微生物學(xué)報(bào)Acta Microbiologica Sinica 48(10)：1295~1300; 4 October 2008
游動(dòng)雙孢菌線型質(zhì)粒pPR2的全序列測(cè)定及分析
楊勇，覃重軍*
(中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所,，上海 200032)
摘要：【目的】獲得游動(dòng)雙孢菌線型質(zhì)粒pPR2的全序列,，并揭示新型的端粒復(fù)制蛋白和可能的中間復(fù)制位點(diǎn)?！痉椒ā坑梅侄慰寺〉姆椒ê托蛄衅唇荧@得pPR2的全序列，利用軟件分析端粒DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)和可能的端粒復(fù)制蛋白,，利用鏈霉菌原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化的方法檢測(cè)可能的中間復(fù)制的位點(diǎn),。【結(jié)果】pPR2全長(zhǎng)為15520 bp，（G+C）含量為68.1%,。其端粒末端反向重復(fù)序列的長(zhǎng)度為329 bp,，不能像多數(shù)鏈霉菌的線型質(zhì)粒那樣能形成保守的"折返"的二級(jí)結(jié)構(gòu)。pPR2雖然沒有參與鏈霉菌端粒復(fù)制的保守的tap/tpg基因,，但是pPR2.3c基因編碼了一個(gè)雙結(jié)構(gòu)域蛋白,，分別同鏈霉菌的端粒復(fù)制相關(guān)蛋白Tap和嗜血桿菌的解旋酶具有相似性。pPR2缺少典型的鏈霉菌重復(fù)序列-復(fù)制基因（iteron-rep）區(qū)段,，將幾乎覆蓋全長(zhǎng)pPR2的兩段DNA進(jìn)行克隆后,，不能轉(zhuǎn)化變鉛青鏈霉菌。此外,，pPR2基因還編碼可能參與線型DNA復(fù)制的調(diào)控的單鏈結(jié)合蛋白（SSB）和與放線菌質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移相關(guān)的主要蛋白(Tra),。【結(jié)論】pPR2是鏈霉菌之外的放線菌中最小的線型質(zhì)粒,，其序列在游動(dòng)雙孢菌屬的線型質(zhì)粒中是首次報(bào)道,。pPR2可能具有新型的端粒復(fù)制的機(jī)制，其中pPR2.2c和pPR2.3c編碼可能的端粒復(fù)制蛋白,。
關(guān)鍵詞：游動(dòng)雙孢菌,；線型質(zhì)粒；全序列,；端粒,；復(fù)制
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