本報(bào)訊 (記者孫國根)中外研究人員經(jīng)3年多努力,,合作創(chuàng)建了全球首個(gè)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)的心臟細(xì)胞器蛋白質(zhì)圖譜庫,,在心臟蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)研究方面取得重要進(jìn)展,。該研究把心臟生物學(xué)基礎(chǔ)研究和臨床心臟醫(yī)學(xué)研究兩大領(lǐng)域連為一體,對(duì)促進(jìn)心臟轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究有重要意義,。相關(guān)論文近日在線發(fā)表在《循環(huán)研究》雜志上,。
蛋白質(zhì)是與生命及各種形式的生命活動(dòng)緊密聯(lián)系在一起的物質(zhì),越來越多的組學(xué)技術(shù)(基因組學(xué),、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等)研究在心血管生物領(lǐng)域中已廣泛應(yīng)用,,尤其是科學(xué)家在大規(guī)模蛋白質(zhì)組學(xué)研究中已發(fā)現(xiàn)許多以前沒有發(fā)現(xiàn)的規(guī)律,有些規(guī)律對(duì)解釋心臟細(xì)胞在生理或病理狀態(tài)下的運(yùn)作機(jī)制有重要意義,。但蛋白質(zhì)組學(xué)研究存在標(biāo)識(shí),、對(duì)比參照物不統(tǒng)一等問題,而心臟細(xì)胞器蛋白質(zhì)圖譜庫的建立將有助于解決這些難題,。
該研究由復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院特聘教授,、美國加州大學(xué)洛杉磯分校戴衛(wèi)·格芬醫(yī)學(xué)院心臟病學(xué)專家平琲琲教授及其研究團(tuán)隊(duì),與復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院心血管病研究所葛均波院士研究團(tuán)隊(duì)及歐洲生物信息學(xué)研究所等合作完成,。
論文共同第一作者,、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院心血管病研究所李華博士介紹,,全球首個(gè)心臟細(xì)胞器蛋白質(zhì)圖譜庫是一個(gè)全球共享平臺(tái),具有實(shí)時(shí)更新數(shù)據(jù)的功能,,可將不同學(xué)科間的資源進(jìn)行整理,,從而有利于研究人員在特定生物背景下從事蛋白信號(hào)通路的深入研究。心臟細(xì)胞器蛋白質(zhì)圖譜庫平臺(tái)具有三大優(yōu)勢(shì),,一是設(shè)有很多已經(jīng)整合過的重要數(shù)據(jù),,設(shè)有專為研究人員設(shè)計(jì)的寬泛、快速鑒定蛋白的搜索引擎,;二是含有一個(gè)數(shù)據(jù)庫和一套生物信息工具,,可用來整合已知生物醫(yī)學(xué)特征(如基因突變及疾病表型等);三是實(shí)時(shí)在線,,有利于研究人員高效分析,、上傳和查詢相關(guān)數(shù)據(jù)。