生物谷報道:由EMBL等處的研究人員公布的三篇文章對大規(guī)模蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)分享和信息比較方面提出了新的方法見解,令這些數(shù)據(jù)能更易被科學(xué)家們分享使用,,這些文章發(fā)表在8號和26號的Nature Biotechnology雜志上,。
這三篇文章中的兩篇作為Perspectives papers公布在雜志上,可免費(fèi)獲得,,主要是提出了蛋白質(zhì)組學(xué)和分子相互作用實(shí)驗(yàn)的公布要求,,并討論了這些方法的執(zhí)行(mplementation),影響(impact)和益處(benefit),。最后一篇文章,,公布在26號的雜志上,提出了這些標(biāo)準(zhǔn)如何不僅對于研究人員而言有幫助,而且也通過更詳細(xì)和完整的信息來源有利于更廣泛的交流,。
隨著可獲得的生物學(xué)信息的數(shù)量,,以及公共數(shù)據(jù)庫的增加,這些數(shù)據(jù)的一致性就成為了比較,,整合和交流的關(guān)鍵點(diǎn),。作為歐洲生物學(xué)數(shù)據(jù)的主要來源,EMBL——歐洲生物信息研究所(EBI)提出了應(yīng)用于其自身數(shù)據(jù)庫,,比如ArrayExpress(生物芯片及基因表達(dá)數(shù)據(jù)),,IntAct(分子相互作用數(shù)據(jù)),以及PRIDE(實(shí)驗(yàn)證據(jù)及發(fā)表文章相關(guān)的蛋白鑒別)的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),。
原文檢索:
Nature Biotechnology 25, 887 - 893 (2007)
Published online: 8 August 2007 | doi:10.1038/nbt1329
The minimum information about a proteomics experiment (MIAPE) [Abstract]
Nature Biotechnology 25, 894 - 898 (2007)
Published online: 8 August 2007 | doi:10.1038/nbt1324
The minimum information required for reporting a molecular interaction experiment (MIMIx)