基因組不穩(wěn)定——染色體重排或者染色體數(shù)量異常——是許多人類癌癥的特征,。盡管基因組不穩(wěn)定的原因已經(jīng)在許多遺傳性癌癥中確立，但其過程和癌癥相關(guān)基在偶發(fā)性癌癥中的起源基本上仍然是未知地帶,。最近匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究人員說,，他們能夠利用重組腺相關(guān)病毒（recombinant adeno-associated virus），這種被廣泛用于基因治療實驗的病毒,，尋找散發(fā)性癌癥中引發(fā)基因組不穩(wěn)定的潛在原因,，這一成果公布于5月30日－6月3日在華盛頓州會議與商貿(mào)中心(Washington State Convention and Trade Center)舉行的第10屆美國基因治療協(xié)會年會上。
重組腺相關(guān)病毒（rAAV）是將基因遞送到細(xì)胞的有力載體,，這些病毒或載體,，不止在人類基因治療領(lǐng)域引起廣泛關(guān)注，而且在多種人類疾病研究中,，是在靶標(biāo)細(xì)胞表達(dá)目的基因的有力工具,。目前，外周靜脈rAAV注射法,，能夠100％在小鼠器官靶細(xì)胞中表達(dá)目的基因,。
最新研究證實rAAV只能插入宿主染色體中DNA傾向于斷裂的位點。由匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子遺傳學(xué)和生化副教授Hiroyuki Nakai博士率領(lǐng)的研究小組,，最近建立了一套大規(guī)模分離非分化細(xì)胞中rAAV整合位點的新方法,，并利用這種方法鑒定出小鼠肝臟、骨骼肌和心臟中大約1000個整個位點,，繪制了小鼠基因組945個rAAV整合位點,。Nakai博士與其同事發(fā)現(xiàn)30％以上的整合事件發(fā)生在DNA回文區(qū)。一系列生物信息學(xué)分析和統(tǒng)計學(xué)分析結(jié)果揭示,，這些傾向于斷裂的回文在基因組中很普遍,，但只有特定位點的回文易于斷裂。
Nakai博士說，發(fā)現(xiàn)rAAV可以選擇性鑒別有斷裂傾向的回文,，對全基因組規(guī)模研究活體動物各種組織或人類細(xì)胞中這種自然發(fā)生的DNA序列提供了空前的機(jī)會,。“我們的發(fā)現(xiàn)證實適度規(guī)模的DNA回文是DNA斷裂普遍、重要的原因,，而DNA斷裂有可能威脅哺乳動物基因組的完整性,。更為重要的是，它們對弄清癌癥和衰老的可能機(jī)制有重要價值,。”
