當(dāng)各種生物學(xué)科的研究人員走到一起,組成一個科研團體的時候,,年輕科學(xué)-基因組學(xué)繁榮起來。本文描述了來自科研院校和工業(yè)的領(lǐng)袖對這個領(lǐng)域的現(xiàn)狀及其由此所提供的許多令人興奮的工作機會最新看法,。
今天的基因組學(xué)技術(shù)不斷地得到新的應(yīng)用,。Rosetta Biosoftware公司的總經(jīng)理道格拉斯 Bassett說:"我們看到基因組技術(shù)正不斷在有關(guān)人類健康和生命科學(xué)方面得到直接應(yīng)用,而這些應(yīng)用對病人看護和藥物研究的發(fā)展有著深遠(yuǎn)的影響,。"同時他也指出,,第一波涉及基因表達技術(shù)的新藥申請的浪潮正涌向食物藥品管理局。這個領(lǐng)域的科學(xué)家有時也會對快速的變化感到吃驚,。Bassett 說:"10年以前,,這種技術(shù)會被看做是夢想或科幻小說里的情節(jié)。"而今天,,基因組卻已經(jīng)是科學(xué)事實,。而且,這個快速傳布的領(lǐng)域提供了許多工作機會,。
斯德哥爾摩,瑞典:
揭示所有基因的功能是當(dāng)前基因組學(xué)研究最重要的工作,。"闡明所有新基因的功能是一件艱巨的工作," Karolinska 研究所基因組及生物信息中心主任Claes Wahlestedt教授相信要從基因組學(xué)淘得到大部分金子仰賴于不同領(lǐng)域的科研人員組織起來并教會他們一起工作,。年輕的基因組及生物信息中心從一開始就尋求這樣的整合,。然而,具有很強醫(yī)學(xué)實力的Karolinska研究所也鼓勵臨床的工作,。"對這里而言,,最重要的整合,"Wahlestedt教授說,,"是把臨床跟實驗室工作結(jié)合起來,。"舉例來說,Wahlestedt教授和他的同事正在籌建一個統(tǒng)一的"生物銀行"來儲存這個研究所的所有數(shù)據(jù),,幫助促進臨床實驗室與基因組學(xué)研究得到的數(shù)據(jù)之相互影響,。臨床應(yīng)用的機會也加強了Karolinska研究所在人類遺傳學(xué)領(lǐng)域研究實力,。Wahlestedt教授認(rèn)為,要建立涉及面寬然而交互式的科研團隊,,關(guān)鍵是國際性地招募有著不同學(xué)科背景的人們,。他補充說,,"我們一直都在找尋博士后,,他們是科研的主要群體,他們中的一些人出站后留下來而且已經(jīng)變成團隊的領(lǐng)袖,。"
戴維斯,加州:
其他機構(gòu)也看到了這種有內(nèi)部凝聚力的團隊之價值,。舉例來說,加州大學(xué)戴維斯分校正在創(chuàng)建基因組學(xué)研究中心,,此中心的大樓正在建筑之中,,預(yù)期到2004年可交付使用。此中心預(yù)期將擁有17個終身教職,,150位職員的位置,。目前這個中心的日常事務(wù)在一楝暫時的大樓中進行??紤]到基因組學(xué)對各方面的沖擊,,此中心的副主任Craig Benham博士說:"基因組學(xué)是生物方法學(xué)的常備擴充,其全面的數(shù)據(jù)庫使得我們可以用過去所不能的方式來了解生物,。"同時,,他認(rèn)為年輕的科學(xué)家容易地在這個領(lǐng)域中找到一個終生的職業(yè)。"期望我們這個新研究中心能探究更廣泛范圍的生物學(xué),,"他說,,"我把這看作是整合系統(tǒng)生物學(xué)中心。"他預(yù)期他的同事將探究許多的方面,,包括比較基因組學(xué),。"科學(xué)家能為比較數(shù)據(jù)分析挖掘序列,包括系統(tǒng)進化關(guān)系,,來揭示生物系統(tǒng)和各種路徑是如何進化的,,探索的寬度將與被研究生物的多元化相匹配。我們的基因組中心不能只玩分類的小把戲,,我們在數(shù)據(jù)中包括分類譜系,,這個會使比較基因組學(xué)的機會變得十分獨特。"他甚至預(yù)期研究葡萄酒制造的同事將會研究葡萄的基因組,。欲要解決這些不同的問題將會要求多種方法,。這個中心將會運行各種核心設(shè)備, 包括集約化的質(zhì)譜分析。結(jié)果是,,職員們將會有生物學(xué),,計算機科學(xué),,數(shù)學(xué),物理化學(xué)和物理學(xué)的背景,。他們新研究中心的招聘將會涵蓋從學(xué)士水平到富有經(jīng)驗的教授,。
波士頓,麻薩諸塞州:
科學(xué)家正在學(xué)習(xí)該如何真正地利用基因組學(xué),Infinity Pharmaceuticals分子及細(xì)胞生物學(xué)主任Christian Fritz說, "基因組學(xué)對我們在做的課題有著難以置信的價值,,但是歸根結(jié)底它只是一個工具,,舉例來說是發(fā)現(xiàn)新藥靶子的一個工具。"他補充說,,"在新藥發(fā)現(xiàn)方面,,只有使生物學(xué)的多樣性與化學(xué)的多元化相匹配,才能獲取基因組學(xué)革命所能帶來的最大利益,。換句話說,,基因組學(xué)必須與化學(xué)一道并肩地推動藥學(xué)發(fā)展。"
Infinity公司化學(xué)技術(shù)副總裁Michael Foley說,,"大自然是一個有手性的實體,,但只有少數(shù)制造成藥的分子持有手性特征,。"Foley和他的同事希望藉由通過收集手性化的化學(xué)藥品來改變這種狀況,。他說,"直到最近這10年手性才受到大家注意,,而且只有到現(xiàn)在,,我們Infinity開始考慮在藥物發(fā)現(xiàn)的工業(yè)上應(yīng)用它。"
Infinity公司的研究人員采用2種基本方法,。第一個方法是,,他們篩選具有用化學(xué)遺傳方式檢測表型的小分子。在這些實驗中,,他們把特定的混合物加入疾病細(xì)胞模型中以正確的方式識別那些影響某個疾病表型的物質(zhì),。其次,F(xiàn)ritz和他的同事使用復(fù)合的芯片快速地查找對目標(biāo)蛋白的有力和特定結(jié)合者,,并在這過程中創(chuàng)建一個能映射Infinity的混合物到蛋白質(zhì)的特定族和亞綱的大型數(shù)據(jù)庫,。這類工作產(chǎn)生了許多個開放的位置。Fritz指出目前的位置與芯片制造,,高通量的蛋白質(zhì)處理方法,,和標(biāo)靶蛋白組學(xué)。在考慮申請者的時候,,德國人說,,"我們需要生物學(xué)家和化學(xué)家以一新的方式一起工作?;瘜W(xué)家們確實趨向于使用跟生物學(xué)家不同的方法以及從不同角度的想考問題,。"
KIRKLAND,華盛頓
基因組學(xué)的語言在計算機的使用方面,,超越了生物學(xué)和化學(xué)。這種語言展示了以前沒人曾想像的發(fā)現(xiàn),。Bassett解釋最近Rosetta's 主要釋放的軟件中包括了Bayesian 分類運算法,,并與荷蘭癌癥研究所(Het Nederlands Kanker Instituut 或 NKI)研究人員合作。Bassett說,,"Rosetta 和NKI的研究員研究乳癌病人,,十年以來連續(xù)追蹤疾病如何發(fā)展和確定哪些病人可有較好的預(yù)診而哪些不能。在產(chǎn)品中使用這個新的算法,,研究員能夠較好地預(yù)測哪些病人是需要化療,,而哪些可以通過除去腫瘤得到有效地治療,而病人不必忍耐化療所帶來的巨大痛苦,。Rosetta Biosoftware公司如此的工作為那些有著眾多背景的科學(xué)家創(chuàng)造了空間,。Bassett 說,這家公司雇請了對商業(yè)或研究與發(fā)展有興趣的科學(xué)家,,站在商業(yè)的角度上來看,,他們既掌握有基因組學(xué)知識,同時又對商業(yè)上,,像市場,,產(chǎn)品管理,或銷售等感興趣,;從研究與發(fā)展角度來說,,Bassett 和他的同事需要那些想混合計算機背景(計算,數(shù)學(xué)或統(tǒng)計學(xué))與生物學(xué)分析的人們,。"我們?yōu)樘囟ㄉ飳W(xué)目的建立應(yīng)用軟件,,"Bassett 說,"我們團隊的許多成員在都受過生物學(xué),,統(tǒng)計學(xué)和商業(yè)軟件發(fā)展方法學(xué)的訓(xùn)練,。"
在基因組學(xué)繼續(xù)擴張它的影響"勢力范圍"的同時,這個領(lǐng)域的科學(xué)家將會繼續(xù)看見其在各學(xué)科的整合和更大的團隊的組建聯(lián)手解決問題,。"作為一個高水平的科學(xué)家將會發(fā)現(xiàn)能在工業(yè)中得到無限的成功,,"Bassett 說,"如果有毅力和欲望在團隊環(huán)境中工作的話,。