技術(shù)和豐富的生物信息學(xué)信息,,將會極大地推動和加速新藥研發(fā)的全過程。
突破機(jī)遇敲響中國大門
面對蛋白質(zhì)組學(xué)研究的巨大發(fā)展前景,,美歐各國政府紛紛加緊投入,通過組建研究中心,,建立數(shù)據(jù)庫,,力圖搶占該領(lǐng)域制高點(diǎn)。
我國政府大力支持蛋白質(zhì)組學(xué)研究,。國家自然科學(xué)基金委于1997年設(shè)立了重大項(xiàng)目"蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)體系的建立"。在此前后,,軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院,、中國科學(xué)院生物化學(xué)研究所與湖南師范大學(xué)迅速啟動了蛋白質(zhì)組研究,并在國際上較早提出了功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究戰(zhàn)略,。經(jīng)過幾年努力,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)院,、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院與復(fù)旦大學(xué)相繼成立了專門的蛋白質(zhì)組學(xué)術(shù)研究中心。2002年初,,由國家自然科學(xué)基金委員會和中國人民解放軍總后勤部衛(wèi)生部推薦立項(xiàng)的"973"重大研究項(xiàng)目---人類重大疾病的蛋白質(zhì)組學(xué)研究正式全面啟動,。由賀福初院士、復(fù)旦大學(xué)楊凡原教授一起主持這項(xiàng)未來5年內(nèi)資助額達(dá)3500萬元的重大課題研究,。近日,科技部又投入11.2億元全面啟動了"中國人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃",。
在各國政府大力推動蛋白質(zhì)組學(xué)研究基礎(chǔ)上,,2001年,,國際人類蛋白質(zhì)組組織宣告成立。它積極倡導(dǎo)并推進(jìn)"人類蛋白質(zhì)組計劃",,得到眾多國家的積極響應(yīng),。2002年11月,,在法國凡爾賽首屆人類蛋白質(zhì)組組織大會上,該組織宣布啟動"人類血漿蛋白質(zhì)組計劃"和"人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃",,這標(biāo)志著"人類蛋白質(zhì)組計劃"正式開始實(shí)施,。
在人類蛋白質(zhì)組計劃中,,我國在領(lǐng)導(dǎo)大型國際計劃中首次實(shí)現(xiàn)了零的突破,。由賀福初院士牽頭的"人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃"是第一個人類組織/器官的蛋白組計劃,,目前有16個國家和地區(qū)的80余個實(shí)驗(yàn)室報名參加,。其科學(xué)目標(biāo)是:揭示并確認(rèn)肝臟的蛋白質(zhì)組;在蛋白質(zhì)水平規(guī)?;⒔馀c驗(yàn)證人類基因組計劃所預(yù)測的編碼基因;實(shí)現(xiàn)肝臟轉(zhuǎn)錄組,、肝臟蛋白質(zhì)組,、血漿蛋白質(zhì)組及人類基因組的對接與整合,;揭示人類轉(zhuǎn)錄,、翻譯水平的整體,、群集調(diào)控規(guī)律;建立肝臟"生理組",、"病理組",;為重大肝病預(yù)防、診斷,、治療和新藥研發(fā)的突破提供重要的科學(xué)基礎(chǔ)。據(jù)賀福初介紹,,人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃將在2010年前后完成,,繪制出人類肝臟蛋白質(zhì)表達(dá)譜,、修飾譜以及定位圖、連鎖圖,、結(jié)構(gòu)圖,建立樣本庫,、抗體庫和數(shù)據(jù)庫,,簡稱"兩譜三圖三庫"。他告訴記者:"目前意在弄清肝臟中各種蛋白質(zhì)的類型,、濃度以及存在形式的表達(dá)譜研究已獲得實(shí)質(zhì)性推進(jìn)。我國科學(xué)家已開始進(jìn)行表達(dá)譜繪制,、連鎖圖分析,、抗體分析、生物信息分析等方面的研究工作,。"一批肝臟疾病的診斷試劑和治療藥物有望在不久后研制成功。
在人類基因組計劃中,,中國作為惟一的發(fā)展中國家,,承擔(dān)了1%的研究任務(wù);在人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃中,中國科學(xué)家將承擔(dān)20%以上的研究任務(wù),,已成為推進(jìn)該計劃的主力軍團(tuán)。
良性發(fā)展急需風(fēng)險投資
大規(guī)??茖W(xué)研究需要巨額資金支撐,。在各國政府加大蛋白質(zhì)組學(xué)研究投入的同時,,民間資本也極為看好其商業(yè)潛力,紛紛涉足該領(lǐng)域,。據(jù)何大澄介紹,,目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)展最快、投資最多的仍然是發(fā)達(dá)國家,,特別是北美和歐洲國家。數(shù)字表明,,在美國,,蛋白組學(xué)以及相關(guān)生物工程方面的研究除了政府投入以外,來自企業(yè)和各類基金組織的風(fēng)險資金已達(dá)85.2億美元。日本,、新加坡和澳大利亞則把發(fā)展蛋白質(zhì)組學(xué)研究作為增強(qiáng)國家實(shí)力和推動經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要舉措。2004年4月,,日本啟動了"Protein3000"蛋白質(zhì)組學(xué)研究計劃,,投資5.7億美元,計劃5年內(nèi)解析3000個蛋白的結(jié)構(gòu)及其功能,,該國近70家企業(yè)參與這一計劃,。
與此同時,,我國本土研發(fā)機(jī)構(gòu)和企業(yè)也緊緊盯住該領(lǐng)域的發(fā)展空間,相繼行動,,以把握前所未有的機(jī)遇,。2001年5月18日,北京師范大學(xué)作為首倡單位,,在北京正式成立了隸屬教育部的高等學(xué)校蛋白質(zhì)組學(xué)研究院。該研究院由北京師范大學(xué),、中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué),、第四軍醫(yī)大學(xué)、上海交通大學(xué),、北京中醫(yī)藥大學(xué)、中日友好臨床醫(yī)學(xué)研究所,、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院、北京億利生物工程技術(shù)研究所,、北京市科委高科技實(shí)驗(yàn)室等9家著名高校,、科研單位聯(lián)合組建。這是我國第一次大規(guī)模地突破院校界線,,同時又與臨床單位、國外高科技公司,、國內(nèi)企業(yè)共同組建的科研實(shí)體,。內(nèi)蒙古億利集團(tuán)公司承諾投資5000萬元用于研制和開發(fā)有應(yīng)用價值的蛋白質(zhì)芯片和建立高通量的蛋白質(zhì)識別技術(shù)。然而,,由于資金方面的原因,,億利集團(tuán)在投入近數(shù)百萬元人民幣后退出了合作,,但是億利集團(tuán)在北京的億利生物工程技術(shù)研究所并未因此停止其蛋白質(zhì)組學(xué)研究工作,。
2003年10月,江西省江中制藥集團(tuán)投入1.5億元與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院,、北京市科委聯(lián)合成立了北京蛋白質(zhì)研究中心,。該中心將作為國際人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃的執(zhí)行總部,系統(tǒng)組織,、協(xié)調(diào)該計劃的國際合作、知識產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓等,。以此中心為依托所成立的正旦國際科技有限公司正在為該項(xiàng)計劃進(jìn)行各類公益基金與風(fēng)險投資的運(yùn)作,。
與此同時,一些跨國藥企也緊緊盯住了中國蛋白質(zhì)組學(xué)計劃的有利商機(jī),,據(jù)悉,,全球知名的生命科學(xué)領(lǐng)域廠商安捷倫公司已和中國的華大基因,、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院進(jìn)行合作,建立了各自的蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)室,。此外,,該公司還和上海生物芯片中心、南方基因中心和第一軍醫(yī)大學(xué)建立了合作或者伙伴關(guān)系,。該公司科技副總裁FranDiNuzzo表示:"在蛋白質(zhì)組學(xué)方面,,中國市場是比較年輕的,,但是中國政府在這方面已經(jīng)加大了投資的力度。在人類基因項(xiàng)目中,,中國的投入僅僅占全球投資的1%,。但是我相信,中國政府將肯定會加大在人類肝臟蛋白質(zhì)學(xué)基因項(xiàng)目上的投資,。安捷倫非常渴望擴(kuò)大在生命科學(xué)領(lǐng)域所占份額,。"
整體上,,我國蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺的建設(shè)有了飛躍發(fā)展,有些單位的技術(shù)平臺已達(dá)到國際先進(jìn)水平,。在肝癌、白血病等疾病的蛋白質(zhì)組研究上獲得了不少成就,但與國外相比,,無論是投資力度,,還是參與研究的人員,,都遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。賀福初院士用"三難"來形容我國的蛋白質(zhì)組學(xué)研究,,即現(xiàn)有的規(guī)模與層次難以提供對我國醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)與生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)迅猛發(fā)展所急需的,、強(qiáng)有力的蛋白質(zhì)組學(xué)學(xué)術(shù)與技術(shù)支撐,,難以適應(yīng)我國基因組學(xué)等現(xiàn)代生命科學(xué)前沿領(lǐng)域?qū)Φ鞍踪|(zhì)組學(xué)的廣泛需求,難以應(yīng)對國際在這一戰(zhàn)略高地的激烈競爭,。賀福初,、何大澄等學(xué)者呼吁,,為了在國際蛋白質(zhì)組學(xué)研究上搶占制高點(diǎn),為我國的醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)和與生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展作出應(yīng)有的貢獻(xiàn),,政府和企業(yè)都應(yīng)該緊緊把握住改變我國藥品生產(chǎn)靠模仿的最好時機(jī),。(http://www.bioon.com)