生物谷報(bào)道:對(duì)于錯(cuò)配堿基的切除和修復(fù)是細(xì)胞的必需功能之一。在本期的《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)雜志上,, 來自杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)系,,霍華德休斯醫(yī)學(xué)院HHMI的研究人員在這一方面又獲得進(jìn)一步的研究進(jìn)展,,他們發(fā)現(xiàn)一種DNA雙螺旋上的蛋白阻礙物,這種蛋白能擾亂修復(fù)過程,,從而排除了一些考慮的模式,。
DNA修復(fù)(DNA repair)指雙鏈DNA上的損傷得到修復(fù)的現(xiàn)象。這種反應(yīng)可能使DNA結(jié)構(gòu)恢復(fù)原樣,,重新能執(zhí)行它原來的功能,;但有時(shí)并非能完全消除DNA的損傷,只是使細(xì)胞能夠耐受這DNA的損傷而能繼續(xù)生存,。也許這未能完全修復(fù)而存留下來的損傷會(huì)在適合的條件下顯示出來(如細(xì)胞的癌變等),,但如果細(xì)胞不具備這修復(fù)功能,就無法對(duì)付經(jīng)常在發(fā)生的DNA損傷事件,,就不能生存,。所以研究DNA修復(fù)也是探索生命的一個(gè)重要方面,,而且與軍事醫(yī)學(xué),、腫瘤學(xué)等密切相關(guān)。對(duì)不同的DNA損傷,,細(xì)胞可以有不同的修復(fù)反應(yīng),。
現(xiàn)在已知在生物體中有三種DNA的修復(fù):(1)光恢復(fù)修復(fù):由紫外線所造成的DNA損傷(胸腺嘧啶二聚體),由于光恢復(fù)酶的催化,,在可見光照射后恢復(fù)成完整無損的狀態(tài),。(2)切除修復(fù):嘧啶二聚體或某種堿基損傷可以被切除。然后通過相對(duì)的一條完整無損的DNA鏈作為模板重新進(jìn)行合成,,在這個(gè)被切除的部分中填上正常的堿基排列,。在大腸桿菌中切除修復(fù)是由內(nèi)切核酸修復(fù)酶,DNA多聚酶I.DNA連接酶依次地進(jìn)行作用的結(jié)果,。(3)重組修復(fù):盡管雙鏈DNA上發(fā)生了損傷(這種修復(fù)可以修復(fù)以下多種損傷),,但生物還是能夠形成完整無損的后代DNA,這是生物的耐受性(tolerance)之一,。由于DNA上發(fā)生損傷,,在以它作為模板所 產(chǎn)生的新的DNA中,相對(duì)原來發(fā)生損傷的地方就會(huì)出現(xiàn)缺口,從原來另一條完整無損的鏈(sister strand)上可以切下相應(yīng)的核苷酸部分填到這個(gè)缺口中去,,這就是重組修復(fù)的機(jī)制,。除上述這些修復(fù)機(jī)制以外,似乎還存在著例如重新合成修復(fù)(de novo synthesis repair),、再結(jié)合修復(fù)等等的DNA的修復(fù)機(jī)制,。即使在上述的修復(fù)現(xiàn)象中,其分子機(jī)制的細(xì)節(jié)也隨生物種類的不同而有相當(dāng)?shù)牟顒e,。盡管如此,,不過幾乎所有的生物.從病毒到人都具有DNA修復(fù)的能力。已知缺乏切除修復(fù)的突變體對(duì)射線和化學(xué)誘變劑具有非常高的敏感性,,此外突變和癌變的頻度也會(huì)增高.但是重組修復(fù)有缺乏時(shí),,射線和化學(xué)誘變劑不能誘發(fā)它們產(chǎn)生突變。
DNA錯(cuò)配修復(fù)是細(xì)胞復(fù)制后的一種修復(fù)機(jī)制,具有維持DNA復(fù)制保真度,控制基因變異的作用,。DNA錯(cuò)配修復(fù)缺陷使整個(gè)基因組不穩(wěn)定,,最終會(huì)導(dǎo)致腫瘤和癌癥的發(fā)生。DNA錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)不僅通過矯正在DNA重組和復(fù)制過程中產(chǎn)生的堿基錯(cuò)配而保持基因組的穩(wěn)定,而且通過誘導(dǎo)DNA損傷細(xì)胞的凋亡而消除由突變細(xì)胞生長形成的癌變,。錯(cuò)配修復(fù)缺陷細(xì)胞的抗藥性也引起了癌癥化療研究方面的關(guān)注,。大多數(shù)情況下,錯(cuò)配修復(fù)健全型細(xì)胞對(duì)腫瘤化療藥物敏感,,而錯(cuò)配修復(fù)缺陷細(xì)胞卻有較高的抗性,。DNA錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)通過修復(fù)和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡維護(hù)基因組穩(wěn)定的功能,顯示了錯(cuò)配修復(fù)途徑在癌癥生物學(xué)和分子醫(yī)學(xué)中的重要性。
對(duì)于錯(cuò)配堿基的切除和修復(fù)是細(xì)胞的必需功能之一,,已經(jīng)有了幾種模式來描繪半甲基化(hemimethylated)的脫氧核糖核酸——d(GATC)序列是如何在一個(gè)錯(cuò)配的任一邊,,以1000bp或更遠(yuǎn)的距離來知道大腸桿菌錯(cuò)配修復(fù)的。
Anna Pluciennik和Paul Modrich這兩個(gè)研究人員報(bào)道了一種DNA雙螺旋上的蛋白阻礙物,,這種蛋白能擾亂修復(fù)過程,,從而排除了一些考慮的模式。研究人員在一個(gè)d(GATC)序列和一個(gè)錯(cuò)配之間的雙螺旋上放置了一個(gè)水解缺陷型EcoRI內(nèi)切酶,,用以阻止雙螺旋上信號(hào)傳遞,。
這種阻礙蛋白在高至80%的時(shí)間里都抑制MutH內(nèi)切酶活性,利用包含有一個(gè)錯(cuò)配和一個(gè)d(GATC)位點(diǎn)的環(huán)狀DNA,,研究人員也發(fā)現(xiàn)雙螺旋上的一個(gè)定位在阻礙MutH活性的兩個(gè)位點(diǎn)之間更短的那條途徑上break,,而且這個(gè)break在長一點(diǎn)的那條信號(hào)途徑中并沒有出現(xiàn)。因此作者認(rèn)為信號(hào)是沿著雙螺旋contour進(jìn)行傳遞的,,而且DNA的柔軟性可能在其中并沒有起到什么作用,。
同期在Science雜志上,來自瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)細(xì)胞分裂前,,一個(gè)DNA分子將會(huì)被復(fù)制成兩個(gè),,并通過一種叫做Cohesin的物質(zhì)黏合在一起,。一旦兩個(gè)DNA分子分開太早,新生成的細(xì)胞中的染色體(DNA分子的主要載體)數(shù)量就可能出現(xiàn)異常,,正像很多腫瘤細(xì)胞的染色體數(shù)量異常一樣,。
這一發(fā)現(xiàn)與通常的認(rèn)識(shí)不同,細(xì)胞會(huì)使用Cohesin來修復(fù)受損的DNA鏈,。肖格倫說,,這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)涉及到細(xì)胞最基本的工作機(jī)理,對(duì)癌癥研究無疑具有重要意義,。