生物谷報道：侏羅紀(jì)公園不再是構(gòu)想﹐科學(xué)家利用電腦重建了哺乳動物祖先的部分基因組。
科學(xué)家無法可靠地研究超過五萬年老的DNA,。為了研究更古老的DNA﹐科學(xué)家必須借助電腦,。這個方法過去成效有限﹐因?yàn)榭茖W(xué)家沒有現(xiàn)生生物基因組的足夠資訊,。而大部分的演算法也有個局限﹐就是只考慮一種突變－－堿基替換。不過現(xiàn)在終于有了幾種哺乳動物的基因組序列﹐如人類,、小鼠和大鼠﹐黑猩猩和狗的基因組定序也正在進(jìn)行當(dāng)中,。而電腦演算法也開始考慮其他突變﹐如堿基插入和丟失。
圣塔克魯茲加州大學(xué)的David Haussler等人打算測試演算出的基因組究竟有多可靠﹐于是他們建構(gòu)了一個原始哺乳動物DNA﹐并利用電腦模擬其演化過程﹐產(chǎn)生其后代的DNA序列,。然后他們再利用這些后代回推其祖先﹐結(jié)果演算出的祖先序列有98%的正確率,。
當(dāng)他們得知這個方法很管用之后﹐就用它來利用真實(shí)哺乳動物的DNA序列來建構(gòu)祖先的基因組。他們挑選了19種現(xiàn)生哺乳動物﹐包括豬,、人和大鼠等﹐并演算出七千萬年前我們小如鼠的共同祖先之部分基因組,。該小部分基因組含有十個基因。結(jié)果建構(gòu)出來的基因組顯示﹐人類丟失了11%的堿基﹐而老鼠則失去了39%,。這有可能是因?yàn)槔鲜蟮氖来浅,？飑o累積的突變也較多（http://www.bioon.com/）。
原文：
Blanchette M., et al. Reconstructing large regions of an ancestral mammalian genome in silico. Genome Res. , 14. 2412 - 2423 (2004).
