本報(bào)訊(記者張?chǎng)┯浾邚闹锌圃豪ッ鲃?dòng)物所了解到,在張亞平院士帶領(lǐng)下,該所彭旻晟、賀軍棟,、樊隆等人開(kāi)發(fā)出針對(duì)DNA芯片數(shù)據(jù)中Y染色體單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的分析策略。相關(guān)研究11月27日在線發(fā)表于《歐洲人類(lèi)遺傳學(xué)》,。
隨著全基因組關(guān)聯(lián)分析廣泛應(yīng)用于人類(lèi)遺傳學(xué)工作之中,相關(guān)的DNA芯片(微陣列)也不斷得到發(fā)展,。許多Y染色體單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Y-SNPs)已被整合在DNA芯片中,。然而,這些Y-SNPs數(shù)據(jù)在全基因組關(guān)聯(lián)分析中都被棄之不顧,,沒(méi)有進(jìn)行任何評(píng)估分析,。
為此,研究人員運(yùn)用開(kāi)發(fā)的分析策略對(duì)來(lái)自114個(gè)緬甸人和3個(gè)尼日利亞人共117份男性樣本DNA芯片數(shù)據(jù)中的2041個(gè)Y-SNPs進(jìn)行了評(píng)估分析,?;跀?shù)據(jù)過(guò)濾后提取出的369個(gè)Y-SNPs,研究人員構(gòu)建了Y染色體單倍型類(lèi)群樹(shù),,解析出緬甸人群的父系遺傳結(jié)構(gòu),。
該結(jié)果得到基因分型實(shí)驗(yàn)和Y染色體重測(cè)序數(shù)據(jù)的支持,表明該策略切實(shí)可行,。研究人員對(duì)分析中的數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換,、過(guò)濾和注釋處理后發(fā)現(xiàn),DNA芯片對(duì)Y-SNPs的檢測(cè)靈敏度和準(zhǔn)確性依舊有待提高,,例如:芯片廠商可依據(jù)Y染色體重測(cè)序數(shù)據(jù)重新選擇合適的Y-SNPs并設(shè)計(jì)相關(guān)探針,。