微生物學(xué)報(bào)Acta Microbiologica Sinica 48(10):1351~1355; 4 October 2008
西南印度洋中脊深海沉積物砷抗性菌的富集分離與多樣性分析
陳雙喜,邵宗澤*
(國家海洋局第三海洋研究所,,國家海洋局海洋生物遺傳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,,廈門 361005)
摘要:【目的】為了篩選深海砷抗性菌,,了解印度洋中脊深海沉積物砷抗性菌的多樣性情況,?!痉椒ā客ㄟ^砷富集培養(yǎng),,篩選出砷抗性菌,;通過變性梯度凝膠電泳(DGGE)分析與構(gòu)建16S rDNA 克隆文庫法兩種手段分析了富集物中砷抗性菌的多樣性,。利用兼并引物PCR,,從抗性菌株中克隆與砷抗性相關(guān)的基因?!窘Y(jié)果】共篩選到8株砷抗性菌,,分別屬于γ-proteobacteria的5個(gè)不同的屬。其中,,菌株AS-I1-3的抗性最高,,可以在26×10 3 mol/L三價(jià)砷存在的情況下生長,該菌株的16S rDNA 序列與菌株P(guān)seudoalteromonas tetraodoni IAM同源性最高 (100%),。DGGE分析顯示,,該菌是富集物中的最優(yōu)勢(shì)菌,其次是鹽單胞菌(Halomonas)和海桿菌(Marinobacter),。16S rDNA 克隆文庫分析結(jié)果進(jìn)一步證明,,與菌株AS-I1-3序列相同的克隆子占整個(gè)克隆文庫的72.5%;而與菌株AS-I1-5 (Halomonas meridiana, 100%) 和菌株Mn-I1-6(Marinobacter vinifirmus,,99%)序相同的克隆子分別占10%和7.5%,。然而,利用兼并引物PCR,,僅能從2株非優(yōu)勢(shì)菌中克隆到了與砷抗性相關(guān)的基因,,表明菌群中的優(yōu)勢(shì)抗性菌可能有其他的抗性機(jī)制?!窘Y(jié)論】在深海環(huán)境中存在著多種砷抗性菌,,其中Pseudoalteromonas屬的菌株是該富集條件下的砷抗性優(yōu)勢(shì)菌。這些砷抗性菌在大洋環(huán)境砷元素的生物地球化學(xué)循環(huán)中的作用有待進(jìn)一步研究,。
關(guān)鍵詞:印度洋,;深海沉積物;砷抗性菌,; 生物多樣性
全文下載:西南印度洋中脊深海沉積物砷抗性菌的富集分離與多樣性分析
更多全文請(qǐng)查看鏈接:http://journals.im.ac.cn
聲明:本文由《微生物學(xué)報(bào)》授權(quán)生物谷 www.bioon.com 網(wǎng)站發(fā)布,如需轉(zhuǎn)載請(qǐng)直接與中國科學(xué)院微生物研究所期刊聯(lián)合編輯部聯(lián)系并支付相應(yīng)費(fèi)用,,未經(jīng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載,,若轉(zhuǎn)載將付相應(yīng)的法律責(zé)任