生物谷報道:Affymetrix公司日前宣布說,,他們正在開發(fā)一種將DNA測序和芯片技術相結合的新技術,。
該公司的主席Stephen Fodor在JPMorgan衛(wèi)生保健會議上說,,Affy將利用新的化學知識在捕獲了部分基因組的矩陣上配置酶測序反應,,從而使得能夠同時利用聚合酶和連接酶反應,。
Fodor表示,,這種新技術是也是他們在上月以7500萬美元收購USB公司的其中一個原因,。
USB公司出售分子生物學和生物化學試劑產(chǎn)品,。在二十世紀八十年代,該公司開始出售Sequenase DNA聚合酶和DNA測序試劑盒,。
Fodor沒有公布有關用于這個新系統(tǒng)的測序化學的進一步細節(jié)內容以及Affy計劃何時制造出一個新的測序產(chǎn)品,。Fodor表示,這種技術提供的酶序列數(shù)據(jù)江能夠用于新的芯片產(chǎn)品,。
Fodor還提及Affy公司計劃今年上半年內向市場投放一套超高分辨率拷貝數(shù)變異CHIPS,。這套三芯片產(chǎn)品中每個芯片都含有人類基因必須部分的1000完歌50-mer探針,總共覆蓋了15億個堿基對,。
另外,,在2006年初,Affymetrix公司推出了GeneChip(R)人類和鼠源嵌合芯片(Tiling Array)系列產(chǎn)品,,這是目前市面上唯一商業(yè)化的全基因組轉錄產(chǎn)物作圖芯片,。這系列芯片研究范圍大大超出已知編碼蛋白序列,可以對整個人類和小鼠基因組進行系統(tǒng)的研究,。研究人員可以利用這一芯片對轉錄因子和其它蛋白結合結構域進行研究,。最近更有研究人員利用Affymetrix的嵌合芯片在過去認為是垃圾DNA的區(qū)域中間找到了許多以前從未發(fā)現(xiàn)過的轉錄活性區(qū)域。
Affymetrix公司是目前全球基因芯片行業(yè)的領頭羊,。它從1994年起就開始提供商業(yè)化的芯片產(chǎn)品,。Affymetrix以其專利的寡聚核苷酸原位光刻合成技術,,年產(chǎn)各類寡聚核苷酸基因芯片達到幾十萬張,占據(jù)了表達譜基因芯片科研市場的一半以上,,經(jīng)過了將近十年的研究和開發(fā),,已經(jīng)在國際上贏得了很高的盛譽,同時也成為為數(shù)極少的已經(jīng)盈利的生物芯片公司,。
2007年4月,,Affymetrix公司宣布將啟動一項計劃,以資助歐洲研究中心的芯片相關癌癥研究,。通過癌癥研究項目的合作,,Affymetrix公司表示,它將給予一些利用一系列芯片應用研究項目和致力于了解和發(fā)現(xiàn)10種類型癌癥的項目經(jīng)費支持,。這項研究計劃將在歐洲的數(shù)個學術研究機構執(zhí)行,。該公司表示,這些研究計劃將利用芯片進行拷貝數(shù)分析,、基因表達分析和染色質免疫沉淀分析和拼接模式分析,。 Affy還表示,它將幫助研究人員獲得工具和培訓,,并且還將會舉辦論壇以促進研究人員之間的信息交流,、分享實踐經(jīng)驗。
參與這些研究計劃的研究人員將會對白血病,、乳腺癌,、肺癌、前列腺癌,、甲狀腺癌,、皮膚癌和其他器官癌癥進行研究。 Affy表示,,這些研究的結果將會在今年年底由它發(fā)起的會議上公布,。該公司還計劃在2007年將這項研究計劃拓展到日本和北美地區(qū)的研究機構。
另外,,2006年12月,,美一法院文件公布,安捷倫公司和Affymetrix公司就之前美國專利商標局USPTO (The US Patent and Trademark Office) 的專利紛爭達成了共識,。在美國加利福尼亞北部地方法院的文件中提到,,Affymetrix和安捷倫公司的代表同意到2007年11月1日將進行一個替代性糾紛解決(alternative dispute)庭議。
從1997年起,,各地陸續(xù)爆發(fā)了幾十件生物芯片專利糾紛,,其中頗受矚目的有Affymetrix和Hyseq公司的訴訟案,Affymetrix公司和Incyte基因組公司案,以及Affymetrix公司與牛津基因技術有限公司的案件,。2006年11月,,安捷倫要求美一法院重新審議有關USPTO的“一Affymetrix專利申請并沒有觸犯到現(xiàn)存的安捷倫專利”的決議,安捷倫認為Affy的美國專利號為No.10/619,224的專利申請是安捷倫在2003年2月獲得的No.6,513,968號專利的“literally copying”,。
在Affy向USPTO提出專利申請之后,,安捷倫發(fā)出了申辯,但是USPTO認為Affy的申請是有效的,,并且取消了安捷倫幾個968號專利的的聲明,。11月安捷倫重新提出訴訟,Affy公司回應表示10/619,224專利申請是其早于安捷倫公司提出的一系列申請中的一個,,而且也提到“USPTO認為Affy最早的申請比安捷倫的要早三年多”,。