線粒體在細(xì)胞的生命活動(dòng)過(guò)程中承擔(dān)了重要的功能,。線粒體DNA突變所導(dǎo)致的線粒體代謝缺陷往往會(huì)引發(fā)線粒體疾病,,癥狀非常復(fù)雜,,發(fā)病率也較高。由于線粒體DNA編碼的基因和核基因存在互作效應(yīng),,且翻譯密碼子存在差異,,如何有效界定線粒體DNA突變是否具有致病性是一個(gè)難題。目前,,對(duì)病人的線粒體全基因組進(jìn)行分析,,并對(duì)檢測(cè)到的突變做進(jìn)化保守性分析和數(shù)據(jù)庫(kù)查詢是現(xiàn)在廣泛使用的研究方法。
由于種種人為的原因,,尤其是未認(rèn)識(shí)到現(xiàn)有的一些數(shù)據(jù)庫(kù)的不足,,研究者往往僅對(duì)MITOMAP數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行突變的查新。這種片面的方式導(dǎo)致的結(jié)果是越來(lái)越多“新的mtDNA突變”被報(bào)道,,而事實(shí)上該突變很可能早在數(shù)年或數(shù)十年前就已經(jīng)被發(fā)現(xiàn),。基于這種狀況,,姚永剛博士與德國(guó)Hans-Jürgen Bandelt教授,、西班牙Antonio Salas博士和英國(guó)的Robert W. Taylor教授進(jìn)行了一項(xiàng)合作研究工作。他們通過(guò)對(duì)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的“新的突變”和人為設(shè)定的線粒體DNA區(qū)段中各個(gè)位點(diǎn)的突變情況進(jìn)行了大量檢索分析,,發(fā)現(xiàn)單純采用MITOMAP數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)確定新突變存在很大的問(wèn)題,。另外,采用系統(tǒng)發(fā)育分析方法,,他們還對(duì)近期報(bào)道的一個(gè)突變的致病性進(jìn)行了重新分析和評(píng)估,,并以此為例細(xì)致闡述了數(shù)據(jù)的分析過(guò)程。
為避免在以后的研究中繼續(xù)出現(xiàn)類似錯(cuò)誤,,他們建議從以下三個(gè)方面對(duì)“新發(fā)現(xiàn)的”線粒體DNA突變進(jìn)行確證:1) 充分查詢現(xiàn)有專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)如MITOMAP,、mtDB等;2)應(yīng)用互聯(lián)網(wǎng)搜索引擎檢索相關(guān)突變和文獻(xiàn)信息,;3)結(jié)合報(bào)道的數(shù)據(jù),,對(duì)發(fā)現(xiàn)的突變進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析,評(píng)估其致病的可能性,。
該研究工作近期在線發(fā)表于國(guó)際知名刊物《人類突變》(Human Mutation)(2007年影響因子6.273),。在審稿過(guò)程中受到國(guó)際同行的高度評(píng)價(jià),認(rèn)為“This is a very instructive paper, which addresses a major problem that at the moment is generally restricted to mtDNA studies, but unfortunately could easily become an undesired feature of nuclear DNA studies too”,。(生物谷Bioon.com)
生物谷推薦原始出處:
Human Mutation,,10.1002/humu.20846,Hans-Jürgen Bandelt, Yong-Gang Yao