■本報(bào)記者 王靜
 
9月的北京,，終于迎來(lái)了秋高氣爽的好天氣。這幾天,，中科院微生物所博士生楊犀的心情,，正如這愜意的天氣一樣，變得明亮起來(lái),。
 
兩年多來(lái),，每天走進(jìn)實(shí)驗(yàn)室，他要面對(duì)計(jì)算機(jī)屏幕上成千上萬(wàn)個(gè)腸道微生物不同基因的組合條碼，分辨其不同之處,，并提取相同的點(diǎn)位,。這一度讓他和師兄胡永飛以及導(dǎo)師朱寶利煩悶之極。
 
直到剛剛過(guò)去的8月底,，枯燥的組合字母終于放射出喜悅的光芒,。他們?cè)趪?guó)際上首次鑒別出人體腸道中的1093個(gè)耐藥基因，研究成果在《自然—通訊》雜志上發(fā)表,。
 
驅(qū)散耐藥迷霧
 
“人體腸道中棲息著種類繁多的微生物,，其數(shù)量超過(guò)人體自身細(xì)胞的10倍以上。這些微生物的基因組蘊(yùn)含著大量的遺傳信息,，被學(xué)術(shù)界稱為‘人體的第二個(gè)基因組’,。但這些基因組作為耐藥基因的‘儲(chǔ)存庫(kù)’并未明晰，因而成為我們努力的方向,?！敝鞂毨貞浾f(shuō)，很快他們便得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委和北京市科委的支持,。
 
胡永飛是朱寶利的助理研究員,。他告訴記者，兩年前,，為了弄清人體腸道微生物的耐藥基因,，課題組與華大基因合作，獲得了丹麥,、西班牙和中國(guó)162位健康人的腸道微生物的元基因組,。據(jù)此,，課題組首先建立了一個(gè)含有400萬(wàn)個(gè)人體腸道微生物基因的數(shù)據(jù)集,。
 
作為朱寶利的博士生，楊犀走進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的第一項(xiàng)任務(wù)就是,，在胡永飛的指導(dǎo)下從該數(shù)據(jù)集中鑒別耐藥基因,。
 
“兩年多來(lái)，我們的很多精力都用在鑒定方法的研究和確保方法的正確上,。從海量的基因數(shù)據(jù)庫(kù)中摸索一套可靠的鑒定方法,，成為擺在我們面前的最大難題?！焙里w說(shuō),。
 
當(dāng)他們?cè)趪?guó)際上首次鑒別出了1093個(gè)耐藥基因的圖譜后，又將其分成149個(gè)不同的耐藥基因型,，進(jìn)行深入分析,。研究發(fā)現(xiàn)，中國(guó)人腸道中含有70個(gè)耐藥基因型，丹麥人45個(gè),，西班牙人49個(gè),。
 
隨后，課題組在對(duì)耐藥基因單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行分析后認(rèn)為,，中國(guó)人腸道耐藥基因之所以不同于丹麥人和西班牙人,，一方面是因?yàn)楹髢烧咄瑢贇W洲國(guó)家人口，差異可能產(chǎn)生于腸道內(nèi)細(xì)菌群的不同,；另一方面,，可能因不同地域抗生素使用不同所致。
 
四環(huán)素耐藥最普遍
 
課題組在分析中還發(fā)現(xiàn),，無(wú)論哪個(gè)國(guó)家人群,，四環(huán)素耐藥基因型的豐度都很高。為此,，他們構(gòu)建了3個(gè)健康人腸道元基因組的Fosmid文庫(kù)（20萬(wàn)克?。⒗貌煌目股貙?duì)文庫(kù)進(jìn)行篩選,。結(jié)果證實(shí),，具有四環(huán)素抗性的克隆數(shù)比例最高。
 
與此同時(shí),，課題組對(duì)歐洲20個(gè)國(guó)家近10年抗生素的使用情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析,。結(jié)果顯示，一直以來(lái),，四環(huán)素類抗生素在動(dòng)物中的使用量,，包括在畜牧養(yǎng)殖中的使用量顯著高于其他抗生素，而臨床上使用量很少,。他們據(jù)此推測(cè),，人體腸道微生物中的耐藥基因，尤其是高豐度的耐藥基因,，可能與獸用抗生素的使用量相關(guān),。
 
不過(guò)，讓朱寶利遺憾的是,，他們沒(méi)有拿到中國(guó)抗生素使用情況的官方數(shù)據(jù),。
 
與超級(jí)細(xì)菌斗爭(zhēng)
 
抗生素濫用是全球面臨的風(fēng)險(xiǎn)。2010年,，科學(xué)家分離出對(duì)所有抗生素均具有耐藥性的超級(jí)細(xì)菌——NDM-1,。這引發(fā)了人們的普遍擔(dān)憂：死亡會(huì)不會(huì)在某一天突然來(lái)襲？
 
不過(guò),，在朱寶利看來(lái),，兩年多過(guò)去了,，雖然超級(jí)細(xì)菌不斷“作案”，但他現(xiàn)在認(rèn)為“并沒(méi)有那么可怕”,。
 
“所謂耐藥基因,，是指細(xì)菌慢慢適應(yīng)藥物環(huán)境后，能與藥物的遺傳信息結(jié)合產(chǎn)生變異,。具體而言,，是指NDM-1能分解目前人類制造的所有抗生素，再經(jīng)重組,、不斷復(fù)制擴(kuò)張后產(chǎn)生抗藥性,。因此，使用抗生素越多的人或動(dòng)物,，體內(nèi)細(xì)菌的適應(yīng)性越強(qiáng),。”胡永飛介紹說(shuō),。
 
朱寶利則向記者闡述了一種對(duì)抗耐藥性的新思路：“雖然超級(jí)細(xì)菌有能力鏈接各種抗生素的基因,，但其體積也會(huì)隨之增加，達(dá)到一定程度后便不堪重負(fù),。如果每隔一段時(shí)間更換一批新的抗生素,，輪番上陣與耐藥基因?qū)梗股貞?yīng)該也能繼續(xù)發(fā)揮較好的保護(hù)作用,?！?