猶他州大學(xué)Huntsman癌癥研究所的研究人員稱他們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一種快速、準(zhǔn)確且成本低廉的方法來確定引發(fā)癌癥的遺傳物質(zhì)的重組即染色體易位情況,。有關(guān)該方法的描述和研究結(jié)果發(fā)表在EMBO Molecular Medicine雜志上,。
許多癌癥類型是由腫瘤細(xì)胞中染色體易位導(dǎo)致的。雖然已發(fā)現(xiàn)數(shù)百種引發(fā)癌癥的染色體易位,，但目前檢測(cè)方法有重大缺陷,。
猶他州大學(xué)Huntsman癌癥研究所主任Stephen Lessnick醫(yī)學(xué)博士所在的實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的這種新型抗體的技術(shù)結(jié)合微陣列技術(shù)，運(yùn)用檢測(cè)染色體易位存在的抗體就能在一個(gè)單一的測(cè)試中就可以看到數(shù)千個(gè)染色體易位,。Lessnick說：過去,，病理學(xué)家通過顯微鏡檢測(cè)腫瘤樣本是診斷癌癥類型的最好的方法。目前可用的分子檢測(cè)速度慢,、效率低而且價(jià)格昂貴,，最大的問題之一是你需要高品質(zhì)的腫瘤樣本，而好的腫瘤樣本在臨床上并不總是能夠獲得的,。據(jù)Lessnick介紹,，他的方法對(duì)樣本的嚴(yán)格性比現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)要更低。
Lessnick說：“本來,，這種方法是猶他州大學(xué)Huntsman癌癥研究所凱恩斯實(shí)驗(yàn)室（由布拉德利·凱恩斯博士為首）用于研究酵母中RNA的,。我們將其應(yīng)用到我們?nèi)梭w組織中的染色體易位的研究中。他說接下來的任務(wù)就是要找到一個(gè)商業(yè)合作伙伴,，將這種研究技術(shù)發(fā)展成一個(gè)診斷測(cè)試,，醫(yī)生可以用它來幫助診斷病人。
使用這種方法,，所建立的單一的陣列可以同時(shí)測(cè)試所有已知的致癌易位,。Lessnick說目前,，醫(yī)生已決定運(yùn)用該技術(shù)試驗(yàn)來測(cè)試染色體易位引發(fā)的某些特定的癌癥類型,。
研究人員將技術(shù)方法用于尤因氏肉瘤（一種罕見的兒童癌癥）的研究，但Lessnick認(rèn)為該技術(shù)可以很容易地適用于易位引發(fā)的任何類型的癌癥,。
這個(gè)項(xiàng)目的資金來自美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生創(chuàng)新分子分析技術(shù)計(jì)劃資助。該計(jì)劃的重點(diǎn)是將基礎(chǔ)科學(xué)實(shí)驗(yàn)室研究加快進(jìn)入到臨床領(lǐng)域,。Lessnick說：“他們?cè)敢赓Y助這種研究技術(shù),，因?yàn)檠芯砍醪綌?shù)據(jù)顯示該技術(shù)走向臨床應(yīng)用的可能性很大”,。
Lessnick是猶他州立大學(xué)兒科血液/腫瘤科教授,，參與研究的其他研究者包括布拉德利凱恩斯河博士,、霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所的研究員,，并在猶他州立大學(xué)腫瘤學(xué)系教授、基因芯片和基因組分析核心研究院的Brett Milash博士和Brian Dalley博士,。（生物谷：Bioon）
doi:10.1002/emmm.201200225
PMC:
PMID:
Antibody detection of translocations in Ewing sarcoma.
Wen Luo, Brett Milash, Brian Dalley, Richard Smith, Holly Zhou, Natalie Dutrow, Bradley R. Cairns, Stephen L. Lessnick.
The detection of chromosomal translocations has important implications in the diagnosis, prognosis and treatment of patients with cancer. Current approaches to translocation detection have significant shortcomings, including limited sensitivity and/or specificity, and difficulty in application to formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) clinical samples. We developed a new approach called antibody detection of translocations (ADOT) that avoids the shortcomings of current techniques. ADOT combines a transcriptional microarray-based approach with a novel antibody-based detection method. ADOT allows for the accurate and sensitive identification of translocations and provides exon-level information about the fusion transcript. ADOT can detect translocations in poor-quality unprocessed total ribonucleic acid (RNA). Furthermore, the technique is readily generalizable to detect any potential fusion transcript, including previously undescribed fusions. We demonstrate the feasibility of ADOT by examples in which both known and unknown Ewing sarcoma translocations are identified from cell lines, tumour xenografts and FFPE primary tumours. These results demonstrate that ADOT may be an effective approach for translocation analysis in clinical specimens with significant RNA degradation and may offer a novel diagnostic tool for translocation-based cancers.
