許多基因單位結(jié)合起來形成基因模塊，這些模塊共同起作用會(huì)產(chǎn)生特異性功能,，體現(xiàn)不同腫瘤的特征。但是9月26日出版的《自然遺傳學(xué)雜志》上的一項(xiàng)研究結(jié)果表明,，相同模塊會(huì)與多種不同的臨床疾病有關(guān),。
馬薩諸塞州哈佛大學(xué)的Aviv Regev博士表示，研究這些模塊的特征會(huì)有助于將微矩陣分析和臨床結(jié)合起來,。幫助癌癥基因組研究者找到癌癥診斷或者治療的新的靶位基因,。
Regev博士及其同事早已開始分析代表22種腫瘤類型的將近2000個(gè)DNA微矩陣,。他們從中找到了456個(gè)統(tǒng)計(jì)學(xué)上明顯不同的模塊，代表不同的過程和功能,，包括代謝,、轉(zhuǎn)錄、翻譯,、降解,、細(xì)胞和神經(jīng)信號(hào)、生長(zhǎng),、細(xì)胞周期,、凋亡、細(xì)胞外基質(zhì),、細(xì)胞骨架成分,。然后根據(jù)模塊組合定義臨床情況。
接下來他們構(gòu)成了癌癥的全球模塊地圖,，顯示一些模塊是腫瘤類型特異性的,。例如，血液腫瘤有類似的免疫,、炎癥,、生長(zhǎng)調(diào)節(jié)、信號(hào)模塊,，特異模式的模塊可以區(qū)分不同腫瘤類型,。
有一些模塊可見于多種腫瘤類型，提示有共同的腫瘤進(jìn)展機(jī)制,。一個(gè)重要的例子是骨母細(xì)胞模塊,，與骨形成細(xì)胞的增殖和分化有關(guān)，在乳腺癌,、肺癌,、肝癌、白血病的骨轉(zhuǎn)移中起重要作用,。
Regev博士使用抗白血病藥物格列衛(wèi)來說明模塊地圖如何應(yīng)用時(shí)表示,，格列衛(wèi)的靶位是一個(gè)眾所周知的蛋白，因此我們能夠觀察到這個(gè)蛋白出現(xiàn)什么變化,。這種蛋白屬于哪種模塊呢,？所屬模塊與多種不同種類癌癥的相關(guān)性如何？那種信息依次提示其他癌癥可能是這種藥物的一個(gè)相關(guān)靶位,。
Regev博士指出,，科學(xué)家們能夠?yàn)g覽感興趣的基因或者模塊，或者是他們正在研究的臨床疾病,。
研究小組還公布了他們使用的軟件,。Regev博士認(rèn)為,，這是一種非常快速的工具,，并且界面友好,。不需要用戶了解如何編程，并且可以重復(fù)他們?nèi)抠Y料
