科學家測出了傷寒致病菌的基因組序列,，他們說這一舉措可能改善這種疾病的診斷和追蹤，而且可能幫助新的疫苗接種策略,。
每年大約有60萬人死于傷寒,，它會導致10%到30%的未經(jīng)治療的感染者的死亡。盡管該病可以通過疫苗接種和抗生素加以控制,，由于抗生素耐藥性, 它還在持續(xù)存在,，特別是在東南亞地區(qū)。
由英國威康基金會桑格研究所領(lǐng)導的一個國際研究團隊對從10個國家分離出的19種傷寒沙門氏菌進行了測序,。他們發(fā)現(xiàn)該細菌的基因組自從約1.5萬年前出現(xiàn)之后進化得很少,。
這組科學家說這與傷寒沙門氏菌正在成為只能感染人類的感染因子的情況一致，無癥狀攜帶者是主要的感染源,。這意味著它可以通過免疫接種加以防控——而且傷寒有可能被根除,。
測出傷寒沙門氏菌的序列意味著如今可以從現(xiàn)場進行分類，從而確定導致傷寒暴發(fā)的菌株類型,。這可以讓科學家發(fā)現(xiàn)在特定群體中傳播該病的生物個體,，這與“Google地球”地圖聯(lián)合使用可以展示暴發(fā)的情況。
這組科學家希望這種測繪可以用于進行更成功的免疫接種運動,。該研究的主要作者,、威康基金會桑格研究所的Gordon Dougan告訴本網(wǎng)站說，這種測繪可能用于研究傷寒和霍亂等困擾了人類數(shù)世紀的疾病,。他還說,，可以在現(xiàn)場實時研究單個病毒、細菌或整個種群,。
Dougan指出,，“新的技術(shù)讓我們可以看到傷寒沙門氏菌等生物DNA中的進化痕跡。”
他還說,，特別是在發(fā)展中國家,，這種測繪技術(shù)將徹底革新諸如監(jiān)測以及控制傷寒等疾病的免疫接種項目等等公共衛(wèi)生手段。
他說發(fā)展中國家的科學家可以很容易地獲取這種測繪技術(shù),，他們可以通過桑格研究所的開放獲取政策利用該研究所的數(shù)據(jù)庫,。（生物谷Bioon.com）
生物谷推薦原始出處：
Nature Genetics 40, 987 - 993 (2008) Published online: 27 July 2008 | doi:10.1038/ng.195
High-throughput sequencing provides insights into genome variation and evolution in Salmonella Typhi
Kathryn E Holt1, Julian Parkhill1, Camila J Mazzoni2,3, Philippe Roumagnac3,4, François-Xavier Weill5, Ian Goodhead1,8, Richard Rance1, Stephen Baker1,6, Duncan J Maskell7, John Wain1, Christiane Dolecek6, Mark Achtman2,3 & Gordon Dougan1
Abstract
Isolates of Salmonella enterica serovar Typhi (Typhi), a human-restricted bacterial pathogen that causes typhoid, show limited genetic variation. We generated whole-genome sequences for 19 Typhi isolates using 454 (Roche) and Solexa (Illumina) technologies. Isolates, including the previously sequenced CT18 and Ty2 isolates, were selected to represent major nodes in the phylogenetic tree. Comparative analysis showed little evidence of purifying selection, antigenic variation or recombination between isolates. Rather, evolution in the Typhi population seems to be characterized by ongoing loss of gene function, consistent with a small effective population size. The lack of evidence for antigenic variation driven by immune selection is in contrast to strong adaptive selection for mutations conferring antibiotic resistance in Typhi. The observed patterns of genetic isolation and drift are consistent with the proposed key role of asymptomatic carriers of Typhi as the main reservoir of this pathogen, highlighting the need for identification and treatment of carriers.
