生物過(guò)程非常復(fù)雜,,需要利用到各種高科技技術(shù),,也就是稱為“omics(組學(xué))”的技術(shù)工具,,這些方法能進(jìn)行細(xì)胞中成千上萬(wàn)個(gè)分子的整體分析,,并且追蹤它們?cè)诩膊≈凶饔谩?/p>
在后基因組時(shí)代,,研究人員發(fā)現(xiàn)細(xì)胞整體蛋白,,也就是蛋白質(zhì)組學(xué)研究需要提到到一個(gè)新的層面,,由于蛋白是基因的分子執(zhí)行者,因此如果我們希望能更全面了解細(xì)胞的工作機(jī)制,,就需要找到這個(gè)最找到的拼圖,。
西班牙國(guó)家癌癥研究中心Javier Munoz與荷蘭烏得勒支大學(xué),以及荷蘭蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心的研究人員在1月18日公布的Nature Review Genetics雜志上,,進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域的最新技術(shù)的修訂,,這些技術(shù)包括生物學(xué)樣品制備中的技術(shù)進(jìn)展,質(zhì)譜技術(shù)創(chuàng)新,,以及生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析的發(fā)展,。
為了介紹這些技術(shù)進(jìn)展,作者參考了新一代基因組測(cè)序技術(shù),,將其命名為“新一代蛋白質(zhì)組學(xué)”,,并且這些研究人員還通過(guò)了幾個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)研究的例子,解析了幾種生物醫(yī)藥研究方案中的關(guān)鍵數(shù)據(jù),。
在這一修訂版最后,,作者強(qiáng)調(diào)了這些研究在臨床操作中的主要應(yīng)用,比如尋找有用的新生物標(biāo)志物,,改進(jìn)癌癥的診斷和預(yù)后判斷,,或者在分析了需要研究的細(xì)胞數(shù)量后,,設(shè)計(jì)患者的個(gè)體化治療方法。(生物谷Bioon.com)
doi:10.1038/nrg3356
PMC:
PMID:
Next-generation proteomics: towards an integrative view of proteome dynamics
A. F. Maarten Altelaar, Javier Munoz & Albert J. R. Heck
Next-generation sequencing allows the analysis of genomes, including those representing disease states. However, the causes of most disorders are multifactorial, and systems-level approaches, including the analysis of proteomes, are required for a more comprehensive understanding. The proteome is extremely multifaceted owing to splicing and protein modifications, and this is further amplified by the interconnectivity of proteins into complexes and signalling networks that are highly divergent in time and space. Proteome analysis heavily relies on mass spectrometry (MS). MS-based proteomics is starting to mature and to deliver through a combination of developments in instrumentation, sample preparation and computational analysis. Here we describe this emerging next generation of proteomics and highlight recent applications.