一旦發(fā)生未知細(xì)菌感染性疾病流行,我國(guó)將有快速篩查技術(shù)予以應(yīng)對(duì),。近日完成的一項(xiàng)“十五”國(guó)家科技攻關(guān)課題,研究人員成功建立了未知細(xì)菌快速篩查技術(shù)體系,,他們以16SrRNA序列分析為基礎(chǔ),,采取毒力和毒素基因鑒定方法,能夠直接使用臨床標(biāo)本,,在最短的時(shí)間內(nèi)鑒定未知或不可培養(yǎng)的細(xì)菌,,對(duì)細(xì)菌性新發(fā)傳染病做出準(zhǔn)確判定。
課題負(fù)責(zé)人,、中國(guó)CDC傳染病預(yù)防控制所徐建國(guó)教授介紹,,傳統(tǒng)的細(xì)菌培養(yǎng)方法已不能適應(yīng)新發(fā)傳染病應(yīng)急處置的需要,而以序列分析為基礎(chǔ),,結(jié)合表現(xiàn)型分析的鑒定方法,,是細(xì)菌學(xué)檢測(cè)和鑒定的發(fā)展方向。由于16srRNA序列在所有的細(xì)菌種都存在,能夠滿足進(jìn)行比較的要求,,因此課題組選擇該序列的分析方法作為鑒定細(xì)菌的基礎(chǔ),。
經(jīng)過(guò)兩年攻關(guān),科研人員建立了相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)和臨床標(biāo)本細(xì)菌檢測(cè)體系,,建立了細(xì)菌毒力島和毒素基因檢測(cè)芯片,,建立了重要致病細(xì)菌毒素和毒力島基因的二級(jí)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)及分析軟件。其中細(xì)菌16SrDNA保守核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)屬國(guó)際首創(chuàng),,細(xì)菌毒力島和毒素基因檢測(cè)芯片屬國(guó)內(nèi)首創(chuàng),。該技術(shù)是將臨床標(biāo)本處理后,使用細(xì)菌16srRNA的通用引物,,直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增,、克隆和測(cè)序。然后將獲得的16srRNA序列,,與已經(jīng)發(fā)表的序列進(jìn)行比較,,同時(shí)進(jìn)行毒力和毒素基因的檢測(cè)和篩查,從而在新的細(xì)菌性傳染病出現(xiàn)時(shí),,快速做出病原學(xué)篩查和判定,。
徐建國(guó)強(qiáng)調(diào),上述病原菌篩查體系,,雖然能夠用于未知的細(xì)菌檢測(cè)(其他方法只能檢測(cè)已知細(xì)菌基因),,但費(fèi)用較高,需要時(shí)間較長(zhǎng),,不適合于常規(guī)使用,,應(yīng)主要適合于不明原因的細(xì)菌性傳染病疫情調(diào)查和研究。