測序在生命科學(xué)研究中一直發(fā)揮著重要作用。以Sanger法（雙脫氧核苷酸末端終止法）為代表的第一代測序技術(shù)幫助人們完成了從噬菌體基因組到人類基因組圖譜等大量測序工作,，但由于其存在成本高,、速度慢、通量低等不足,，并不是后基因組時(shí)代最理想的測序方法,。

進(jìn)入21世紀(jì)后，以Roche 454,、Illumina Solexa和ABI SOLiD為代表的第二代測序技術(shù)誕生了,，并迅速掀起了你追我趕的技術(shù)比拼高潮。2010年,，Illunima和ABI先后發(fā)布新款測序儀,，改進(jìn)了原有機(jī)型，測序通量不斷提升,，測序成本不斷降低,，現(xiàn)在已經(jīng)進(jìn)入了數(shù)千美元測一個(gè)人全基因組的時(shí)代。

第二代測序技術(shù)進(jìn)展

1. Roche 454測序技術(shù)

454公司可謂第二代測序技術(shù)的奠基者,。2005年底,，454公司推出了革命性的基于焦磷酸測序法的高通量基因組測序系統(tǒng)--Genome Sequencer 20 System。這一技術(shù)的建立開創(chuàng)了邊合成邊測序（sequencing by synthesis）的先河,，被nature雜志以里程碑事件報(bào)道,。之后，454公司被羅氏診斷公司以1.55億美元收購,。一年后,，他們又推出了性能更優(yōu)的第二代基因組測序系統(tǒng)--Genome Sequencer FLX System（GS FLX）。2008年10月,，Roche 454在不改變機(jī)器的情況下,，推出了全新的測序試劑--GS FLX Titanium，全面提升了測序的準(zhǔn)確性,、讀長和測序通量,。

目前，Roche 454 GS FLX Titanium每次運(yùn)行能產(chǎn)生100萬條序列,，平均讀長能達(dá)到400nt,，且第400個(gè)堿基的準(zhǔn)確率能達(dá)到99%。一次運(yùn)行所需時(shí)間為10小時(shí),，能獲得4-6億個(gè)堿基的序列信息,。

2. Illumina Solexa測序技術(shù)

Illumina公司的第二代測序儀最早由Solexa公司研發(fā)，利用其專利核心技術(shù)"DNA簇"和"可逆性末端終結(jié)（reversible terminator）",，實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化樣本制備和大規(guī)模并行測序,。Illumina公司于2007年初花費(fèi)6億美金巨資收購了Solexa,。2010年初，Illumina將其第二代測序儀Genome Analyzer IIx升級(jí)到HiSeq 2000,。

HiSeq 2000含有兩張F(tuán)low cell,，可同時(shí)運(yùn)行或者只運(yùn)行其中一張。讀長為100nt,，同時(shí)支持Fragment,、Pair-end和Mate-Paired文庫。每次運(yùn)行最多可產(chǎn)生200 GB的數(shù)據(jù)量（讀長為2x100nt）,。

Solexa測序技術(shù)路線：

3. ABI SOLiD測序技術(shù)

過去20年,，美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司（ABI）在一代測序方面一直占據(jù)著壟斷地位。第二代測序技術(shù)出現(xiàn)以來,，ABI公司不甘落后,，迅速趕上，于2007年底推出了SOLiD 第二代測序平臺(tái),。2010年末又發(fā)布了最新產(chǎn)品--SOLiD 5500xl測序平臺(tái),。從SOLiD到如今的SOLiD 5500xl，短短三年時(shí)間,，連升五級(jí),，發(fā)展速度驚人。