生物谷報道：Affymetrix公司日前宣布說,，他們正在開發(fā)一種將DNA測序和芯片技術(shù)相結(jié)合的新技術(shù)。
該公司的主席Stephen Fodor在JPMorgan衛(wèi)生保健會議上說,，Affy將利用新的化學(xué)知識在捕獲了部分基因組的矩陣上配置酶測序反應(yīng),，從而使得能夠同時利用聚合酶和連接酶反應(yīng)。
Fodor表示,，這種新技術(shù)是也是他們在上月以7500萬美元收購USB公司的其中一個原因,。
USB公司出售分子生物學(xué)和生物化學(xué)試劑產(chǎn)品。在二十世紀八十年代,，該公司開始出售Sequenase DNA聚合酶和DNA測序試劑盒,。
Fodor沒有公布有關(guān)用于這個新系統(tǒng)的測序化學(xué)的進一步細節(jié)內(nèi)容以及Affy計劃何時制造出一個新的測序產(chǎn)品。Fodor表示,，這種技術(shù)提供的酶序列數(shù)據(jù)江能夠用于新的芯片產(chǎn)品,。
Fodor還提及Affy公司計劃今年上半年內(nèi)向市場投放一套超高分辨率拷貝數(shù)變異CHIPS。這套三芯片產(chǎn)品中每個芯片都含有人類基因必須部分的1000完歌50-mer探針，總共覆蓋了15億個堿基對,。
另外,，在2006年初，Affymetrix公司推出了GeneChip（R）人類和鼠源嵌合芯片（Tiling Array）系列產(chǎn)品,，這是目前市面上唯一商業(yè)化的全基因組轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物作圖芯片,。這系列芯片研究范圍大大超出已知編碼蛋白序列，可以對整個人類和小鼠基因組進行系統(tǒng)的研究,。研究人員可以利用這一芯片對轉(zhuǎn)錄因子和其它蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域進行研究,。最近更有研究人員利用Affymetrix的嵌合芯片在過去認為是垃圾DNA的區(qū)域中間找到了許多以前從未發(fā)現(xiàn)過的轉(zhuǎn)錄活性區(qū)域。
Affymetrix公司是目前全球基因芯片行業(yè)的領(lǐng)頭羊,。它從1994年起就開始提供商業(yè)化的芯片產(chǎn)品,。Affymetrix以其專利的寡聚核苷酸原位光刻合成技術(shù)，年產(chǎn)各類寡聚核苷酸基因芯片達到幾十萬張,，占據(jù)了表達譜基因芯片科研市場的一半以上,，經(jīng)過了將近十年的研究和開發(fā)，已經(jīng)在國際上贏得了很高的盛譽,，同時也成為為數(shù)極少的已經(jīng)盈利的生物芯片公司,。
2007年4月，Affymetrix公司宣布將啟動一項計劃,，以資助歐洲研究中心的芯片相關(guān)癌癥研究,。通過癌癥研究項目的合作，Affymetrix公司表示,，它將給予一些利用一系列芯片應(yīng)用研究項目和致力于了解和發(fā)現(xiàn)10種類型癌癥的項目經(jīng)費支持,。這項研究計劃將在歐洲的數(shù)個學(xué)術(shù)研究機構(gòu)執(zhí)行。該公司表示,，這些研究計劃將利用芯片進行拷貝數(shù)分析,、基因表達分析和染色質(zhì)免疫沉淀分析和拼接模式分析。 Affy還表示,，它將幫助研究人員獲得工具和培訓(xùn),，并且還將會舉辦論壇以促進研究人員之間的信息交流、分享實踐經(jīng)驗,。
參與這些研究計劃的研究人員將會對白血病,、乳腺癌、肺癌,、前列腺癌,、甲狀腺癌、皮膚癌和其他器官癌癥進行研究,。 Affy表示,，這些研究的結(jié)果將會在今年年底由它發(fā)起的會議上公布。該公司還計劃在2007年將這項研究計劃拓展到日本和北美地區(qū)的研究機構(gòu)。
另外,，2006年12月,，美一法院文件公布，安捷倫公司和Affymetrix公司就之前美國專利商標局USPTO (The US Patent and Trademark Office) 的專利紛爭達成了共識,。在美國加利福尼亞北部地方法院的文件中提到,，Affymetrix和安捷倫公司的代表同意到2007年11月1日將進行一個替代性糾紛解決（alternative dispute）庭議。
從1997年起,，各地陸續(xù)爆發(fā)了幾十件生物芯片專利糾紛,，其中頗受矚目的有Affymetrix和Hyseq公司的訴訟案，Affymetrix公司和Incyte基因組公司案,，以及Affymetrix公司與牛津基因技術(shù)有限公司的案件,。2006年11月,，安捷倫要求美一法院重新審議有關(guān)USPTO的“一Affymetrix專利申請并沒有觸犯到現(xiàn)存的安捷倫專利”的決議,，安捷倫認為Affy的美國專利號為No.10/619,224的專利申請是安捷倫在2003年2月獲得的No.6,513,968號專利的“literally copying”。
在Affy向USPTO提出專利申請之后,，安捷倫發(fā)出了申辯,，但是USPTO認為Affy的申請是有效的，并且取消了安捷倫幾個968號專利的的聲明,。11月安捷倫重新提出訴訟,，Affy公司回應(yīng)表示10/619,224專利申請是其早于安捷倫公司提出的一系列申請中的一個，而且也提到“USPTO認為Affy最早的申請比安捷倫的要早三年多”,。
