要想有效控制傳染病,，就必須對(duì)病原體的“隱私”有更為深入的剖析,。由中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所等6個(gè)單位最近完成的《痢疾桿菌全基因組序列測(cè)定與分析》科研課題,，從分子水平對(duì)我國(guó)流行的痢疾病原菌優(yōu)勢(shì)菌株——福氏2a痢疾桿菌301株的致病機(jī)理和耐藥機(jī)制進(jìn)行了研究,，取得了一系列具有原創(chuàng)性的科研成果。

主持此項(xiàng)研究的金奇教授等15位科研人員,，采用當(dāng)前最先進(jìn)的技術(shù),，構(gòu)建了4萬多個(gè)基因組片段克隆組成的全基因組Shotgun完全隨機(jī)文庫、限制性內(nèi)切酶半定向隨機(jī)文庫和BAC文庫等三套基因組文庫,。他們采用一端測(cè)序的步驟,，測(cè)定了30Mb（兆堿基對(duì)）以上的序列，完成了包括毒力大質(zhì)粒在內(nèi)的全基因組序列測(cè)定和分析,。研究人員通過基因組功能注釋研究,，發(fā)現(xiàn)痢疾桿菌301株是目前已知含IS序列最多的微生物，顯示該基因組異?；钴S,。而且，該菌株的比較基因組學(xué)分析也提示,，301株的染色體上存有多個(gè)大片段的倒置和移位,，這可能是影響細(xì)菌的侵襲與致病性的重要因素。

更有意義的是,，研究者經(jīng)功能注釋與比較基因組學(xué)研究,，共獲得了痢疾桿菌301株500多個(gè)特異的新基因，其中有近200個(gè)迄今未見報(bào)道,。他們還利用生物信息學(xué)方法,，對(duì)新基因進(jìn)行結(jié)構(gòu)模擬和功能預(yù)測(cè)，先后獲得了數(shù)十個(gè)編碼外膜蛋白的基因,，并以此作為有效免疫的組分和藥物靶位的候選蛋白,，從而為研制新型疫苗和新藥奠定了基礎(chǔ)。

這項(xiàng)研究從基因組水平上,，初步揭示了痢疾與大腸桿菌的進(jìn)化關(guān)系,，并獲得了數(shù)十個(gè)各菌株特異性的“基因組島”。由于這之中的多個(gè)“基因組島”分別與各自重要物質(zhì)的代謝及其毒力相關(guān),，故為研究痢疾桿菌的毒力進(jìn)化和致病機(jī)理,，尤其為痢疾的有效防治提供了科學(xué)依據(jù)。