在現(xiàn)代分子系統(tǒng)學(xué)研究中,，最大似然法和貝葉斯分析是兩種文獻(xiàn)中最為主要的構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的兩種方法,。在構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹之前，研究人員一般都需要對比對后的多條基因序列進(jìn)行最優(yōu)進(jìn)化模型選擇,。目前,，通常使用的模型選擇軟件，如ModelTest等,，其實(shí)包含似然比檢驗(yàn)（LRT）,、赤池信息標(biāo)準(zhǔn)（AIC）和貝葉斯信息標(biāo)準(zhǔn)（BIC）等多種選擇模型的統(tǒng)計標(biāo)準(zhǔn)。對于研究者來說,，具體采用哪種統(tǒng)計標(biāo)準(zhǔn)最后選出進(jìn)化模型往往是一個讓人困惑的問題,。
因此，為了更好地理解不同選擇標(biāo)準(zhǔn)的行為特點(diǎn)，從而方便眾多研究者的應(yīng)用,，新研究針對廣義時間可逆模型（GTR）中24個基本的模式,，共計模擬了33600個數(shù)據(jù)。就分層似然比檢驗(yàn)（hLRT）,、赤池信息標(biāo)準(zhǔn)（AIC）,、貝斯信息標(biāo)準(zhǔn)（BIC）和決定理論（DT）等四種現(xiàn)有的主要標(biāo)準(zhǔn)，分別對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行模型選擇,，并繼而分析了不同標(biāo)準(zhǔn)的準(zhǔn)確性,、精確性、差異度和選擇偏向性,。結(jié)果表明,，BIC和DT具有較高的準(zhǔn)確性和精確性，因此判斷它們是目前最佳模型選擇標(biāo)準(zhǔn),。另外,，結(jié)果顯示，對于同樣的數(shù)據(jù)不同的選擇標(biāo)準(zhǔn)經(jīng)常選擇出不同的最優(yōu)模型,；其中hLRT和AIC的差異度最高,，而BIC和DT之間的差異度則最小。選擇偏向性結(jié)果表明：當(dāng)真實(shí)模型含不變異位點(diǎn)這一參數(shù)時,，hLRT的選擇準(zhǔn)確性較差,；而BIC和DT則總是呈現(xiàn)相似的選擇偏向性?？傊芯勘砻?，在做模型選擇分析時,，BIC和DT應(yīng)該作為首選的統(tǒng)計標(biāo)準(zhǔn)。結(jié)合模型適度檢驗(yàn),，依據(jù)BIC和DT的選擇模型理應(yīng)能促進(jìn)分子系統(tǒng)及相關(guān)研究的可信性,。
該研究主要由中國科學(xué)院動物研究所朱朝東博士領(lǐng)導(dǎo)的課題組完成，主要得到了中國科學(xué)院農(nóng)業(yè)辦公室項(xiàng)目（KSCX2-YW-NF-02）,、國家自然科學(xué)基金委項(xiàng)目（30870268, J0930004）資助,，并部分得到中國農(nóng)業(yè)部行業(yè)科技專項(xiàng)（200803006）、北京市自然科學(xué)基金委重點(diǎn)基金（KZ201010028028）等項(xiàng)目的資助,。
研究論文已發(fā)表在BMC Evolutionay Biology,。該論文自發(fā)表以來，已經(jīng)成為該雜志高度受關(guān)注論文之一,。目前第一作者羅阿蓉已經(jīng)得到國家留學(xué)基金委資助,，前往澳大利亞聯(lián)邦科工委組織進(jìn)一步開展博士論文工作，加強(qiáng)在該領(lǐng)域的合作研究,。（生物谷Bioon.com）
