基因組不穩(wěn)定——染色體重排或者染色體數(shù)量異常——是許多人類癌癥的特征,。盡管基因組不穩(wěn)定的原因已經(jīng)在許多遺傳性癌癥中確立,但其過程和癌癥相關基在偶發(fā)性癌癥中的起源基本上仍然是未知地帶,。最近匹茲堡大學醫(yī)學院研究人員說,,他們能夠利用重組腺相關病毒(recombinant adeno-associated virus),這種被廣泛用于基因治療實驗的病毒,,尋找散發(fā)性癌癥中引發(fā)基因組不穩(wěn)定的潛在原因,,這一成果公布于5月30日-6月3日在華盛頓州會議與商貿(mào)中心(Washington State Convention and Trade Center)舉行的第10屆美國基因治療協(xié)會年會上。
重組腺相關病毒(rAAV)是將基因遞送到細胞的有力載體,,這些病毒或載體,,不止在人類基因治療領域引起廣泛關注,而且在多種人類疾病研究中,,是在靶標細胞表達目的基因的有力工具,。目前,外周靜脈rAAV注射法,,能夠100%在小鼠器官靶細胞中表達目的基因,。
最新研究證實rAAV只能插入宿主染色體中DNA傾向于斷裂的位點。由匹茲堡大學醫(yī)學院分子遺傳學和生化副教授Hiroyuki Nakai博士率領的研究小組,,最近建立了一套大規(guī)模分離非分化細胞中rAAV整合位點的新方法,,并利用這種方法鑒定出小鼠肝臟、骨骼肌和心臟中大約1000個整個位點,,繪制了小鼠基因組945個rAAV整合位點,。Nakai博士與其同事發(fā)現(xiàn)30%以上的整合事件發(fā)生在DNA回文區(qū)。一系列生物信息學分析和統(tǒng)計學分析結果揭示,,這些傾向于斷裂的回文在基因組中很普遍,,但只有特定位點的回文易于斷裂。
Nakai博士說,,發(fā)現(xiàn)rAAV可以選擇性鑒別有斷裂傾向的回文,,對全基因組規(guī)模研究活體動物各種組織或人類細胞中這種自然發(fā)生的DNA序列提供了空前的機會。“我們的發(fā)現(xiàn)證實適度規(guī)模的DNA回文是DNA斷裂普遍,、重要的原因,,而DNA斷裂有可能威脅哺乳動物基因組的完整性。更為重要的是,,它們對弄清癌癥和衰老的可能機制有重要價值,。”