生物谷報(bào)道：Affymetrix公司日前宣布說,，他們正在開發(fā)一種將DNA測(cè)序和芯片技術(shù)相結(jié)合的新技術(shù),。
該公司的主席Stephen Fodor在JPMorgan衛(wèi)生保健會(huì)議上說，Affy將利用新的化學(xué)知識(shí)在捕獲了部分基因組的矩陣上配置酶測(cè)序反應(yīng),，從而使得能夠同時(shí)利用聚合酶和連接酶反應(yīng),。
Fodor表示，這種新技術(shù)是也是他們?cè)谏显乱?500萬(wàn)美元收購(gòu)USB公司的其中一個(gè)原因,。
USB公司出售分子生物學(xué)和生物化學(xué)試劑產(chǎn)品,。在二十世紀(jì)八十年代，該公司開始出售Sequenase DNA聚合酶和DNA測(cè)序試劑盒,。
Fodor沒有公布有關(guān)用于這個(gè)新系統(tǒng)的測(cè)序化學(xué)的進(jìn)一步細(xì)節(jié)內(nèi)容以及Affy計(jì)劃何時(shí)制造出一個(gè)新的測(cè)序產(chǎn)品,。Fodor表示，這種技術(shù)提供的酶序列數(shù)據(jù)江能夠用于新的芯片產(chǎn)品,。
Fodor還提及Affy公司計(jì)劃今年上半年內(nèi)向市場(chǎng)投放一套超高分辨率拷貝數(shù)變異CHIPS,。這套三芯片產(chǎn)品中每個(gè)芯片都含有人類基因必須部分的1000完歌50-mer探針，總共覆蓋了15億個(gè)堿基對(duì),。
另外,，在2006年初，Affymetrix公司推出了GeneChip（R）人類和鼠源嵌合芯片（Tiling Array）系列產(chǎn)品,，這是目前市面上唯一商業(yè)化的全基因組轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物作圖芯片,。這系列芯片研究范圍大大超出已知編碼蛋白序列，可以對(duì)整個(gè)人類和小鼠基因組進(jìn)行系統(tǒng)的研究,。研究人員可以利用這一芯片對(duì)轉(zhuǎn)錄因子和其它蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域進(jìn)行研究,。最近更有研究人員利用Affymetrix的嵌合芯片在過去認(rèn)為是垃圾DNA的區(qū)域中間找到了許多以前從未發(fā)現(xiàn)過的轉(zhuǎn)錄活性區(qū)域。
Affymetrix公司是目前全球基因芯片行業(yè)的領(lǐng)頭羊,。它從1994年起就開始提供商業(yè)化的芯片產(chǎn)品,。Affymetrix以其專利的寡聚核苷酸原位光刻合成技術(shù)，年產(chǎn)各類寡聚核苷酸基因芯片達(dá)到幾十萬(wàn)張,，占據(jù)了表達(dá)譜基因芯片科研市場(chǎng)的一半以上,，經(jīng)過了將近十年的研究和開發(fā)，已經(jīng)在國(guó)際上贏得了很高的盛譽(yù),，同時(shí)也成為為數(shù)極少的已經(jīng)盈利的生物芯片公司,。
2007年4月，Affymetrix公司宣布將啟動(dòng)一項(xiàng)計(jì)劃,，以資助歐洲研究中心的芯片相關(guān)癌癥研究,。通過癌癥研究項(xiàng)目的合作,，Affymetrix公司表示，它將給予一些利用一系列芯片應(yīng)用研究項(xiàng)目和致力于了解和發(fā)現(xiàn)10種類型癌癥的項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)支持,。這項(xiàng)研究計(jì)劃將在歐洲的數(shù)個(gè)學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)執(zhí)行,。該公司表示，這些研究計(jì)劃將利用芯片進(jìn)行拷貝數(shù)分析,、基因表達(dá)分析和染色質(zhì)免疫沉淀分析和拼接模式分析。 Affy還表示,，它將幫助研究人員獲得工具和培訓(xùn),，并且還將會(huì)舉辦論壇以促進(jìn)研究人員之間的信息交流、分享實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),。
參與這些研究計(jì)劃的研究人員將會(huì)對(duì)白血病,、乳腺癌、肺癌,、前列腺癌,、甲狀腺癌、皮膚癌和其他器官癌癥進(jìn)行研究,。 Affy表示,，這些研究的結(jié)果將會(huì)在今年年底由它發(fā)起的會(huì)議上公布。該公司還計(jì)劃在2007年將這項(xiàng)研究計(jì)劃拓展到日本和北美地區(qū)的研究機(jī)構(gòu),。
另外,，2006年12月，美一法院文件公布,，安捷倫公司和Affymetrix公司就之前美國(guó)專利商標(biāo)局USPTO (The US Patent and Trademark Office) 的專利紛爭(zhēng)達(dá)成了共識(shí),。在美國(guó)加利福尼亞北部地方法院的文件中提到，Affymetrix和安捷倫公司的代表同意到2007年11月1日將進(jìn)行一個(gè)替代性糾紛解決（alternative dispute）庭議,。
從1997年起,，各地陸續(xù)爆發(fā)了幾十件生物芯片專利糾紛，其中頗受矚目的有Affymetrix和Hyseq公司的訴訟案,，Affymetrix公司和Incyte基因組公司案,，以及Affymetrix公司與牛津基因技術(shù)有限公司的案件。2006年11月,，安捷倫要求美一法院重新審議有關(guān)USPTO的“一Affymetrix專利申請(qǐng)并沒有觸犯到現(xiàn)存的安捷倫專利”的決議,，安捷倫認(rèn)為Affy的美國(guó)專利號(hào)為No.10/619,224的專利申請(qǐng)是安捷倫在2003年2月獲得的No.6,513,968號(hào)專利的“literally copying”。
在Affy向USPTO提出專利申請(qǐng)之后,，安捷倫發(fā)出了申辯,，但是USPTO認(rèn)為Affy的申請(qǐng)是有效的，并且取消了安捷倫幾個(gè)968號(hào)專利的的聲明,。11月安捷倫重新提出訴訟,，Affy公司回應(yīng)表示10/619,224專利申請(qǐng)是其早于安捷倫公司提出的一系列申請(qǐng)中的一個(gè),，而且也提到“USPTO認(rèn)為Affy最早的申請(qǐng)比安捷倫的要早三年多”。
