生物谷報(bào)道：美國能源部聯(lián)合基因組研究所（US Department of Energy’s Joint Genome Institute 縮寫,，JGI）上周通知科學(xué)界，研究人員可自由獲得初步的大豆基因組序列,，以便利和刺激生物能源研究,。
JGI的院長Eddy Rubin在1月15日圣地亞哥舉行的植物和動物基因組大會上公布了這項(xiàng)決定。
美國能源部之所以對大豆有興趣是因?yàn)檫@種作物事重要的可再生,、替代燃料（生物柴油）資源,。生物柴油不但在替代燃料中具有最高的能量含量，而且還比傳統(tǒng)的石油燃料更清潔,。
該機(jī)構(gòu)表示,，有力詳細(xì)的大豆遺傳學(xué)信息，將有助于開發(fā)出更適合制造生物能源的大豆,。美能源部在17號的一項(xiàng)聲明中表示,，有可能開發(fā)出一種個(gè)性化的生物質(zhì)生產(chǎn)平臺，講生物柴油的油籽生產(chǎn)和先進(jìn)的植物乙醇轉(zhuǎn)化聯(lián)合起來,。
美能源部的科學(xué)家與斯坦福大學(xué),、密蘇里－哥倫比亞大學(xué)、愛荷華州大學(xué)和普渡大學(xué)的研究人員一道,，正在使用大規(guī)模的DNA測序來揭示大豆基因組,。迄今為止，已經(jīng)測序了大約1300萬個(gè)片斷,。大豆基因組計(jì)劃開始于2006年中期,。
近期有關(guān)基因組研究的新聞
科學(xué)怪人基因組成為《時(shí)代》年度科學(xué)發(fā)現(xiàn)
素有“科學(xué)怪人”之稱的著名美國科學(xué)家Craig Venter所發(fā)明的雙倍體基因組序列（diploid genome sequence）登時(shí)了美國《時(shí)代》雜志的2007年度第二大最重要科學(xué)發(fā)現(xiàn)。另外,，強(qiáng)生公司的一個(gè)子公司研發(fā)的一種RT-PCR乳腺癌檢測技術(shù)成為本年度第二重要的醫(yī)學(xué)突破,。
Craig Venter的基因組是世界首個(gè)已測序的雙倍體基因組，其測序結(jié)果發(fā)表在9月的PLoS Biology雜志上,。這個(gè)基因組是利用Sanger測序方法完成,，他在宣布這項(xiàng)成果時(shí)是如此介紹：這可能是首個(gè)也是最后一個(gè)利用這種耗費(fèi)成本和時(shí)間的老技術(shù)所測序的個(gè)人基因組。
Venter估計(jì)這項(xiàng)研究計(jì)劃至少花費(fèi)7000萬美元,。到目前為止,，這種高質(zhì)量的草圖還沒有完成。為了封閉缺口,、改善單型體的裝配,，研究人員目前正在利用新一代的測序技術(shù)獲得其他數(shù)據(jù)。
12專家：測序更多植物基因組
美國研究委員會（NRC）在本周發(fā)表的一項(xiàng)報(bào)告中稱,，以通過基因組學(xué)研究來探索植物秘密的NPGI計(jì)劃應(yīng)該拓展其測序能力,，并且努力開發(fā)出表觀基因組學(xué)和其他所謂的“omics”（生物組學(xué)，生物谷注）學(xué)科的新工具。
這項(xiàng)由植物遺傳學(xué)和其他領(lǐng)域的12位專家委員所準(zhǔn)備的報(bào)告回顧了十年美國基因組學(xué)研究計(jì)劃的成果,，并且給出了將來研究的方向和目標(biāo),。
在這些建議中，12專家呼吁擴(kuò)大植物基因組測序,、植物相關(guān)微生物測序,、植物相關(guān)宏基因組（metagenome）測序和相關(guān)高質(zhì)量注釋。（宏基因組（Metagenome）是特定環(huán)境或共生體內(nèi)所有生物遺傳物質(zhì)的總和,，是一種不依賴于人工培養(yǎng)的微生物基因組分析技術(shù),。宏基因組方法很大程度上依賴于提取DNA的純度，大片段DNA的成功克隆也是宏基因組方法的關(guān)鍵,。生物谷注）
為了滿足這個(gè)要求,，這項(xiàng)報(bào)告還建議NPGI能夠拓展其與DOE聯(lián)合基因組研究所得現(xiàn)有合作關(guān)系，并且能夠讓研究人員接觸合利用新一代測序技術(shù)進(jìn)行基因組學(xué)和宏基因組研究,。
該報(bào)告還鼓勵開發(fā)一些仔細(xì)選擇的植物種類的高精度“omics”資源以及一些傳統(tǒng)物種的更寬或更窄水平的數(shù)據(jù)資源,。
其他的建議包括使用系統(tǒng)方法來提高美國在重要農(nóng)作物和樹種方面的競爭力，集中研究植物進(jìn)化,，并且將所有這類研究歸為植物改良計(jì)劃,。
