生物過程非常復雜,,需要利用到各種高科技技術(shù),也就是稱為“omics(組學)”的技術(shù)工具,,這些方法能進行細胞中成千上萬個分子的整體分析,,并且追蹤它們在疾病中作用。
在后基因組時代,,研究人員發(fā)現(xiàn)細胞整體蛋白,,也就是蛋白質(zhì)組學研究需要提到到一個新的層面,由于蛋白是基因的分子執(zhí)行者,,因此如果我們希望能更全面了解細胞的工作機制,,就需要找到這個最找到的拼圖。
西班牙國家癌癥研究中心Javier Munoz與荷蘭烏得勒支大學,,以及荷蘭蛋白質(zhì)組學研究中心的研究人員在1月18日公布的Nature Review Genetics雜志上,,進行了蛋白質(zhì)組學研究領(lǐng)域的最新技術(shù)的修訂,,這些技術(shù)包括生物學樣品制備中的技術(shù)進展,質(zhì)譜技術(shù)創(chuàng)新,,以及生物信息學數(shù)據(jù)分析的發(fā)展,。
為了介紹這些技術(shù)進展,作者參考了新一代基因組測序技術(shù),,將其命名為“新一代蛋白質(zhì)組學”,并且這些研究人員還通過了幾個蛋白質(zhì)組學研究的例子,,解析了幾種生物醫(yī)藥研究方案中的關(guān)鍵數(shù)據(jù),。
在這一修訂版最后,作者強調(diào)了這些研究在臨床操作中的主要應(yīng)用,,比如尋找有用的新生物標志物,,改進癌癥的診斷和預后判斷,或者在分析了需要研究的細胞數(shù)量后,,設(shè)計患者的個體化治療方法,。(生物谷Bioon.com)
doi:10.1038/nrg3356
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Next-generation proteomics: towards an integrative view of proteome dynamics
A. F. Maarten Altelaar, Javier Munoz & Albert J. R. Heck
Next-generation sequencing allows the analysis of genomes, including those representing disease states. However, the causes of most disorders are multifactorial, and systems-level approaches, including the analysis of proteomes, are required for a more comprehensive understanding. The proteome is extremely multifaceted owing to splicing and protein modifications, and this is further amplified by the interconnectivity of proteins into complexes and signalling networks that are highly divergent in time and space. Proteome analysis heavily relies on mass spectrometry (MS). MS-based proteomics is starting to mature and to deliver through a combination of developments in instrumentation, sample preparation and computational analysis. Here we describe this emerging next generation of proteomics and highlight recent applications.