由中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所胡松年研究員和中國(guó)科學(xué)院海洋研究所王廣策研究員共同主持的“壇紫菜大規(guī)模測(cè)序和生物信息學(xué)分析”研究項(xiàng)目日前取得重大進(jìn)展。
項(xiàng)目組選取我國(guó)特有的海藻栽培品種——壇紫菜作為研究對(duì)象,,構(gòu)建了其絲狀孢子體cDNA文庫(kù),,隨機(jī)測(cè)序了11,000個(gè)克隆,,獲得了EST(表達(dá)序列標(biāo)簽)數(shù)據(jù),,其中有近4000條EST序列提交到了國(guó)際基因數(shù)據(jù)庫(kù)(GenBank)。通過(guò)對(duì)壇紫菜EST數(shù)據(jù)庫(kù)的生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了一些重要的基礎(chǔ)代謝過(guò)程和獨(dú)特的產(chǎn)物合成途徑,。
這是我國(guó)首次對(duì)海藻基因組進(jìn)行的大規(guī)模測(cè)序,。本項(xiàng)目的完成極大的豐富了海洋藻類基因信息數(shù)據(jù)庫(kù),為經(jīng)濟(jì)海藻分子育種學(xué)和海藻藥物基因組學(xué)的研究奠定了雄厚的基礎(chǔ),,標(biāo)志著我國(guó)的海洋藻類基因組學(xué)研究進(jìn)入了一個(gè)新的發(fā)展階段,。