2012年11月23日 訊 /生物谷BIOON/ --人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒,，感染約50-100％的成人，但通常沒有不良影響,，并且它可以保持潛伏多年,。人巨細胞病毒感染是比較常見的，發(fā)展中國家感染人數(shù)比發(fā)達國家人數(shù)多,。
該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統(tǒng)受損,，可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發(fā)展有關(guān)聯(lián),。這項新的研究分析了病毒的蛋白質(zhì)組,，并描述了所有表達的蛋白質(zhì)。
研究人員認為,，以往研究潛在編碼蛋白質(zhì)的基因組很大程度上是計算機模型上的,，這是不完整的。二十多年來,，16個病毒株人巨細胞病毒基因組已被測序,。
這是一個特別大的病毒基因組中,，約240,000個堿基對,。該小組開始研究感染HCMV的人成纖維細胞的核糖體。核糖體是細胞內(nèi)制造蛋白質(zhì)的細胞器,。他們用質(zhì)譜分析以確定是否存在預測的蛋白質(zhì),。
研究發(fā)現(xiàn)了數(shù)以百計的蛋白質(zhì)編碼基因，這些基因此前未被確定在基因組中,。編碼蛋白質(zhì)的DNA片段被稱為開放閱讀框架,，在基因組序列的分析基礎(chǔ)上,，以前的研究預測有200幀。
了解病毒基因組表達的蛋白質(zhì)可能有助于確定該病毒是如何影響宿主細胞的,。相關(guān)研究論文發(fā)表在Science上,，研究小組說核糖體分析技術(shù)和質(zhì)譜相結(jié)合方法可用于研究其他復雜病毒的蛋白質(zhì)組。（生物谷：Bioon.com）
doi:10.1126/science.1227919
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PMID:
Decoding Human Cytomegalovirus
Noam Stern-Ginossar, Ben Weisburd, Annette Michalski, et al.
The human cytomegalovirus (HCMV) genome was sequenced 20 years ago. However, like those of other complex viruses, our understanding of its protein coding potential is far from complete. We used ribosome profiling and transcript analysis to experimentally define the HCMV translation products and follow their temporal expression. We identified hundreds of previously unidentified open reading frames and confirmed a fraction by means of mass spectrometry. We found that regulated use of alternative transcript start sites plays a broad role in enabling tight temporal control of HCMV protein expression and allowing multiple distinct polypeptides to be generated from a single genomic locus. Our results reveal an unanticipated complexity to the HCMV coding capacity and illustrate the role of regulated changes in transcript start sites in generating this complexity.
