來自于最近SCIENCE的文章,,本期SCIENCE的主題就是biological imaging,本文則是探討如何將生物信息學(xué)技術(shù)應(yīng)用于這項(xiàng)工作中去的開拓性文章,,相信對(duì)大家會(huì)有啟發(fā)。
生物顯像(Biological imaging)技術(shù)現(xiàn)在是探測(cè)細(xì)胞結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)的重要的數(shù)量分析工具,,并且被越來越多的用于基于細(xì)胞的掃描(cell-based)工作,。然而,對(duì)應(yīng)的進(jìn)行數(shù)據(jù)圖象分析工作的生物信息學(xué)工具還不成熟,。
本文的作者發(fā)展了一種名為Open Microscopy Environment (OME)的系統(tǒng),作為顯微圖象存儲(chǔ)和分析的信息學(xué)工具,。OME的目標(biāo)是自動(dòng)化圖象分析,、建模,在大量圖象中進(jìn)行數(shù)據(jù)整理,、發(fā)掘工作,。OME系統(tǒng)采用彈性的數(shù)據(jù)模型,關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)和以XML編寫的文檔,,這使得OME可以很容易與其他軟件工具進(jìn)行整合,。作者認(rèn)為,通過這樣的設(shè)計(jì),,OME使得顯像信息學(xué)的發(fā)展邁出了重要的第一步,。