多年來生物學(xué)家一直在搜尋癌細(xì)胞的弱點(diǎn),,以期找到對付癌癥的線索,。美國科學(xué)家近日研究出了一種基因組大規(guī)模篩選技術(shù),有望提供一種強(qiáng)大的經(jīng)濟(jì)有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶,。相關(guān)論文發(fā)表在2月1日的《科學(xué)》(Science)上,。
2005年,美國國立衛(wèi)生研究院斥資15億美元發(fā)起“癌癥基因組地圖”(TCGA)項(xiàng)目,,目的是搜尋在很多癌癥中發(fā)生變異的基因,。不過有很多科學(xué)家批評說,TCGA過分強(qiáng)調(diào)基因測序而忽視了功能性研究,,而后者能夠確定哪種變異是最重要的,。哈佛醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)家Stephen Elledge就是持這種觀點(diǎn)的人之一。
在最新的研究中,,Elledge和冷泉港實(shí)驗(yàn)室的分子生物學(xué)家Gregory Hannon及同事一道,,構(gòu)建了新的病毒載體,每一個(gè)載體都含有一個(gè)RNA分子,,用來關(guān)閉帶有補(bǔ)充序列的基因,。載體還帶有DNA“條形碼”,這樣研究人員稍后就能確定哪些RNA對細(xì)胞行為具有大的影響,。研究人員將大約1萬到4萬個(gè)這樣的RNA插入到乳腺癌細(xì)胞,、結(jié)腸癌及正常細(xì)胞中,主要分析了1萬個(gè)“短發(fā)夾”RNA(shRNA),,結(jié)果發(fā)現(xiàn)標(biāo)靶了大約3000種不同的基因,。
接下來就是要看哪些RNA在不影響正常細(xì)胞的情況下,,能夠減弱癌細(xì)胞的生存和增殖能力。研究人員的觀點(diǎn)是,,這些用RNA干擾發(fā)現(xiàn)的基因與癌細(xì)胞的變異相一致,,從而導(dǎo)致了不受控制的增殖。在第一遍篩選后,,研究人員發(fā)現(xiàn)了大約24個(gè)基因符合要求,。Elledge提醒說,此次研究僅僅是個(gè)開始,,以確定哪種蛋白能作為好的藥靶,。
一些科學(xué)家對這種方法充滿希望。美國波士頓Dana-Farber癌癥研究所的癌癥遺傳學(xué)家Ronald DePinho說:“我是這項(xiàng)技術(shù)的大‘粉絲’”,。他認(rèn)為,,考慮到癌癥的復(fù)雜性,有必要同時(shí)調(diào)查腫瘤細(xì)胞基因組并檢測細(xì)胞如何對基因沉默作出反應(yīng),。美國翻譯基因組學(xué)研究院(Translational Genomics Research Institute)的計(jì)算生物學(xué)家Michael Bittner則認(rèn)為,,如果這兩種方法能獨(dú)立地找出相互有關(guān)的基因,那么它將是一種非常有效的方法以決定下一步研究的優(yōu)先次序.
附:
“癌癥基因組地圖”(TCGA)項(xiàng)目網(wǎng)址: The Cancer Genome Atlas