由美國麻省理工學院和哈佛大學布羅德研究院、哈佛大學醫(yī)學院和馬薩諸塞州總醫(yī)院的科學家組成的聯(lián)合研究小組,,創(chuàng)建了迄今為止最全面的細胞線粒體的“組件清單”——一個包含近1100個蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫,。通過對這一重要資源的挖掘研究,科學家不僅對幾種關鍵蛋白質(zhì)的生物角色和進化歷史有了更深入的理解,,而且確認了一種新的蛋白質(zhì)編碼基因的突變,,這個突變會導致致命的線粒體疾病。有關結果發(fā)表在7月11日出版的《細胞》(Cell)雜志上,。
線粒體:能量制造工廠
1890年,,R·阿爾塔曼(Altaman)首次發(fā)現(xiàn)線粒體。線粒體是一種微型器官——通常稱之為“細胞器”,它存在于從酵母菌到人類的所有真核細胞中,。細胞必須有能量的供給才會有活性,,線粒體就是細胞中制造能量的器官,,科學家因此給線粒體起了一個別名叫做“powerhouse”,,即細胞的“發(fā)電廠”。
生命每時每刻都在呼吸,,目的是把氧氣吸入體內(nèi)用于制造生物體可利用的能量分子ATP,。線粒體利用氧氣制造能量的過程類似于發(fā)電廠燃燒煤發(fā)電。線粒體內(nèi)有兩個主要部件參與能量的制造,,一個部件叫做呼吸鏈,,它直接利用氧氣把食物“燃燒”———即細胞內(nèi)氧化磷酸化,把食物中儲存的經(jīng)過光合作用固化下來的太陽能釋放出來,;另一個部件叫做三磷酸腺苷酶(簡稱ATP酶),,ATP酶本質(zhì)上是一個可以發(fā)電的分子馬達,像鍋爐燃煤推動發(fā)電機轉(zhuǎn)動產(chǎn)生電流一樣,,固化的太陽能釋放出來推動分子馬達的轉(zhuǎn)動以制造能量分子ATP,。線粒體不斷制造ATP分子是維持生命活力所必需的。
在生物體內(nèi)一系列正常的生物過程,,以及異常的發(fā)病過程(如糖尿?。┲校€粒體也扮演了重要的角色,。
蛋白質(zhì)清單:有待發(fā)掘的寶庫
繼1963年S·納斯(Nass)發(fā)現(xiàn)線粒體DNA(mtDNA)后,,科學家又在線粒體中發(fā)現(xiàn)了RNA、tRNA,、DNA聚合酶,、RNA聚合酶核糖體、氨基酸活化酶等進行DNA復制,、轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)翻譯的全套裝備,,說明線粒體具有獨立的遺傳體系。不過,,雖然線粒體也能合成蛋白質(zhì),,但是合成能力有限。線粒體約1200種蛋白質(zhì)中,,自身合成的僅十余種,。線粒體的核糖體蛋白和許多結構蛋白,都是核基因編碼,,在細胞質(zhì)中合成后定向轉(zhuǎn)運到線粒體的,,因此線粒體被稱為半自主細胞器。
即使現(xiàn)在已經(jīng)有大量的基因組序列數(shù)據(jù),,科學家還是不能確認,,究竟是哪些基因主宰了大約1200個讓線粒體發(fā)揮功能的蛋白質(zhì)的編碼,。在線粒體中起作用的究竟是哪些蛋白質(zhì)?這是多年來細胞生物學中一直未能回答的一個基本問題,。
論文作者之一,,布羅德研究院蛋白質(zhì)組學研究平臺主任史蒂夫?卡爾則表示,能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)進行大規(guī)模測量的技術和分析方法正在改變著科學家對人類生物學的研究,。利用這種技術,,他們對從14種不同的老鼠組織中分離出的線粒體進行了研究。這是迄今為止科學家完成的對一種細胞器進行的最全面的蛋白質(zhì)組學分析,。
研究人員一共鑒定了1098個線粒體蛋白質(zhì),,并將它們組成了一個名為“MitoCarta”的蛋白質(zhì)庫,這個庫將對所有科研人員開放,。領導此項研究的哈佛醫(yī)學院助理教授范思·穆薩指出,,這個線粒體“蛋白質(zhì)清單”的創(chuàng)建,將有助于研究者更好地理解線粒體生物學和線粒體疾病,。
讓致病真兇無所遁形
值得指出的是,,在這個清單中有大約三分之一的蛋白質(zhì)以前是從未和細胞器聯(lián)系在一起的。為了進一步研究這些新發(fā)現(xiàn)的線粒體蛋白質(zhì)的功能,,研究人員對幾百個物種——從人類,、魚類到真菌和細菌——中對應的基因序列進行了比對。穆薩說:“在進化過程中,,功能相同的蛋白質(zhì)通常擁有相似的歷史,,它們往往是集體性獲得或消失。我們就是利用這種進化趨勢來破譯這些線粒體蛋白質(zhì)是如何發(fā)揮功能的,。”
研究人員從進化的角度對細胞器的蛋白質(zhì)進行了仔細檢測,,并且驚奇地發(fā)現(xiàn),一組關鍵的線粒體蛋白質(zhì)從幾種單細胞物種中消失了,。在擁有它們的有機物(包括人類和其它哺乳動物)中,,這些蛋白質(zhì)組成了一個靴子狀的多蛋白結構,稱為“復合物I”,,它是能量產(chǎn)生過程中一個關鍵步驟的通路,。
這些發(fā)現(xiàn)不僅加深了科學家對線粒體生物學的認識,也為科學家在線粒體疾病研究方面取得突破鋪平了道路,。幾十年來,,醫(yī)學研究者已經(jīng)診斷出某些疾病源于“復合物I”型缺陷,這些缺陷是遺傳性的,,會影響到五千分之一的新生嬰兒,,在嬰兒生長的最初幾年有可能是致命的,但是致病基因卻一直沒有找到。借由“MitoCarta”蛋白質(zhì)庫以及其相應的進化分析,,澳大利亞墨爾本大學和皇家兒童醫(yī)院的研究者最近確認,,在一個名為C8orf38新基因中的一個突變,就是導致“復合物I”型疾病的元兇,。
穆薩認為,,這個蛋白質(zhì)清單,不僅對一些罕見的新陳代謝疾病的治療,,也為那些常見病的治療開啟了一扇希望之窗,。(生物谷Bioon.com)