生物谷報道:正當(dāng)利用基因表達(dá)譜(gene expression profiling)評定癌癥預(yù)后(Cancer Prognosis)即將取得重大突破的時候,美國馬約醫(yī)學(xué)中心(Mayo Clinic)研究人員對現(xiàn)有肺癌研究進(jìn)行了回顧和分析,,發(fā)現(xiàn)這種技術(shù)的精確性并不比傳統(tǒng)方法高,。文章刊登于11月《Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention 》(CEBP)雜志。文章第一作者為孫致富(Zhifu Sun)博士,。
自從2003年人類基因組計劃完成以來,醫(yī)學(xué)科研人員對基因表達(dá)譜的興趣以及掌握的技術(shù)越來越高。但專家謹(jǐn)慎地表示基因表達(dá)譜科學(xué),,這種醫(yī)學(xué)科研人員對細(xì)胞遺傳信號進(jìn)行檢測的科學(xué),還不成熟,,特別對于肺癌來說還處于嬰兒期,。
“越來越多的實驗顯示基因基礎(chǔ)的預(yù)報并不穩(wěn)定,與已經(jīng)掌握的臨床和病理預(yù)報器相比,,(我們)對基因表達(dá)譜的預(yù)報能力知道的太少了,,”文章訊作者、Mayo Clinic健康科學(xué)部研究員楊平(Ping Yang,,音譯)博士說,。
楊博士說當(dāng)基因表達(dá)譜被成功應(yīng)用于腫瘤分類,、評估腫瘤階段、癌癥轉(zhuǎn)移和患者生存率的同時,,有實驗證明,,以基因為基礎(chǔ)預(yù)報肺癌,是不完全可靠的,。然而還是有一些結(jié)果顯示了希望:基因圖譜可有效預(yù)報肺腺癌(lung adenocarcinoma)患者的存活率,,準(zhǔn)確度與已經(jīng)確立的預(yù)報器相似。
傳統(tǒng)方法涉及因素包括年齡,、性別,、癌癥發(fā)展階段、細(xì)胞類型和腫瘤級別等,,其檢測結(jié)果比基因表達(dá)譜檢測結(jié)果準(zhǔn)確,。“任何新技術(shù)假如沒有超過價格低廉、操作簡單的傳統(tǒng)途徑的重要優(yōu)勢話,,很難在臨床實踐中被普及,。”
很少有研究將診斷肺癌的傳統(tǒng)方法和基因圖譜進(jìn)行對比。于是孫等想知道診斷肺癌的基因表達(dá)譜是否可以取代或者輔助現(xiàn)有的評估工具,,更進(jìn)一步說是否有利于癌癥治療,。
依據(jù)基因表達(dá)譜在肺癌研究中出現(xiàn)的問題,文章作者發(fā)現(xiàn):
1 以基因表達(dá)為基礎(chǔ)的結(jié)果,,預(yù)告準(zhǔn)確性在不同的研究中變化很大
2 大多數(shù)研究缺乏獨立確認(rèn)(independent validation)
3 在基因表達(dá)譜和病理特征之間的臨床結(jié)果預(yù)告,,重疊明顯
4 支持基因高水平表達(dá)或基因高差異表達(dá)的當(dāng)前分析法則,大多數(shù)與腫瘤分化有關(guān),,不與臨床結(jié)果有關(guān),;相反,基因低水平表達(dá)或者差異不大的表達(dá)都被忽略,,而這些有可能是與臨床問題主要相關(guān)的生理學(xué)信號,。
文章作者建議從事于基因表達(dá)譜的醫(yī)學(xué)科研人員:
1 明確定義研究目的。微列陣研究應(yīng)該給出各種臨床結(jié)果的分子解釋,,因為有時會遇到一組具有相似臨床表現(xiàn)和病理學(xué)特征的患者,。
2 設(shè)計、對比選擇研究方案(alternative study designs)
3 依據(jù)大小,、質(zhì)量,、明確的臨床結(jié)果仔細(xì)選擇樣本
4 清楚DNA微列陣的局限性
5 依據(jù)研究結(jié)果做出臨床相關(guān)的解釋,并將評價添加到實踐中,。