線粒體在細胞的生命活動過程中承擔(dān)了重要的功能,。線粒體DNA突變所導(dǎo)致的線粒體代謝缺陷往往會引發(fā)線粒體疾病,癥狀非常復(fù)雜,發(fā)病率也較高,。由于線粒體DNA編碼的基因和核基因存在互作效應(yīng),,且翻譯密碼子存在差異,如何有效界定線粒體DNA突變是否具有致病性是一個難題,。目前,,對病人的線粒體全基因組進行分析,并對檢測到的突變做進化保守性分析和數(shù)據(jù)庫查詢是現(xiàn)在廣泛使用的研究方法,。
由于種種人為的原因,,尤其是未認識到現(xiàn)有的一些數(shù)據(jù)庫的不足,研究者往往僅對MITOMAP數(shù)據(jù)庫進行突變的查新,。這種片面的方式導(dǎo)致的結(jié)果是越來越多“新的mtDNA突變”被報道,,而事實上該突變很可能早在數(shù)年或數(shù)十年前就已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)?;谶@種狀況,,姚永剛博士與德國Hans-Jürgen Bandelt教授、西班牙Antonio Salas博士和英國的Robert W. Taylor教授進行了一項合作研究工作,。他們通過對相關(guān)文獻報道的“新的突變”和人為設(shè)定的線粒體DNA區(qū)段中各個位點的突變情況進行了大量檢索分析,,發(fā)現(xiàn)單純采用MITOMAP數(shù)據(jù)庫來確定新突變存在很大的問題。另外,,采用系統(tǒng)發(fā)育分析方法,,他們還對近期報道的一個突變的致病性進行了重新分析和評估,并以此為例細致闡述了數(shù)據(jù)的分析過程,。
為避免在以后的研究中繼續(xù)出現(xiàn)類似錯誤,,他們建議從以下三個方面對“新發(fā)現(xiàn)的”線粒體DNA突變進行確證:1) 充分查詢現(xiàn)有專業(yè)數(shù)據(jù)庫如MITOMAP、mtDB等,;2)應(yīng)用互聯(lián)網(wǎng)搜索引擎檢索相關(guān)突變和文獻信息,;3)結(jié)合報道的數(shù)據(jù),對發(fā)現(xiàn)的突變進行系統(tǒng)發(fā)育進化分析,,評估其致病的可能性,。
該研究工作近期在線發(fā)表于國際知名刊物《人類突變》(Human Mutation)(2007年影響因子6.273)。在審稿過程中受到國際同行的高度評價,,認為“This is a very instructive paper, which addresses a major problem that at the moment is generally restricted to mtDNA studies, but unfortunately could easily become an undesired feature of nuclear DNA studies too”,。(生物谷Bioon.com)
生物谷推薦原始出處:
Human Mutation,10.1002/humu.20846,,Hans-Jürgen Bandelt, Yong-Gang Yao