2012年4月8日,,新加坡與新加坡國立癌癥中心的杜克國大醫(yī)學(xué)研究生學(xué)院研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國際科學(xué)家小組鑒定出了胃癌中數(shù)以百計(jì)的新的基因突變,,胃癌是全球第二大最致命癌癥類型。相關(guān)研究論文發(fā)表在2012年4月8日的《自然遺傳學(xué)》雜志上,。
胃癌是導(dǎo)致癌癥患者死亡的第二大原因,,全球有超過70萬的癌癥患者死于胃癌,尤其是在東亞地區(qū),,胃癌是最常見的,。治療這種致命性的疾病往往是困難和失敗的,在美國不到四分之一的患者被診斷患胃癌后,,生存時(shí)間會(huì)超過五年,。
研究小組使用最先進(jìn)的DNA測序技術(shù)分析胃癌患者腫瘤和正常組織的基因后,,發(fā)現(xiàn)了胃癌新的突變基因,。
DNA測序技術(shù)使我們能夠了解癌癥基因組中每個(gè)基因的DNA序列,,杜克國大計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)和人類遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室Steven G. Rozen博士說:這項(xiàng)工作是團(tuán)隊(duì)努力的共同完成的,,團(tuán)隊(duì)成員涉及搞基礎(chǔ)研究的科學(xué)家和臨床醫(yī)生,。
研究人員表示:我們篩選了18000個(gè)人的基因,,并確定超過600個(gè)基因在胃癌中發(fā)生了突變,,這些基因在以前未知的,。
600胃癌相關(guān)基因中FAT4和ARID1A被證明很特殊,,約100例胃癌患者進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)這些基因突變情況,,有5%的人發(fā)生了FAT4突變,8%的人發(fā)生了突變,。在一些患者中,,兩個(gè)基因包含的部分染色體丟失,這一證據(jù)表明遺傳缺陷影響這些基因突變誘發(fā)胃癌,。
實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)證明這兩個(gè)基因?qū)Υ龠M(jìn)胃癌的重要性,,調(diào)控FAT4和ARID1A的功能能改變胃癌細(xì)胞的生長。
研究團(tuán)隊(duì)正在積極對(duì)這一研究成果進(jìn)行轉(zhuǎn)化工作,,要實(shí)現(xiàn)這些結(jié)果的臨床意義還需開展更多的研究,。ARID1A和FAT4可能還涉及其他許多類型癌癥,不僅僅是在胃癌中,。
每年全世界超過10萬例胃癌患者可能由FAT4或ARID1A基因突變引起的,,針對(duì)這些基因的藥物可能有一天會(huì)使得胃癌和其他類型的癌癥治療更有效。(生物谷:Bioon)
doi:10.1038/ng.2246
PMC:
PMID:
Exome sequencing of gastric adenocarcinoma identifies recurrent somatic mutations in cell adhesion and chromatin remodeling genes
Zhi Jiang Zang,Ioana Cutcutache,Song Ling Poon,Shen Li Zhang,John R McPherson,Jiong Tao,Vikneswari Rajasegaran,Hong Lee Heng,Niantao Deng,Anna Gan,Kiat Hon Lim,Choon Kiat Ong,et al.
Gastric cancer is a major cause of global cancer mortality. We surveyed the spectrum of somatic alterations in gastric cancer by sequencing the exomes of 15 gastric adenocarcinomas and their matched normal DNAs. Frequently mutated genes in the adenocarcinomas included TP53 (11/15 tumors), PIK3CA (3/15) and ARID1A (3/15). Cell adhesion was the most enriched biological pathway among the frequently mutated genes. A prevalence screening confirmed mutations in FAT4, a cadherin family gene, in 5% of gastric cancers (6/110) and FAT4 genomic deletions in 4% (3/83) of gastric tumors. Frequent mutations in chromatin remodeling genes (ARID1A, MLL3 and MLL) also occurred in 47% of the gastric cancers. We detected ARID1A mutations in 8% of tumors (9/110), which were associated with concurrent PIK3CA mutations and microsatellite instability. In functional assays, we observed both FAT4 and ARID1A to exert tumor-suppressor activity. Somatic inactivation of FAT4 and ARID1A may thus be key tumorigenic events in a subset of gastric cancers.