6月19號Nature Genetics網(wǎng)絡(luò)版報道說以色列科學家鑒別出的microRNAs可能是首批靈長類動物特有的microRNA,。新鑒別出的89個新microRNA使已經(jīng)測序的人類microRNA的數(shù)量增加了一倍。羅賽塔基因組學協(xié)會(Rosetta Genomics in Rehovot)的研究組領(lǐng)導(dǎo)人Isaac Bentweich表示:“這些靈長類特異的基因簇對于研究生物進化有著重要意義,并且也有重要的診斷和治療潛景,。”
他們認為這些新的microRNAs意味著在人類基因組中還有數(shù)以百記的未知microRNA等待發(fā)掘,。
近年來成為研究最熱點之一的microRNAs是一類大約22個核苷酸長的單鏈RNAs,,它們通過靶定特異mRNAs來調(diào)控基因表達,。編碼microRNA基因的DNA序列包括microRNA,以及當轉(zhuǎn)錄時形成雙鏈RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)的輔助序列,。
在過去的研究中已經(jīng)發(fā)表的222個人類microRNAs中只有86個科學家已經(jīng)確證了其序列,。為了獲得更多的信息,Bentwich和他的同事們通過計算機在整個人類基因組中“換算”出1千1百多萬個大小約55個核苷酸或更長,、可折疊為發(fā)夾結(jié)構(gòu)的序列,。其中434,239個看起來可能會是有功能的microRNA。
Bentwich和他的同事從最初的40多萬個潛在的microRNA挑選了首批5,300個“代表”,,借助高通量生物芯片在胎盤,、睪丸、胸腺,、前列腺和腦組織中進行篩選,,發(fā)現(xiàn)其中886個有表達。通過選擇其中359個進行克隆與測序,,研究者們鑒別出89種新的microRNA,。
Bentwich和他的同事從這些結(jié)果中推斷人類基因組有至少800個microRNA。2003年the Whitehead Institute和MIT的Burge和David Bartel實驗室曾經(jīng)估計人類microRNA的數(shù)目不超過255,,但隨后,,他們自己以及其后的研究者都認為這個數(shù)字偏低。
新發(fā)現(xiàn)的microRNAs中的53個是屬于靈長類特有的兩個大基因簇,,這顯然不同于此前已知的其他人類microRNA基因簇――那些簇在所有哺乳動物都有。兩大基因簇的其中一個簇定位在19號染色體上,并且只在胎盤中表達,。它是目前為止報道過的最大的microRNA簇,,包括54個新的microRNA。第二個基因簇定位在X染色體,,包括10個在microRNA,,它們只在睪丸中表達。
Burge認為,,未來的挑戰(zhàn)是如何去推測非保守性microRNA(nonconserved microRNAs)的靶目標,。“對于進化上保守的microRNA,我們已知數(shù)以千計的保守的mRNA可能是他們的調(diào)控目標,,但是對于非保守性的microRNA,,我們還什么都不知道。