本文介紹了一種觀看,、分析,、比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法,。本文的方法與現(xiàn)有的RMSD(distance-based coordinate)RMSDd(distance rms deviation)方法截然不同,作者采用了所謂的通過Vassiliev knot invariants產(chǎn)生的30個數(shù)字來定義蛋白的拓樸結(jié)構(gòu),。為了展示這種方法的易用性和強大,,作者利用SGM(scaled Gauss metric)來度量蛋白形狀之間的相似性。在這種測度框架下,,蛋白鏈能夠自然的被分近不同的fold類群中去,。該方法非常的快速因為它即不要求蛋白鏈的聯(lián)配也不要求鏈與鏈之間的比較。作者對CATH2.4數(shù)據(jù)庫進行的分析表明該方法正確率非常之高,。在正文中,,作者對發(fā)展新方法的必要性和新方法的優(yōu)缺點都有闡述。編者認為,,盡管該方法未必最優(yōu),,但是作者提出的發(fā)展新方法的思想還是很有道理的,有興趣的朋友可以看看,。