微生物學(xué)通報(bào) AUG 20, 2008, 35(8): 1198~1202
Microbiology 2008 by Institute of Microbiology, CAS
呂文洲* 劉 英 朱建林
(寧波大學(xué)建筑工程與環(huán)境學(xué)院環(huán)境工程系 寧波 315211)
摘 要: 本研究建立了適合于PCR-DGGE分析的環(huán)境樣品中酵母菌基因組DNA的快速提取方法并利用PCR-DGGE對酵母菌處理油脂廢水系統(tǒng)中的酵母菌群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了解析。結(jié)果表明, 并非所有可以降解含油廢水中污染物的菌株都可以穩(wěn)定存在于系統(tǒng)中; 系統(tǒng)對于菌株的選擇開始于菌株的擴(kuò)大培養(yǎng)階段; 系統(tǒng)從連續(xù)運(yùn)行開始到穩(wěn)定的過程中, G1,、O2或W1成為優(yōu)勢菌株并穩(wěn)定存在于系統(tǒng)中,。
關(guān)鍵詞: 酵母菌, DNA提取, PCR-DGGE, 群落結(jié)構(gòu)
Analysis of Yeast Community Structure in a Salad Oil-containing Wastewater Treatment System by PCR-DGGE
L Ü Wen-Zhou* LIU Ying ZHU Jian-Lin
(Department of Environmental Engineering, College of Architectural Civil Engineering and Environment, Ningbo University, Ningbo 315211)
Abstract: A rapid extraction of yeast genomic DNA suitable for PCR-DGGE analysis was established and the yeast community structure in a salad oil-containing wastewater treatment system was investigated. The results show, not all yeast strains capable of degrading pollutants in wastewater can be planted by system; the selection of system to yeast strains starts from the period of yeast biomass cultivation; from beginning to stable status of continuous wastewater treatment, G1, O2 or W1 are the dominant yeast strains and sur-vive in selection of system.
Keywords: Yeast, DNA extraction, PCR-DGGE, Community structure
Muyzer[1] 于1993年首次將變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)引入微生物生態(tài)學(xué)研究, 并用以確定自然環(huán)境中微生物群體的多樣性。隨后, 該技術(shù)被逐漸應(yīng)用到了廢水生物處理過程中對總細(xì)菌或功能細(xì)菌的微生態(tài)結(jié)構(gòu)進(jìn)行解析[2 7],。近年來, 國內(nèi)也相繼利用此技術(shù)對活性污泥系統(tǒng)[8,9],、特種反應(yīng)器[10 13]、受重金屬污染土壤[14]以及堆肥[15]中的微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析, 并快捷,、準(zhǔn)確地揭示了系統(tǒng)中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化及其對系統(tǒng)功能的影響,。縱觀以前的研究, 大多是以系統(tǒng)中的細(xì)菌為研究主體, 對于酵母菌的研究較少,。2000年Cocolin建立了分析釀酒過程中酵母菌多樣性的PCR-DGGE方法[16,17], 隨后成功應(yīng)用于牛奶中酵母種群的結(jié)構(gòu)分析,。Prakitchaiwattana[18]和Nielsen[19]也分別用此技術(shù)分析了葡萄表面以及可可發(fā)酵過程中的酵母菌種群。但截至目前, 尚未見到該技術(shù)應(yīng)用于解析酵母菌廢水處理系統(tǒng)中酵母菌群落結(jié)構(gòu)的報(bào)道,。
前期研究中, 由10株功能酵母菌構(gòu)建的SBR系統(tǒng)在處理高含油廢水中取得了良好的效果, 但在系統(tǒng)運(yùn)行中經(jīng)常出現(xiàn)出水混濁, 并在出水中檢出大量酵母細(xì)胞, 說明這一過程中可能存在菌株流失現(xiàn)象,。為了深入探討各酵母菌株在系統(tǒng)中的演替, 并最終確定優(yōu)勢種群以構(gòu)建高效、穩(wěn)定的酵母菌廢水處理系統(tǒng), 本研究利用PCR-DGGE方法對酵母菌處理高含油廢水中的酵母群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了初步分析, 并在此過程中建立了適用于PCR-DGGE分析的環(huán)境樣品中酵母菌基因組DNA的快速提取方法。
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