863計(jì)劃蛋白質(zhì)組研究構(gòu)建了1737個(gè)基因高表達(dá)載體,；純化了458個(gè)蛋白表達(dá)產(chǎn)物；獲得了126個(gè)可供衍射數(shù)據(jù)收集的蛋白質(zhì)結(jié)晶（包括微晶）,；測(cè)定了69個(gè)蛋白質(zhì)和具有重要意義的蛋白質(zhì)復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)（包括6個(gè)核磁分析的結(jié)構(gòu)）,。解析了人細(xì)胞漿內(nèi)NADP+依賴型的異檸檬酸脫氫酶及其輔酶NADP+的復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu); 測(cè)定了一個(gè)潛在的藥物靶蛋白——PDF（鉤端螺旋體去甲酰化酶）以及PDF與actinonin（一種天然的PDF抑制劑）結(jié)合復(fù)合物的X射線晶體結(jié)構(gòu),。人色氨酰-tRNA合成酶,、人上游轉(zhuǎn)錄因子(hUBF)等重要蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能研究也取得了重要進(jìn)展。SARS冠狀病毒蛋白酶3cl及其復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)解析成功,，受到國(guó)際同行的關(guān)注與好評(píng),。

　　隨著我國(guó)蛋白質(zhì)組研究隊(duì)伍的不斷壯大，我國(guó)蛋白質(zhì)組研究的重心也逐步從最初的以建立技術(shù)平臺(tái)，開(kāi)展技術(shù)方法的研究,、整合為主,，逐步向以高通量的蛋白質(zhì)組研究技術(shù)平臺(tái)為基礎(chǔ)。一批與重大疾病和重要生物功能相關(guān)的蛋白質(zhì)組研究已經(jīng)取得明顯進(jìn)展,一批高質(zhì)量的研究論文先后在國(guó)際蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的《自然》等刊物上發(fā)表,。

　　蛋白質(zhì)相互作用,、大規(guī)模ORF克隆、高通量的質(zhì)譜分析,、大規(guī)模測(cè)序技術(shù),、功能研究、生物信息學(xué),、抗體中心等技術(shù)和平臺(tái)逐步建立和完善,。我國(guó)獨(dú)立主持國(guó)際“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”，參加國(guó)際人類蛋白質(zhì)組研究計(jì)劃中的“大規(guī)?？贵w制備”項(xiàng)目,。