無(wú)論是與結(jié)構(gòu)基因組學(xué)對(duì)應(yīng)的“基因時(shí)代”,,還是與功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)相應(yīng)的“后基因時(shí)代”,;無(wú)論你稱呼21世紀(jì)是“信息時(shí)代”,、“后信息時(shí)代”,還是“生物時(shí)代”,,所有這一切,,都將BT(生物技術(shù))與IT(信息技術(shù))緊密結(jié)合起來(lái)。而這其中,,無(wú)疑“生物信息學(xué)”占據(jù)了天時(shí)地利,、出盡了風(fēng)頭,雖然它自身及其相關(guān)產(chǎn)業(yè)蘊(yùn)涵無(wú)限商機(jī),,但相對(duì)官方,,民間資本的介入有待進(jìn)一步引發(fā)。
隨著現(xiàn)代科技的發(fā)展,,生物技術(shù)與信息技術(shù)的融合成為大勢(shì)所趨。人類基因組計(jì)劃及生物信息研究過(guò)程中產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù),,需要大容量,、高性能、超級(jí)計(jì)算機(jī)的支持,。從序列拼接到基因預(yù)測(cè),,從蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)到功能基因的分析,都離不開高性能服務(wù)器的支持,。
可以預(yù)見,,超級(jí)電腦的高度運(yùn)算能力將在生命科學(xué)、商品開發(fā)及企業(yè)整合上扮演越來(lái)越重要的角色,。那些IT巨子們又有了新的“搖錢樹”,。
我國(guó)生物信息學(xué)科研后來(lái)居上
繼提前完成HGP(人類基因組計(jì)劃)“中國(guó)卷”之后,中國(guó)科學(xué)院,、國(guó)家計(jì)委,、科技部“10月12日在京聯(lián)合宣布,我國(guó)科學(xué)家克服重重困難,,率先在世界上完成了水稻基因組的“工作框架圖”和數(shù)據(jù)庫(kù),。專家認(rèn)為,,水稻遺傳密碼的破譯,不僅是我國(guó)生命科學(xué)領(lǐng)域的又一重大突破,,也是我國(guó)科學(xué)家為人類做出的一項(xiàng)重大貢獻(xiàn)和基因研究史上的一件大事,。
“這一成果由我國(guó)科學(xué)家獨(dú)立完成,其意義非比尋常,。它標(biāo)志著我國(guó)已經(jīng)成為繼美國(guó)之后第二個(gè)具有獨(dú)立完成大規(guī)?;蚪M測(cè)序和組裝分析能力的國(guó)家。”中國(guó)科學(xué)院基因組生物信息學(xué)中心主任楊煥明教授說(shuō),。
目前世界上已有三個(gè)水稻基因組計(jì)劃,。以日本為首包括11個(gè)國(guó)家和地區(qū)科學(xué)家參與的“國(guó)際水稻基因組協(xié)作組”于1997年正式成立,但因種種原因進(jìn)展不盡如人意,。但一些私營(yíng)基因公司卻在此領(lǐng)域后來(lái)居上,,2000年2月和4月,美國(guó)和瑞士的兩家私營(yíng)公司分別宣布完成了他們的水稻基因組“工作框架圖”,,但他們卻不肯公布數(shù)據(jù),,也不在學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表文章,外界對(duì)此頗多猜測(cè),。
據(jù)悉,,雖然面臨經(jīng)費(fèi)短缺等困難,但是我國(guó)科學(xué)家表示,,如果經(jīng)費(fèi)及時(shí)到位的話,,水稻基因組的“完成圖”將按計(jì)劃于明年春節(jié)前繪制完成,從而使我國(guó)成為世界上第一個(gè)完成水稻全基因組序列圖的國(guó)家,。
據(jù)悉,,作為中國(guó)超級(jí)雜交水稻基因組計(jì)劃的主要承擔(dān)單位之一,中科院人類基因組生物信息學(xué)中心暨華大基因中心在1999年申請(qǐng)加入人類基因組計(jì)劃時(shí),,被人類基因組計(jì)劃協(xié)作組以“北京中心”命名,,成為“生命登月”計(jì)劃的16個(gè)中心之一。目前,,“華大基因”已經(jīng)成為世界級(jí)的生物信息學(xué)基地,。
與Sun聯(lián)姻華大“如虎添翼”
由美國(guó)Sun(太陽(yáng)微系統(tǒng))公司和中科院基因組生物信息學(xué)中心暨北京華大基因研究中心聯(lián)合創(chuàng)辦的生物信息學(xué)中心10月12日在京宣告成立。這不僅標(biāo)志著太陽(yáng)微系統(tǒng)公司這一國(guó)際信息產(chǎn)業(yè)巨頭對(duì)我國(guó)基因組和生物信息研究的全力支持,,更標(biāo)志著我國(guó)基因組與生物信息研究水平邁入國(guó)際一流行列,。據(jù)悉,這是我國(guó)首次和國(guó)際信息產(chǎn)業(yè)巨頭在生物信息學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行合作,。
隨著3臺(tái)Sun服務(wù)器的加盟,,“華大基因”使用的包括“曙光”在內(nèi)的主流服務(wù)器已經(jīng)達(dá)到7臺(tái),成為國(guó)內(nèi)計(jì)算實(shí)力最強(qiáng)的研究機(jī)構(gòu)之一,。據(jù)悉,,中心掛牌后,,SUN公司不僅將提供部分經(jīng)費(fèi)予以支持,還將在高性能計(jì)算,、網(wǎng)絡(luò)計(jì)算和生物信息等方面提供技術(shù)支持,。
作為國(guó)內(nèi)實(shí)力最強(qiáng)大的基因組與生物信息研究機(jī)構(gòu),北京華大基因研究中心自1999年7月成立伊始,,就致力于基因組和生物信息的研究,,到今年8月,在國(guó)家的大力支持下,,和兄弟單位一起出色地繪制出人類基因組“中國(guó)卷”,。
此外,中心還積極拓展國(guó)際合作,,在同一舞臺(tái)上和國(guó)際科技界進(jìn)行平等合作,。2000年5月,在提前完成國(guó)際人類基因組計(jì)劃1%項(xiàng)目的“工作框架圖”后,,華大基因與丹麥農(nóng)業(yè)部共同開展家豬基因組的研究,;今年8月,,又與美國(guó)最大的基因組研究中心結(jié)成了姐妹中心,。
隨著“華人基因”各項(xiàng)研究的逐步開展,高性能計(jì)算能力的缺乏,,成為其所面臨的主要制約因素之一。Sun與華大基因的聯(lián)姻將推動(dòng)我國(guó)生物信息產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,,產(chǎn)生積極而深遠(yuǎn)的影響,。
Sun與康柏雙雄逐鹿
實(shí)際上早在兩個(gè)月以前,Sun即宣布北京基因組研究中心(BGI)與德拉威生技研究中心(DBI)獲選成為SunCentersofExcellence(COE),。此兩個(gè)研究中心因其在運(yùn)算生物學(xué)的領(lǐng)導(dǎo)地位,,及結(jié)合其他機(jī)構(gòu)共同開發(fā)生物科技的潛力而獲選為SunCOE,。DBI所以獲選成為高性能運(yùn)算生物學(xué)領(lǐng)域的SunCOE,來(lái)自于先進(jìn)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),、生物路徑模擬,、電腦偵測(cè)序列重復(fù)與SNP、以及整體基因組的比較,。未來(lái),兩個(gè)研究中心將正式加入Sun的學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)社群,,開發(fā)先進(jìn)技術(shù)以從事突破性的研發(fā)工作,。除了BGI和DBI以外,,Sun日前亦已完成在維吉尼亞生技研究中心和威斯康辛麥迪遜大學(xué)設(shè)立運(yùn)算生物學(xué)COE。
BGI在中國(guó)大陸上,,已研究基因?qū)W和生技中心著稱,該中心在基因?qū)W,、替代接合演算法,、以及蛋白質(zhì)體學(xué)方面的先進(jìn)研究促使其能夠獲選成為SunCOE。目前,,BGI團(tuán)隊(duì)成員超過(guò)500人,,其中200位生物信息學(xué)家將藉由兩臺(tái)SunEnterprise10000超級(jí)電腦,在北京與杭州進(jìn)行稻米與豬類基因的研究,。
同樣,不久之前,,康柏電腦也與臺(tái)灣中央研究院簽署合作備忘錄,,擬集結(jié)雙方專業(yè)經(jīng)驗(yàn)傾力推動(dòng)臺(tái)灣未來(lái)生物科技產(chǎn)業(yè)之發(fā)展,期望繼最近20年使臺(tái)灣活躍于世界舞臺(tái)的資訊產(chǎn)業(yè)后,,再度爭(zhēng)取臺(tái)灣在全球生技價(jià)值網(wǎng)絡(luò)中的一席之地,,這次與中央研究院的合作,使雙方共同成功的加入了CeleraGenomics,、英國(guó)的SangerCenter、麻塞諸塞州的WhiteheadInstitute,、法國(guó)的Genoscope及其他許多國(guó)際頂尖機(jī)構(gòu)的行列,。
日后康柏電腦與中研院是藉由學(xué)術(shù)交流、創(chuàng)投,、策略聯(lián)盟或是其他模式合作,雙方的終極目標(biāo)便是建立臺(tái)灣在生物科技所需之基礎(chǔ)架構(gòu),??蛋仉娔X除了提供臺(tái)灣的生物科技產(chǎn)業(yè)生物資訊學(xué)方面的資源之外,還將結(jié)合最先進(jìn)的系統(tǒng)工程專家并且整合過(guò)去累積的資源,,全力支援研發(fā)生物信息學(xué)中基因科技所需的高效能運(yùn)算需求,。此外更會(huì)積極與國(guó)內(nèi)其他資訊管理和生物科技研究機(jī)構(gòu)策略聯(lián)盟,提升臺(tái)灣在此新興產(chǎn)業(yè)中的競(jìng)爭(zhēng)力,。
專利獲取風(fēng)投垂青
雖然官方與民間,,科學(xué)家與社會(huì)學(xué)家有關(guān)生物信息知識(shí)產(chǎn)權(quán)存在巨大分析,,但無(wú)疑專利的實(shí)施更能吸引資本的眼球,,反過(guò)來(lái)也促進(jìn)了生物信息相關(guān)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。在美國(guó)便是如此,。
因?yàn)樯镄畔W(xué)是科學(xué)和技術(shù)革新的邊緣學(xué)科,。一家生物信息學(xué)企業(yè)的產(chǎn)品可能是與企業(yè)籌備時(shí)的原始計(jì)劃中相差很大或不足所期望的。為了保護(hù)可能產(chǎn)生的任何一個(gè)和所有產(chǎn)品的所有入的利益,,公司需要有全面的和嚴(yán)密的工藝,、知識(shí)產(chǎn)權(quán)。
例如,,專利直接保護(hù)特殊的基因序列,,投機(jī)企業(yè)收集和分析數(shù)據(jù)的過(guò)程也可以包括在風(fēng)險(xiǎn)投資搭配中。生物信息學(xué)是一個(gè)持續(xù)發(fā)展的新領(lǐng)域,,這些被保護(hù)的過(guò)程也可以作為企業(yè)的產(chǎn)出,。知識(shí)產(chǎn)權(quán)必須保持先進(jìn)性,萬(wàn)一有閃失,,知識(shí)產(chǎn)權(quán)會(huì)受到侵犯。雖然籌備企業(yè)會(huì)考慮盡量少的知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)成本,,但經(jīng)驗(yàn)表明籌備企業(yè)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)的投入需要經(jīng)常比基本資產(chǎn)的要多,。
為了選擇好的投資企業(yè),籌備中的生物信息學(xué)企業(yè)要把注意力集中在那些生物技術(shù)風(fēng)險(xiǎn)投資機(jī)構(gòu),。從這些機(jī)構(gòu)中,,來(lái)選擇那些投資公司會(huì)提供理想水平的資金投入,,優(yōu)秀的投資經(jīng)驗(yàn)和行業(yè)聯(lián)系,。對(duì)籌備者來(lái)說(shuō),,需要決定潛在企業(yè)的投資標(biāo)準(zhǔn),還有在換得資金后將運(yùn)行的企業(yè)在多大程度上控制它,。另一個(gè)縮小潛在企業(yè)的范圍的因素可以稱之為支持服務(wù),,如媒介,公共關(guān)系和廣告聯(lián)系,。
最后,,生物信息學(xué)企業(yè)不要為了確保風(fēng)險(xiǎn)投資基金而被那種令人畏縮,,快速的競(jìng)爭(zhēng)性的融資競(jìng)賽而灰心喪氣。作為互聯(lián)網(wǎng)企業(yè)的后繼者和下一波更大的商業(yè)進(jìn)展的預(yù)兆,,生物技術(shù)投資企業(yè)期望奸的生物信息學(xué)投資機(jī)會(huì),,他們也愿意改變他們的原則來(lái)適應(yīng)它,。
國(guó)家籌建“生物信息系統(tǒng)國(guó)家研究中心”
據(jù)悉,生物信息研究一直是國(guó)家計(jì)委密切關(guān)注和重點(diǎn)支持的重要領(lǐng)域,。對(duì)中國(guó)科學(xué)院今后在生物信息學(xué)領(lǐng)域的有關(guān)研究和科研基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè),,國(guó)家計(jì)委將繼續(xù)予以支持,,并和有關(guān)部門一起,,共同推進(jìn)我國(guó)生物信息技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展,,加速產(chǎn)業(yè)化,。
國(guó)家發(fā)展計(jì)劃委員會(huì)副主任姜偉新日前介紹,我國(guó)將在中國(guó)科學(xué)院建設(shè)“生物信息系統(tǒng)國(guó)家研究中心”,,形成有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)能力的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)的整體技術(shù)平臺(tái),。
21世紀(jì)是生命科學(xué)大發(fā)展的時(shí)代,。以人類基因組計(jì)劃為序幕的生物信息學(xué)研究,是全面認(rèn)識(shí)生命及其過(guò)程的重要手段,。由此引發(fā)的生物信息革命,,將從根本上改變生命科學(xué)和生物產(chǎn)業(yè)的思維方式和研究體系,成為新世紀(jì)國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)成敗的關(guān)鍵之一,。