1.如果誘餌蛋白對酵母細胞是有毒的,,該怎么辦,?
在某些情況下,,在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)不好的菌珠可以在固體培養(yǎng)基上生長得很好。首先重懸克隆于1ml的SD/–Trp,,接著將重懸液平鋪于5 個100-mm的SD/–Trp平板,,在30℃下溫浴,直至平板上的克隆相互粘在一起,。用5ml 0.5X YPDA刮下每塊板上的克隆,,并收集到一管中,這樣就可以使用這個細胞重懸液進行正常的雜交反應,。
2.如果誘餌蛋白能直接激活報告基因的表達,,該如何處理?
該蛋白很可能有轉錄激活域,,是個轉錄因子,。可以通過基因重組切掉轉錄激活域,,然后重新檢測其是否自激活,,但要注意重組也有可能破壞蛋白之間的互作。
3.轉化效率太低怎么辦,?
可以采用以下方法解決:
1) 檢測一下DNA的純度,,如果可以的話,重新用乙醇純化,。
2) DNA-BD/誘餌蛋白很可能是有毒的,。
3) 不適當的培養(yǎng)基,重新配制培養(yǎng)基,,并做對照轉化,。
4) 檢測pGBT9對照載體的轉化效率,放置于SD/–Trp平板上,,轉化效率應該在1 x 105 colonies/mg DNA以上,。
4.雜交效率不高,該如何處理,?
在雜交中,,預轉化的誘餌細胞的數量可能不夠。當對誘餌菌株進行液體培養(yǎng)過夜時,應挑選大的,、新鮮的克隆進行培養(yǎng),,經過離心和重懸后,再使用血球計對細胞進行計數,。密度應該在1 x 109/ml,。
一個甚至兩個融合蛋白對酵母細胞有毒。你可以通過重組方法來減輕毒性,,同時又能保證蛋白的相互作用,。或者使用表達水平較低的載體,。也可以在瓊脂平板或濾膜上進行雜交,。但同時必須作雜交對照實驗。