所謂的Lexical Bias又稱為L(zhǎng)exical trend,,在我們分析芯片數(shù)據(jù)聚類(lèi)分析結(jié)果時(shí),那些處于同一代謝路徑或?qū)崿F(xiàn)同一代謝功能的基因經(jīng)常被發(fā)現(xiàn)是共調(diào)節(jié)的,,研究者稱之為L(zhǎng)exial trend在分析Lexial trend結(jié)果時(shí)去除假陽(yáng)性結(jié)果是非常重要的,,因?yàn)橹挥姓嬲慕Y(jié)果才對(duì)未來(lái)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有所幫助。現(xiàn)在已經(jīng)有一系列的復(fù)雜方法用于Lexial trends的顯著性分析,。比方說(shuō)在分析之前先進(jìn)行功能聚類(lèi),,或者利用Medline進(jìn)行文獻(xiàn)發(fā)掘等等,但是這些方法都有明顯的缺陷,,并且對(duì)普通的非專業(yè)的人員來(lái)講可操作性比較差,。
本文的作者發(fā)展了一種名為L(zhǎng)ACK的分析方法來(lái)計(jì)算芯片數(shù)據(jù)集合中可能的lexial bias的統(tǒng)計(jì)顯著性,。他們的軟件以軟件包形式發(fā)布(包含perl源碼),不需要使用者具有生物信息學(xué)知識(shí)就可應(yīng)用,。
作者應(yīng)用該軟件進(jìn)行了實(shí)際分析,,取得了不錯(cuò)的結(jié)果。
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