美國(guó)科學(xué)家通過(guò)將人類基因組分成數(shù)百萬(wàn)個(gè)片段并重新排列組合,，成功描繪出清晰度和分辨率最高的基因組三維圖像。
近日,，美國(guó)科學(xué)家通過(guò)將人類基因組分成數(shù)百萬(wàn)個(gè)片段并重新排列組合,，成功描繪出清晰度和分辨率最高的基因組三維圖像。該圖是引人入勝的分形體圖像,，這種技術(shù)能幫助科學(xué)家探索基因組的形狀而不僅僅是其DNA含量對(duì)人類進(jìn)化和疾病的影響,。
多年以來(lái)，中,、美,、日、德,、法,、英等國(guó)科學(xué)家始終致力于人類基因組圖譜的研究。能夠更加清晰準(zhǔn)確地描繪人類基因組構(gòu)造,，說(shuō)明生命科學(xué)已經(jīng)發(fā)展到了更深的階段,，將推動(dòng)基因組測(cè)序工作、功能基因的研究和基因技術(shù)的應(yīng)用,，從而推動(dòng)整個(gè)生物技術(shù)的發(fā)展,，也將對(duì)科技發(fā)展、經(jīng)濟(jì)發(fā)展以及整個(gè)社會(huì)產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響,。
“很明顯染色體的三維結(jié)構(gòu)是調(diào)控基因組的關(guān)鍵因素,，” 馬薩諸塞大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)家約伯-戴克說(shuō)：“清晰的三維圖像將有助于了解基因調(diào)節(jié)方面的更多信息，而且肯定會(huì)帶來(lái)一系列新的疑問(wèn),。”
根據(jù)經(jīng)典生物學(xué)教科書(shū)的描述以及人們的共識(shí),，人類基因組就像23對(duì)染色體捆綁在一起的很多DNA和蛋白質(zhì)，每一個(gè)細(xì)胞核內(nèi)部都按照X形狀緊密排列,。但只有細(xì)胞將要分裂的時(shí)候才是這樣,，而其他時(shí)間，染色體排列更加緊密,，并不斷移動(dòng),。當(dāng)然它們的DNA鏈也是聚集在一起的，假如基因組從頭到尾拉長(zhǎng)的話，其長(zhǎng)度可達(dá)6英尺,。
數(shù)十年來(lái),，許多細(xì)胞生物學(xué)家認(rèn)為人類基因組的緊密結(jié)構(gòu)并不僅僅是一種有效的儲(chǔ)存構(gòu)造，而且與其基因功能和相互作用息息相關(guān),。然而這很難去驗(yàn)證：一旦基因組形狀遭到破壞,，電子顯微鏡將無(wú)法觀測(cè)到它活躍的表面。盡管已經(jīng)了解人類基因組的組成部分,，但其實(shí)際形狀始終是一個(gè)謎團(tuán),。
四月份，一篇有關(guān)基因在接近染色體時(shí)的活動(dòng)模式的論文發(fā)表于“美國(guó)國(guó)家科學(xué)院學(xué)報(bào)”,，提供了關(guān)于基因組形狀功能的有史以來(lái)最有說(shuō)服力的證據(jù),，盡管當(dāng)時(shí)研究者描繪的基因圖清晰度并不高。而本周四發(fā)表于“科學(xué)”雜志的最新圖譜則要詳盡得多,。
“這將改變?nèi)藗冄芯咳旧w的方式,，就如同打開(kāi)了神秘的黑匣子。我們以前不知道它們的內(nèi)部構(gòu)造,，現(xiàn)在則能夠高清晰地進(jìn)行觀察,，努力研究基因結(jié)構(gòu)與基因活力的關(guān)系，并探索細(xì)胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)的變化,。”戴克說(shuō),。
為了在無(wú)法直接觀察的情況下確定基因組的結(jié)構(gòu)，科學(xué)家最初將細(xì)胞核浸泡在甲醛溶液中,，使其與DNA相互作用,。甲醛將基因鏈上相互分離而在三維空間相互鄰近的基因緊密粘合在一起。然后科學(xué)家添加一種化學(xué)藥劑將緊緊排列在一起的基因鏈分解,，但完整保留了甲醛鏈接,。結(jié)果顯示許多基因都是成對(duì)排列，仿佛一個(gè)凍住的面條球,，被分切成一百多萬(wàn)層碎片并混合在一起,。
通過(guò)對(duì)基因?qū)Φ难芯浚茖W(xué)家分辨出在最初的基因組中那些基因是互相鄰近的,。利用軟件分析技術(shù),，科學(xué)家制作了一個(gè)基因組的數(shù)字雕像,，那可是一個(gè)巧奪天工的作品,。
“其中沒(méi)有任何結(jié)點(diǎn)，也沒(méi)有任何地方纏在一起,。就像很多面條不可思議地緊密排成一個(gè)大球,，但是你能夠?qū)⒛承┟鏃l抽出或者再放回去，卻根本不會(huì)破壞它的結(jié)構(gòu)。”哈佛大學(xué)計(jì)算生物學(xué)家埃雷斯-列伯南說(shuō),。
從數(shù)學(xué)角度看,，這些基因組片段按照接近于希耳伯特曲線的方式排列。希爾伯特曲線一種不經(jīng)任何交叉和重疊而能填充滿一個(gè)平面正方形,、繼而以同樣方式填充滿一個(gè)三維圖形的分形曲線(空間填充曲線),，由大衛(wèi)-希爾伯特在1891年提出。
研究者還發(fā)現(xiàn)染色體劃分為兩個(gè)區(qū)域,，一個(gè)區(qū)域是活躍的基因,，另一個(gè)是不活躍的基因，而不相交疊的彎曲結(jié)構(gòu)使基因能夠輕易在兩個(gè)區(qū)域間自由移動(dòng),。
科學(xué)家希望了解基因組形態(tài)如何變化的,。這種變化會(huì)在干細(xì)胞變成成熟細(xì)胞過(guò)程中不斷發(fā)生。“在各種細(xì)胞類型結(jié)構(gòu)中會(huì)發(fā)生多少變異,？什么在控制著變異出現(xiàn),？變異到底有多重要？這些我們都還沒(méi)搞清楚,。”戴克說(shuō)：“這可是一個(gè)嶄新的科學(xué)領(lǐng)域,。”（生物谷Bioon.com）
